【医学】最大のたんぱく質の構造解明　感染症・がん新薬に期待

　兵庫県立大、大阪大のグループは、生物の細胞内で最大のたんぱく質「ボルト」の
構造を大型放射光施設スプリング８（兵庫県佐用町）で解明した。ボルトは細菌に
対する免疫や、抗がん剤が効かなくなる仕組みに関係しており、治療薬の開発に
応用が期待される。１６日付の米科学誌サイエンスで発表する。

　ボルトは１９８６年にネズミの肝臓から発見されたラグビー型の輪郭をもつたんぱく質。
脊椎（せきつい）動物などの細胞内にある。分子量は一般的なたんぱく質の１００〜
１千倍ほどにあたる約１千万で、知られている細胞内のたんぱく質としては最大で、
詳しい形はなぞだった。

　兵庫県立大の月原冨武特任教授らは、スプリング８の非常に強いＸ線を１分間
あてることで構造を解明した。ひも状の分子が上下３９本ずつ計７８本寄り集まり、
つるを編み込んだ籐籠（とうかご）のような形になっていた。

　ボルトは、人間が緑膿菌（りょくのうきん）に感染したとき、体内の免疫が菌を
殺すのを助ける。また、複数の抗がん剤が効かない多剤耐性のがん細胞は、
ボルトの部品であるひも状分子を大量につくることが知られている。今回、構造が
特定されたことで、ボルトの機能の研究が進み、感染症やがんの治療効果を
高める薬の開発に結びつくと期待されるという。

構造が分かった巨大たんぱく質のイメージ図＝兵庫県立大提供
　　http://www.asahi.com/science/update/0115/images/OSK200901150087.jpg

ソース : asahi.com
　　http://www.asahi.com/science/update/0115/OSK200901150083.html

大阪大のSX-8Rを使ってるのかね

さっさと癌の遺伝因子を公開しろや
生命保険が破産するからしないとかふざけてるのか

すごいすごい

多剤耐性のがん細胞（笑）

タミフル耐性ウイルス（笑）

BOINCってまだやってるの？

こういうのはＸ線での測定結果を入力としてプログラムに与えれば自動的に出るのか？
計算にどれぐらい時間がかかるんだ？

ボニックかと思ったらボインクだった

＞ボルトは１９８６年にネズミの肝臓から発見されたラグビー型の輪郭をもつたんぱく質。

ラグビー型って、すごいな。
ラグビーコート状のタンパク質の上で各々15タンパク質で構成される2チーム状のタンパク質が
楕円形のタンパク質を奪い合う輪郭のタンパク質か。

レス見てて思うんだが、みんな頭いいのね。おれが無知？

>>7
これ、Ｘ線結晶構造解析だろ。
タンパク質の結晶作るのに５年位かかって、計算にも２年はかかってるんじゃないか？
自動計算ソフトも開発されてるけどまだまだ無理。

過疎板だし、興味ある人だけが集まれば詳しくもなる。
ただし、野次馬で来た自分にはさっぱりだが・・・・・・

最大のタンパクってこれだったっけ？
違う名前だったような
新しいのが見つかったのかな？

>>11
おお、そんなにかかるのか・・・

結晶つくるのに５年ていうのは、
一回の試行に五年かかるのか、
それとも試行の失敗を繰り返して五年はかかっただろう、ってこと？

計算に２年かかるとして、そのうち計算機まわしてるのがどれくらい？

サイエンスにのるのか
すばらしい

>>14
試行の失敗の繰り返しだろ。
結晶を作れなかったか、作れたとしても測定に適さないか、のどちらか。

計算機回す時間はそれほどでもない。
ぶっちゃけ、メモリさえ足せばちょっとしたゲーム用PCとかで十分計算できるレベル。
それよりも、モニタの前で構造を組む仕事が未だ手作業だったりするんで、
そっちに時間がかかる。
構造を少しだけ組んでは計算回し、
出てきた結果の構造にさらに次の構造を少し付け足して計算回しの繰り返し。

>>16
「構造を組む」ていうのは、
「このアミノ酸配列ならこんな構造してるのかな？」ていう推測で３次元の構造をつくってみて、
で、その構造にもとづいて計算させた結果を、
Ｘ線解析の結果と照らし合わせてチェックていう感じ？

>>17
大体そんな感じ。

すまん、推測で構造を置くことは滅多にない。
構造をおけた部分の近くしかはっきりしないので、
一気に構造を組むことができない。

ラマン神「俺に分光させれば一発だったのにな」
NMR神「ラマンごときが笑わせるなよ」
X線「図が高いぞ、オマエら」

>>20
EPRも入れてあげてください。

月原さんは阪大定年後は兵庫県立に移ったのね。

>>20
ab initio神「ところで俺の電子軌道、どう思う？」

>>17-18
すげーな。知識と忍耐がいるな。

>>10
分かって当然。
２ちゃんはみんな東大京大だもん。

>>24
岡崎分子研と阪大淡白研と姫路Spring8の事も
たまには、ほんのたまには、思い出してあげてください。

>>25
SPring-8って姫路じゃないんだけどなー
あそこらへんに住んでる人は姫路って見栄張るけど

結晶化に5年て（書いてないけど）普通じゃね。
結晶化で修士ノーデータなんてざらだし・・・
どうやって精製したんだ？

そうなんだー。
全然関係ない専攻の俺から見ると、気の遠くなるような忍耐を要求される世界だな。

結晶化出来ないタンパク質は構造決められないからな、flexibleなN末端をもつやつとか
C側だけ発現させて結晶化して構造きめた論文もごまんとある。
でも活性をもってるのはNなのにNは全然分からないなんてのはどれくらい意味があるのか・・・

自分も大学院で結晶化やってたけど、しんどい
pH，塩，沈殿剤、いろんな条件を変えて作る。（そういうキットはある程度売ってる）
たんぱく質も大量に必要なので、精製も忙しいし

まぁ、結局海外のラボに先を越されてしまったけどな

>>27
Scienceから論文ダウソしてみたら、
精製方法は別の論文ってSupporting infoに書いてあったorz

で、その論文には、
精製は遠心しかやってないように読める。意外に簡単くさい。
それよりも、たんぱく質の調達源がラットの肝臓になってる件について。
ここまでデカイと発現系組めないのか？

７年もの歳月の間に…この論文のためにどんだけのラットが死んだのかな…

「もの精製して、結晶化して、構造解く」だけの構造屋バブルはいつはじけるのですか？

>>32
構造わかったら、創薬などに役立つと思うが？
タミフルのように

癌完治療薬なんて医療関係者にしたら両刃の剣だからな
もしかしたら開発されているかも（謎

よく結晶化できたな
神技じゃねーか？

メタミドホス検出以外に使い道があったとは…目から鱗です。

結晶構造だけじゃあな・・・

創薬詐欺の方々ですか？(´･ω･`)

>>9
ﾜﾛｽ

vaultはカタカナではヴォールトだと思うがな

たんぱく質の構造解析はいちいち原子間の距離を測定しなきゃいけないし
形や数も特定しないといけない、最大サイズとなると時間と根気が要求されるが

構造からくっつきやすい物質を推定して活動停止させれば治療もできるから
細菌に対する免疫や抗がん剤が効かなくなる仕組みを解明できる
それだけ意味があるニュースだな

すごいすごいぞ医学

ガサラキ作れ