【薬学】SARS Virus増殖関与物質の予測構造公開・治療薬開発加速へ＝北里大等[030512]

北里大など、ＳＡＲＳウイルスのタンパク質立体構造を初予測

　北里大学薬学部の梅山秀明教授らと、日本ＳＧＩ（東京都渋谷区）の研究グループは
12日、世界的に被害が拡大している新型肺炎「重症急性呼吸器症候群」（ＳＡＲＳ）
ウイルスの増殖に関与するタンパク質の立体構造を世界で初めて予測したと発表した。
ホモロジーモデリングという手法をもとに梅山教授が開発したタンパク質立体構造予測
ソフトウエアを使った。成果を無償でネット上で公開した。研究グループは、ＳＡＲＳの
ワクチンや治療薬の開発が大幅に加速されると期待している。

（中略）

　ともにウイルスの増殖に必要な酵素。立体構造を情報を利用して、この酵素の阻害剤を
開発すれば、ワクチンや治療薬の開発が加速するとみている。

　なおこの成果は、梅山教授らが設立したベンチャー企業、インシリコサイエンスの
ホームページ（http://www.pd-fams.com）で無償で公開している。

（後略）
----
※引用元配信記事：http://www.jij.co.jp/news/bio/art-20030512193612-CLBQJSGLEY.nwc
※日本工業新聞のJIJweb（ http://www.jij.co.jp/ ）2003/05/13配信
----
※関連スレッド

【SARS】「重症急性呼吸器症候群」総合スレッド★4
http://news2.2ch.net/test/read.cgi/newsplus/1052748161/

２

ガンバれ北里

詳しいことがわからないのでなんとも言えないが、
ラモスが悪いと思う。

↓ウイルスくん

ところで「日本SGI」って、創価学会インターナショナルの「SGI」？

皆で違う方向行ってたってことおきないよね？

SGIってマダWS作ってる？

これも田中さんの開発したモンが役立ってんのね

今日テレビで「最近はクスリはコンピュータで作る」みたいなことを
言ってたような気がするけど、こういう作業のことなのかな。

>>6
Silicon Graphics, Inc.
日本SGIのサイトにものってた
ttp://www.sgi.co.jp/newsroom/press_releases/2003/may/sars.html

東大・京大・阪大・東北大・九大・名大・北大・東工大・一橋大・筑波大・神戸大・広島大・千葉大・金沢大・東京医科歯科大

北里大よくやった！
最近、海外で日本の評判が落ちまくってるから、ここで一発逆転じゃ！

>>11　ありがとう。礼は言わんぞ。

>>14
なんだぁ、その態度は！！　どういたしまして

これって、白血病やSETIみたいなグリッドのやつ？
SGIが協力して、って前にスレ立ってなかった？

これでもやっておちつこうや
http://www.v-gene.com/rescue/otatataki/otatataki.cgi

この分野では発表ばかりでなんの成果も上げられないのが日本。
黙って聞き流せよ。治療に役立つことは100%無いから。

と云ふより、ｽﾚﾈﾀ自体が売名行為に過ぎず利用価値がない。

>>19
「売名行為」という点については、なんとなく分かりますが、
「利用価値がない」というのは何故ですか？公開された「構造」が嘘八百？

ただいまSARSタンパク質構造を無償提供中！

と言われても薬理やってる香具師以外にはさっぱりだな。

　
ﾀｿﾊﾟｸの立体構造ﾃﾞｴﾀには既に確立したﾌｫｵﾏｯﾄがある（ﾌﾞﾙｯｸﾍｲｳﾞｿのProteinDataBank）。
しかしﾎｵﾑﾍﾟｴﾁﾞ上で公開しとるのは各１枚のゑのみ。
PDBは「必要事項（氏名・連絡先・使用目的・希望データ・電子メール・
電話番号）を全て記入の上お申し込みください」とある。
よって、「成果を無償でネット上で公開した」は大嘘。

予測ﾙｳﾁｿの委細は同ﾎｵﾑﾍﾟｴﾁﾞ上に引用してある報文参照とのことらすぃが、
構造予測は当たらうがﾊｽﾞﾚやうがｻｲｴｿｽ活動の一端であるから、
出てきた結果につひて考察を加へ、せめてｼｮｵﾄﾚﾎﾟｵﾄの形で
学術雑誌に投稿し査読を受けるべきである。
それをせぬままの情報の垂れ流しは無責任とさへ云へる。

>>22
あ、そういう意味合いですか。謝々。
「公表」されたデータそのものが「嘘八百」かと思いました。

何かSARS関連でワクチンとかの治療薬開発には世界中の頭脳が結集してる感じがして頼もしいね

応援するぜ、薬の開発宜しくお願いします。

当事国の中国医学界はあいかわらずトンチンカンでガセネタ発信してるけどな。

25げっと

早く、ワクチンつくってくらはい

＜アスペルガー症候群（自閉症スペクトラム）←脳の機能的疾患（遺伝が要因）＞
http://www.ypdc.net/asuperugar.htm
http://www.autism.jp/l-02-03-aspe3.htm
http://www.geocities.co.jp/Beautycare/5917/as/
●接し方のルールがわからず無邪気に周囲の人に対して迷惑なことをしてしまうこと
がある。人を傷つけるということには鈍感です。年配の先生に向かって「おばあさん
先生おはようございます」と明るい大声で挨拶する生徒もいる。こういった言動をす
る場合にも彼らには悪意はない。
●小さな声でひとり言を言ったり、考えていることを声に出して言うことがある。
●融通が利かないことも学校生活で問題になる。時間割の変更や突然の教師の欠勤と
いう事態で不安を感じたりかんしゃくをおこしたりする。あまりに規則に厳格なため
に、遅刻した同級生に延々と注意をしたり、修学旅行などで消灯時間をかたくなに守
り、他の生徒の顰蹙をかったりすることがある。
●行動･興味･活動のパターンが貧困で反復常同的なことも自閉症の特徴である。すな
わち、日常の活動の様々な面にわたって柔軟性のないルーティン（決まった手順や日課）
を押しつける傾向、これを慣れ親しんでいる習慣や遊びのパターンだけでなく、たいてい
は新しい活動にも押しつける。そしてルーティンや個人的な環境の細部の変化（家の中の
置物や家具の移動によるなど）に対する抵抗がみられることがある。
●揺れる木の葉を見続ける子どもは興味のレパートリーが狭いとも言え、視覚的な敏感さ
があるといっても良い。
●精神遅滞を伴うものと伴わないもので大きく分かれる。１００％果汁のオレンジジュー
スを思い浮かべてください。それにだんだん水を加えて薄めて行くと終いには水にごく近
くなる。一口飲んで「オレンジジュースだ！」とわかるものは自閉症、水に近いけれどな
にかオレンジの味が混じっているのがアスペや高機能・・。その濃度はさまざま。濃いオ
レンジジュースであったとしても早期の療育や周りの対応によって水に近づいていくこと
は可能。しかし間違えてはいけないのはオレンジジュースが一滴でも落ちている場合は
「純粋な水」にはなれないのです。

がんばで

実験的に決定したタンパク質の立体構造をもとに
ドラッグデザインを行うのも現段階では発展途上，というか年数がかかる．

この記事の場合，近縁のタンパク質の立体構造から予測した立体構造を
公開したというだけだから，肝心の活性部位の構造が正確とは言いがたく
正直使い物にならないと言っても過言ではないのです．

既出ですが宣伝の一環かと．

全国の医療従事者のみなさん！
もう、SARSは、すぐ、そこまで来てます！
常にマスク、手袋着用してください！

でないと医療期間が、感染拡大させちゃうことになりますよ！

プロテアーゼの構造がすでにドイツのグループによって発表されているんですが。。。
もちろん予測ではなく、ちゃんとX線結晶構造解析によって出されたものです。
5月13日にSCIENCEからオンラインで出ています。
www.sciencemag.org/cgi/content/abstract/1085658
酵素の構造だけではなく阻害剤との複合体構造まで出ています。
どこまで信じていいか分からない予測モデルよりも、きちんと実験で出した
構造の方がいいし、ホモログのX線構造のアミノ酸残基を置換してMDでゆさ
ぶるくらいなら各自でも出来る。
上の計算方法がどの程度の精度かはしらんけどね。
予測モデルはPDBとは別のデータベースをつくってそこに登録するように
してほしいな。

P.S. ちなみに田中さんの質量分析器は関係ありません。

はやく特効薬をつくってくらはい。
おながいしまつ。

２ちゃんねらーを本気で馬鹿にする最低なHP

http://members.tripod.co.jp/nichkirai/
http://members.tripod.co.jp/nichkirai/
http://members.tripod.co.jp/nichkirai/

しかも痛い！！！！必見！！！糞が！！！

「〜２ｃｈは犯罪ホムペ〜」

「私は、２ｃｈと２ちゃんねらーが大嫌いです」
ｇｆ

ほいほい、遺伝情報。
http://www.cdc.gov/ncidod/sars/nucleoseq.txt

ハルマゲ丼

>>33
そこの管理人の考え方でいくと

あと、２ｃｈは5，6人以上逮捕された犯罪者が居るので
２ｃｈは全員、犯罪者だと思っていいと思います。
↓
あと、大阪は5，6人以上SARS感染者が居るので
大阪＝SARSだと思っていいと思います。

SARSはとにかく手洗いうがいだね

>>31　それも相同性ﾓﾃﾞﾙ。
参考）http://book.2ch.net/test/read.cgi/bizplus/1051815004/66-67
　
>>32　表に出てをる情報によれば、ﾌﾟﾌｧｲｻﾞｧ製薬のｺｵﾄﾞ名「AG7088」と云ふ
　　　試薬を改変しるのが最短距離。
　　　ただし効果と副作用を見るのに時間がかかる。
　　　ｺﾛﾅｳﾞｧｲﾗｽの変異は早さうなので、変異で自然消滅しる可能性が大。
　　　よって、特効薬を待つよりも予防と感染者の徹底的な隔離が吉、と。