バイオインフォマティクスを教えてください

>>815
CBS逝ってみたよ。
ISMB2001開催してたとこなんだ。
良いこと知った。
ところで、試しにＧＳＴ融合タンパク質でモデル作ってみた。
予想通りＧＳＴのモデルだけを作ってくれたよ。

このサイトの自動モデリングでは大まかに
1) 鋳型構造の検索
　 　↓
2) アラインメント作成
　 　↓
3) モデル構築
って感じでやってると思う。

815が入れたやつでは 1)でタグとの相同性のある配列と
抗原との相同性のある配列が、高いスコアのあるものとして検索されたはず。
だけど、一番高いスコアの構造を鋳型として用いるので
この場合は、タグと相同性のある鋳型構造に基づいて
モデルを構築した、っていう話だと思うです。
なんか偉そうでスマソ。

>>816
北里のはFAMS。
最近、名を上げたね。
> でも基本的にモデリング法は確立してないし
基本的な方法論自体はかなり前からあります。
でも、難しいところもある。

>>819=824
何屋さん？
比較モデリングって、モデルの構築自体はとても簡単なのに
知ってる人は少ない印象があります。
日本語の文献ってあるのかな？
> 側鎖の配向を気にするのであれば、X線結晶構造解析（場合によってはNMR）
> でないと、あまり（全然とも言う？）信頼できません。
モデルってことで許してください。
簡単なものは１時間あればできるし。