バイオインフォマティクスを教えて下さい 8

いつのまにか消えていたので立ててみました。
http://www.geocities.com/tokyufubai/
1 名前：みなしごEST 投稿日：2001/05/05(土) 10:47
色々と教えてください。

669 名前：名無しゲノムのクローンさん ﾒｪﾙ：sage 投稿日：03/06/23 22:38
（前略）
それなりに異質な分野なせいなのか、断続的に新しい読者が来て、そのたびに
「今まで誰も語っていないようだが（と本人は思っている）、バイオインフォ
とやらに物申す！」みたいになるのは理系専門板的には正直つらいっす。
http://hedo.at.infoseek.co.jp/
関連スレは>>2以降

バイオインフォマティクスを教えて下さい 7
http://science3.2ch.net/test/read.cgi/life/1101069123/
バイオインフォマティクスを教えて下さい 6
http://science3.2ch.net/test/read.cgi/life/1060124095/l50

| 私たちって生物屋なのかしら？
＼＿
　　　∨￣￣￣￣￣￣￣￣￣
　 ヾ |;;::iii|/ 　　　　　　　　　ヾ.|;;;i::ii|//"ﾞ
　　　!;;::iii|　　 　　　　　　　　　!;;;;::iii|/ﾞ
　　　!::::∧＿∧　　/▼⌒⌒▼、;;;iii|〃／￣￣￣￣￣￣￣
　　　!/　ノハλ）　′ν/ハ)ヽ｜;;ii|＜ や〜ね〜。
　　　!8 ﾉ ・∀・ﾉj　|ﾉ ﾉ ｀∀´ハ;;;;;;;i|　|　SEくずれよ〜。
　　　（)O~~∀~）　ﾉ从O~~|:|~)つ;;;;;;i|　＼
　　　!::〔〕________ゝ 　 〔〕______ゝ w〃　 　 ￣￣￣￣￣￣￣￣
￣ （（　（_人´ﾉ　 === （_人´ﾉ =====

| 私たちって情報屋なのかしら？
＼＿
　　　∨￣￣￣￣￣￣￣￣￣
　 ヾ |;;::iii|/ 　　　　　　　　　ヾ.|;;;i::ii|//"ﾞ
　　　!;;::iii|　　 　　　　　　　　　!;;;;::iii|/ﾞ
　　　!::::∧＿∧　　/▼⌒⌒▼、;;;iii|〃／￣￣￣￣￣￣￣
　　　!/　ノハλ）　′ν/ハ)ヽ｜;;ii|＜ や〜ね〜。
　　　!8 ﾉ ・∀・ﾉj　|ﾉ ﾉ ｀∀´ハ;;;;;;;i|　|　研究者くずれよ〜。
　　　（)O~~∀~）　ﾉ从O~~|:|~)つ;;;;;;i|　＼
　　　!::〔〕________ゝ 　 〔〕______ゝ w〃　 　 ￣￣￣￣￣￣￣￣
￣ （（　（_人´ﾉ　 === （_人´ﾉ =====

| じゃあ、私たちって一体何なのかしら？
＼＿
　　　∨￣￣￣￣￣￣￣￣￣
　 ヾ |;;::iii|/ 　　　　　　　　　ヾ.|;;;i::ii|//"ﾞ
　　　!;;::iii|　　 　　　　　　　　　!;;;;::iii|/ﾞ
　　　!::::∧＿∧　　/▼⌒⌒▼、;;;iii|〃／￣￣￣￣￣￣￣
　　　!/　ノハλ）　′ν/ハ)ヽ｜;;ii|＜ や〜ね〜。
　　　!8 ﾉ ・∀・ﾉj　|ﾉ ﾉ ｀∀´ハ;;;;;;;i|　|　人間のクズよ〜。
　　　（)O~~∀~）　ﾉ从O~~|:|~)つ;;;;;;i|　＼
　　　!::〔〕________ゝ 　 〔〕______ゝ w〃　 　 ￣￣￣￣￣￣￣￣
￣ （（　（_人´ﾉ　 === （_人´ﾉ =====

6

>>3 >>4 >>5
さっそくかい！（藁

いきなり来てるね（W

メルヘンですな

未踏DB創造事業とか未踏サーバ創造事業とかはじまらないかな？

未踏DBとは
せっかく作成してWEBに公開しても、誰もアクセスしてくれない
DBのこと。

未踏サーバとは
せっかく作成してWEBに公開しても、(ry

わらた

>>10
どこのこと？
晒してくれ

>>10
はげわら

けど、結局検索がインフォマティシャンに廻ってきたりするなら、
いっそのこと誰も踏まな(ry

ﾊﾞｲｵｲﾝﾌｫ囓ってるものなのですが、一つ理解できてない事が
あります。

お金が久しい先生とかがでーたべーすから代謝経路の予測とか
おっしゃられてますが、データベースで出てくるクリッカブル
マップに色が付くとなんで経路が予測できるのですか？
単に既存の情報を整理しただけではないでしょうか？
お馬鹿な僕に誰か説明をお願いします。

かじる（齧る）

内容の割にめちゃ金かかってるよな。
なぜSGIをそろえなければならないのかとこい

それは、SGIにバイオ部門があるから。
とにかくJavaで、OSは何でもOKがトレンドになるなｗ

そうだね

糞研究でも何でもO.K.
年度末には税金の無駄遣い狂想曲が・・・
無駄にSGI。
例えるなら、F1で国道1号を走るようなモノ。
さらにドライバーも基地外ときた

>>14
あいつら馬鹿だからスルーしれ。
漏れならXMLでアノテーションごと実装、そのXMLはOODBMSで管理。
Javaは演算処理が糞。使いものにならない。
そんなことも知らない連中は放置して構わんよ。

PostgreSQLってどうですか？

> Javaは演算処理が糞
またお前か
> 漏れならXMLでアノテーションごと実装、XMLはOODBMSで管理
オントロジーですか・・・T大？

処理系までやってるならたいしたものだが…
ところでXMLの実装はどうしてんの？

BIORUBYっていまさら前時代的な感じがするけど意義あんの？
ライブラリの豊富なPERLとかPYTHONじゃまずいの？

>>21
別にわるくない。というか、今MySQLにはいろいろと(ry
>>20, 22
相変わらずのスレクオリティ、と思った漏れは負け組ですが、何か。

いーのー

>>23
bioperっちゅうのも有った希ガス

いまどきOODBMSですか
平和な時代ですね

>>26
s/bioper/bioperl/

ん？INOHがどうかした？
http://www.inoh.org/

一般公開で中学生でもできます

ttp://www.yokohama.riken.jp/open/20050625/event.html

31

ttp://bio.perl.org/
ttp://www.biopython.org/
ttp://www.biolisp.org/
ttp://www.biojava.org/
ttp://genephp.sourceforge.net/
ttp://www.bioruby.org/

33

>>32
genephpは知らなかったよ
#今日少しだけphp書いてたから
個人的にはsqueakで何か欲しいとこ

そんなもん要らん

話がループしてるな。
マイナーな言語・ツールを有名にするスレになってしまってる
未踏言語創製プロジェクト

ハッカー魂なんてバイオ的にどうでもいい
もっとリソースを集中しろと言いたい

それと、はっきり言って、他でやった仕事を真似して新しい仕事をできるから
新しい言語を使うって側面もあるでしょ

新しい言語でもツールでもいいけど焼直しじゃなく新しいことができるようにしちくり

>>39
全くだ。
よくもまあ、国民の利益がない研究に金落とすこと・・・
ドライのくせに大金いらないでしょ
悪いけど、大学から分配される研究資金でやってもらえません？
交際費で大半使っちゃうんでしょ。
Nパンしゃぶしゃぶ接待とか。

その通りです

BioJavaってどうよ。
近いうちに新しいバージョンが出そうな感じだけど。

>>40
詳しく。

リダイレクトができないクソなOS実装してるマシンてどうよ？

詳しく

あんまし
BioRubyだの、BioPerlだの、BioPythonだの、BioJavaだの
ぐたぐたぬかす奴を放置すると、
しまいにゃ
BioBasic、BioC++、Bio machine language
とかホラ吹いて研究費取りかねないなあ。

とくに、燈台とあそことか、京王のあそことか・・・
研究能力というより、こじつけ能力に秀いているんじゃない。
とにかく、我々のすべきことは、悪の芽を早めに摘むことだ。

>>46

如何にもありそうで怖い（Ｗ
高くて久しかったり、お金が久しかったりと久しい所は
政治力が異常に強いがはっきり言って政治ばっかだな

>>46
＞BioBasic、BioC++、Bio machine language

イイ！

BioMachine＝Creatures, BioMachineLanguage＝DNAかな？

>>48
＞BioBasic

BioAcidicもおながいします。HydrophilicとHydrophobicも。ｗ

BioC#　とかBioPHPとか　BioSQLとか・・　

BioXMLってあるんだけ？

>>46
>研究能力というより、こじつけ能力に秀いているんじゃない。

はげ堂
だけど、こじつけ能力や官僚向け作文能力や財務省向けプレゼン
能力に長けている人に予算が下りるというしくみは、別にバイオインフォに
かぎったことじゃないっす。
同じ構図がゲノムでもポストゲノムでもガンでも先端計測でも繰り返されてきた。

52

なんか別スレが自虐ネタで異常なもりあがりをみせてるな・・・・

>>53
でも、むっちゃわらける。
good job

>>51
出世するには(給料あげるには)、
絵に描いた餅をプレゼンする能力
がやっぱり必要なんだな。

>>54
青写真かけなきゃ、同じ夢を見られないじゃないか。

>>37
集中のターゲットは何?
>>53
あそこまで逝けるのも凄いかも。
うまい事、<strike>隔離</strike>ネタスレとして機能してるな(W

>>37
ポータルがひとつあれば分散しててもOKだしょ。

バイオインフォマティクス夏の学校2005
http://www.jsbi.org/summer_school/news05.html

59

60

61

62

63

64

以下の件に就いてでも話してみるか？
1.コメントがないとソースが嫁ない件
2.隔離スレの方がカキコが笑える件
3.bioinfo夏の学校にキャンプファイヤーが無い件
4.DBはやっぱりまだRDBなのかという件
5.perlのオブジェクト指向が異様にうっとうしい件
etc...

>>65
1.そうか？
2.そっとしとこうよ。つか、本人?
3.白根。
4.んじゃODB？ネイティブXML?
5.便利だよ。

67

>>66
2.違、ってかネタ振ってみただけなんだが。
4.ネーティブXMLの良さは自分には分らん。
リラクシングとか未来があるのかなと思ってみたり。
oo使った方が話が早い、と思う瞬間はある。

>>All
6.発現解析の結果のあと、どういう世界がまってんだろ。
7.どーせひまなら、オープンプロブレムでもやってみる？ここで。

ところで、あのねこみみいぬみみの二人組、
たぶんモナーの派生キャラだとおもうんだけど、
正式名称なんていうんだっけ？
教えて！エライひと！

>>69
ねこみといぬみ

>>68
俺、勉強忙しいから参加できないや、悪ぃ

72

それにしてもこっちの廃れっぷりもすさまじいな。
なんとかしてくれよ！

お〜い　隔離スレの118

good job !!

バイオインフォは一日にしてならずやと言う事でのんびりいこうや

76

よいしょage
http://omicspace.riken.jp/ARTADE/

よいしょage
http://omicspace.riken.jp/ARTADE/

79

80

phred phrap 使いたいんだけどどう
Ｌｉｎｕｘにインストールすればいいか教えてください。

82

83

84

85

http://science3.2ch.net/test/read.cgi/life/1119719795/

こらこら・・・隔離スレに誘導してどうする？

それから隔離スレの辛口さに毒気を抜かれて本スレがすたれてどうする？

隔離スレのネタがだんだんつまらなくなってきたな。
結局いつものネタになってしまってる。
人を罵倒するにもセンスがいる、ということをわかってない奴が出てきたら、ネタスレは終わりだからなあ。

結局、このスレで盛り上がってたのは奴ラだけだったということJARO

　　∧　∧
　☆ﾉ^^ﾊ))☆
　ﾉﾘ, ^ー^）ｌｉ　　＜ ジャジャーン！
　 と　　　つ　　　　　　もりあがるかもしれないから
　　│｜｜　　　　　　　　AA張ってみる！
　　（＿）__）

　　　　　　　　　　_人　
　　　　　　　　ノ⌒　丿
　　　　　＿／　　 ::（
　　　　/　　　　　:::::::＼　
　　　 （　　　　　:::::::;;;;;;;）
　　　　＼＿――￣￣::::::::::＼
　　　 ﾉ￣　　　　　::::::::::::::::::::::） 　
　　 （　　　　　::::::::::::::;;;;;;;;;;;;ノ　　
　　／￣―――――￣￣:::::::::＼
　（　　　　　　　　:::::::::::::::::::::::::::::::::）
　　＼＿＿::::::::::::::::::;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;ノ　
　　 このレスを見た人間は十三時間以内にウンコしたくなります。
　　　　　※あなたに訪れる壮絶なウンコ願望を回避する方法が一つだけあります。
　　　　　それはこのコピペを一時間以内に７つ、別のスレに貼り付け
　　　　　ごめんなさい。ウンコしたくないんです。

あそこが 盛り上がりましたが
何か？

へ〜。

面白さ １ ”へー”分

　　　　　　　　　　　　　　 _∩　　　おっぱい!!
　おっぱい!! 　 　 　 　 ／( ⌒)￣＼ 　 ∩__＿
　　　　 ／￣￣￣＼_,.i"/,. ノ|_|i_トil_|　/ .)E）　￣＼　おっぱい!!
　　　　i'___{_ノl|_|i_トil_|i.l/　/┃　┃{.i| / / ﾉノii|_|i_トil|
　　_n i|,彡　┃　┃{.i|i/　/'''　ヮ''丿li/ /ﾐ彡┃　┃{ﾉ
　（　l 》|il(_, '''　ヮ''丿|/　,ク　ム"／ ／l i(_ '''　ヮ''丿|
　 ＼＼ﾘ i ｀フ　l´il l|（　　ヽー､-　く　.ﾉﾘ i｀ﾌ　i_"il l| 　 n
　　　ヽ二二,,⌒ヽノﾘゞヽ　 .:o:. Y ..:oヽ二⌒　 　 ＼_レ（ E）
　　 　c':.　 !　:c:: }ノ　　 ヽ､＿_人　 ノ　　Ｙ　.::o:ヽ　..:p／
　　 　 ｀ー'｀ー‐く　　　　 ）　　 ハ !　　　　!、＿ ノ､_ノ
　　　 　 } ハ　 　 ヽ　　 ,.'　　 　 j ｲ　　　　 ）　　ハ!
　　　　 /　 `　　 　 ! 　 {　　　 ｀Y 〈　　　／　　　,　!
　　　　 !　 Y´　 　 / 　 ヽ　　　　ヽ ＼　{　　　 ｀Ｙ ﾉ

おっぱいを見ると何故興奮するのでしょうか？
http://science3.2ch.net/test/read.cgi/life/993373062/

バイオといえば　大阪大学である

捏造といえば(ry

どうせまた次期学長も医学部から排出して、
捏造事件の真相究明もその糾弾も学会に対する説明責任も
全　学　レ　ベ　ル　で　う　や　む　や
にするんだろ？






そのうち阪大に科研費を与える審査員や文科省役人にも結果責任？

１００！

　　　　　　　　正直、スマンカッタ！！
　　　　　＼＼　 正直、スマンカッタ！！　／／
　+　　　+　＼＼　正直、スマンカッタ！！／+
　　　　　.　　 ＿＿＿　.　 ＿＿＿　　. ＿＿＿　　　+
　　　 　　　 /. ――┤　 /. ――┤ . /. ――┤+
　　　　　　./(. 　= ,= |　./(. 　= ,= |　./(. 　= ,= |
　+　　.　　|||＼┏┓∩|||＼ ┏┓∩|||＼┏┓/　　+
　　　（(　　（つ　　　ノ 　（つ　　 丿 （つ　　　つ　)）
　　　 　　　ヽ　 （　ﾉ　　 （　ヽ ノ　　　）　 ） 　）
　　　 　　　（＿）し　　　 し（＿）　　 （＿_）＿_）
捏造してゴメンナサイ
実験科学を冒涜してゴメンナサイ

102

103

せっかく粘着たちを隔離したのに、見事なまでの廃れっぷりだな
誰か蛋白質科学会って行った？

ここって、粘着しかいねんじゃね？

>>104
懇親会のステーキが美味かった

CBI学会は締め切りが二度に渡って延期されたけど、苦戦してるのかな。
化学屋さんの領域に土足で踏み込んで乗っ取るようなマネをして大丈夫かな、とは思ってたけど。

>>106
ストーカー野郎は消えろ

誤爆のようにしか見えないのにレス番が合っているという不思議。

だれかSchemaとかほざいてる香具師がいるんでかまってやってくれよ。
悪いけど俺はパスだ。それどころじゃないからな。

論文を読んでいたら
"multialignment"(１語）という言葉が出てきたので
違和感を感じました。
googleで検索すると結構でてくるので、なお
違和感を感じました。Pubmedでは16報くらいしか
引っかかりませんでした。

>>208
206だがステーキの話してなんでストーカー？
ステーカーと呼ばれるならともかく

アンカーが100ずれた・・・orz

>>112,113
もう少し（半年くらい？）待て。きっと良いことがある。希望を捨てるな。

環境省では、「都市緑地を活用した地域の熱環境改善構想検討会」
　（以下、検討会）を設置し、周辺地域より気温が低い都市内の大
　規模緑地の冷気を活用し、周辺の熱環境を改善する構想の検討を
　行っている。

都市内の大規模な緑地にはひんやりとした冷気が漂っている。
一歩緑地から出ると、しゃく熱のアスファルト舗装やコンクリー
　トの壁面、そしてエアコンからの排熱などで、空気の温度はあっ
　という間に上がる。

>>110
ネタスレの中の人ですか？何だかんだいいながら、みんな見てる所が笑える。
>>Schema
これだけ閑古鳥が鳴いてたら、そのネタもアリだね。LispとかMLも含めて。
正直関数型って、まだ触った事がない。どこがイイの？
頭の体操が凄く大事なのだけは良く解る。

>>116
emacsも使ったことない？

>>117
エディタとしてしか使わない。
こめんどくせいマクロとか書く気にならない。

メモ帳は?

ほんとか？

>>115

ビルの敷地の20%は人工土に植物を植えて被覆するか噴水池にするよう
都条例とかでやってんでないか？

やってますね

>>117
使った事はあるけど、エディタはなぜかWin。
ってか、ページャとかテキストビューアでは自由度がないのがいやで、
エディタで大きいファイル開くとか、emacsだとしんどいし。

エディタはvimがいいです。倉庫番ﾚｲｱｳﾄのｷｰﾏｯﾋﾟﾝｸﾞ。

>>121
産総研？

>>118
それが面倒くさいなら、Lispなんて使えないでしょ。

隔離スレの241ってどの応募指してるの？

128

>124
viとed、常用していなくてもある程度のコマンドを知っているとイザと
いうとき救われますね。
漏れは…NEmacs以来Emacsべったりです。

>>126
つかえませんよ？

>>129
コマンド体系がsedと同じだし、便利ですよ。
ネマクスとかゼマクスとかはデフォルトのキーバインディングが嫌い。

そうだね

SAGEデータの解析ってどうやるの？

e-mailアドレスにそう書く。





じゃなくて、論文嫁。
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=pmc&cmd=search&term=sage
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=search&term=sage
http://scholar.google.com/scholar?as_q=Serial+Analysis+of+Gene+Expression&num=100&btnG=Search+Scholar&as_epq=&as_oq=&as_eq=&as_occt=any&as_sauthors=&as_publication=&as_ylo=&as_yhi=&hl=en&lr=

>134
どうも
読んでみます

sageデータって？下げてる統計？

>131
キーバインド、変更すりゃいいじゃん。
（Emacsのshell modeからexを実行、、、ってのは流石にアフォやし）

あと、どうでもいいことですが、歴史的にはsedの方がexやedより後だ
から、「コマンド体系はsedへも継承されている」と表現する方が語弊
が少なくなるのではないでしょうか。
「sedと同じ」とだけ表記すると「sedの方が先」というニュアンスを含ん
でいるようにも取れません？

＃でも、十年も使っていないと忘れてしまうな＞exスクリプトの書き方

>>131
M-x viper-modeなれるといいよ
emacs 上での vi モードでデフォで入ってる
地味なデータ処理は emacs のマクロでも良いけど
vi の方が楽って時におすすめ

道具の使い勝手にこだわるのは情報系の特徴だねえ。
生物系の人はむしろ「目的を果たすのに十分か」にこだわる
とおもうけど。

世間の人は、能なしボンボンがなにしたいか
なんて下らないことよりも、情報屋が生物研究
を一からやったらどうなるかに期待してますが、
何か?

生物屋が設定した作業仮説なんて糞だから、はなから無視していいよ。

その割に生物屋よりもマシな作業仮説がたてられる情報屋がいないところが
大問題なんだけど・・・・情報屋の人は、プログラミング言語をどうするとか、
アルゴリズムが、とか、キーバインドが、とか言う人のほうが圧倒的に多いんで・・・
期待するだけ無駄か・・・。

そもそも作業仮説なんてなしでも、ごりごりとデータマイニングと
ベイズ統計を頑張れば何かがわかるって考えてる人もおおいらしいし

141の真意はどっちなんだろう？無視するのはいいけれども、それより
マシな作業仮説の設定を必要とするのか？仮説フリーで結論をだすべき
なのか？

141は何かへんだぞ。　進化生物と物理が原理なのであって、生物屋も
表現技術の巧拙はあるにせよ、それらを理解しようとしている。　

>139
「目的を果たすのに十分か」だけが問題なのなら、チミは
カミと万年筆で論文を書きたまへ。
統計的考察もカミと万年筆と算盤でやりたまへ。

どうせ道具を使うのなら、最大限使い勝手良く使う方が
カシコイじゃん。

>>142
んなことない。情報系のバイオインフォの人間で言語をどーする
とか言い続けてる人間なんてほとんど見たことないぞ。
おまえ柏と山県の人間しかしらんのじゃないかと小一時間（以下略）

>>146
スマソ　瞬間的に柏と山県と藤沢の人間の顔が浮かんじまって
爆笑してしまった

>>139
最低限必要と十分、の違いじゃないか?例えばVBであれこれする香具師が少ない
のも、あれでも最低限の機能はあるのに、全然十分じゃない。違いを例えると、
平板ゲルシーケンサーとキャピラリシーケンサの違いのようなもの。効率が全然違う。
エディタの話は…ピペットマンのメーカの話だとでも思ってくれ。
ギルソン、イイだろ？
>>141
事実は小説より奇なり、っていうけど、モデル化してみてもその想定を圧倒
的に上回る仕組みになってるからね、生物って。wetとの小ラボ、上手く逝っ
てないところにいないか?
ハッキリ逝って、作業仮説については、どっちもどっちだと思う。
>>all
エディタの話も言語の話もピペットマンの話もウエスたん(ハアハア)の話も
アリにしようよ。まあ相互に「なぜその話が大事なの？」って菊野はありだ
けど、flameにならないような自制はする。

>>145
どんな賢い道具を使っても、成果が伴わないんじゃね。

いまどき紙と万年筆じゃ論文を書くにも不十分だし。
テックで書けとかいうほうがよほど気が狂ってる。
数式バリバリ使わなければならない分野なら別だけど。

道具の話になったとたん、隔離スレより盛り上がりだしたな。
やっぱ情報系は・・

で、最善の道具は何よ?
生物系としてはどうでもいい思想より、そこが知りたい。

ここで理論の話しても
分かる人間いないでしょ

>>151
それは思い込みでは？

思い込みです

生物屋が糞データをしこたまこしらえる→情報屋がそれらにアノテーションを付けてあげる→双方(=ﾟдﾟ)ｳﾏｰ
情報屋が電波モデルを勃てる→生物屋が検証実験してあげる→双方(=ﾟдﾟ)ｳﾏｰ

こんな糞データ使えねーよ。
お前実験したこともねーのに御託並べるな。

そういう緊張感のあるコラボこそがサイエンスを前進させるのだ。
実際、製薬会社の社内での異分野コラボは、お互いの覇権をかけた
争いだから、楽しいぞっ！

ぶっちゃけ、バイオインフォマティクス学会って面白い?

野次馬多し。

相変わらず英語でやってんの？

せめてチェアがまともに英語でしゃべって受け答えしてくれりゃいいんだが。

正直、あの学会を英語でやってるのは単なる箔付けとしか思えん。
日本語でやったほうがよっぽど有意義な希ガス。

>>160
箔ツケになってないだろ、あれじゃ。

人工知能学会誌の2004/5にBioRubyについて書かれてた。
http://www.ai-gakkai.or.jp/jsai/journal/toolbox/01/#THIRD
「近年，AI技術が活発に導入されているバイオ分野のソフトウェアとして「BioRuby」を取り上げます．」
と書かれていたが、BioRuby自体とAI技術については殆どかかれて居なかった。

「AI技術が活発に導入されている」は、「バイオ分野」にかかるのであって、
「BioRuby」にかかるのでは無いっぽい。
さすが、インフォマティシャンだと思った。

163

164

http://www.cbrc.jp/cbrc/recruit/yosei.html

人材不足って言うほど仕事がないけどこれは面白そう
http://www.cbrc.jp/cbrc/news/yosei_gijyutsusya_ja.html

何しろ参加無料だし

規制緩和は必要だよ

必要です

２ｃｈネラ殺到。アトいう間に定員オーバー。会場はヲタッ気でムンムン

<まとめ>
http://www.cbrc.jp/cbrc/news/yosei_gijyutsusya_ja.html
http://www.cbrc.jp/cbrc/recruit/yosei.html

171

172

bioinformatics-jp 消滅したんだが・・？

174

>>173
　　　　　　　　　ナ ゝ　　　ナ ゝ　/　 　 十＿"　 　 ー;=‐　　　　　　　　　|! |!
　　　　　　　　　　cト　　　　cト　/＾､_ﾉ　 | ､.__　つ　 （.__ 　 ￣￣￣￣ 　 ・ ・
ミﾐ:::;,!　　　　　　u　　　　　　　｀ﾞ"~´　　　ヾ彡::l／VvVw、 ,yvヾNヽ　　ゞヾ　 ,.　,.　,.　、､ヾゝヽr＝ヾ
ﾐ::::;/　　￣ﾞ`ｰ-.､　　　　　u　　;,,;　　　j　　 ヾk'!　' l　/ 'ﾚ ^ヽﾍ＼　　 ,rﾞゞﾞ-"､ノ /　l!　!ヽ ､､　|
ミ/　　　　J　　　ﾞ`ｰ､　　　"　;, ;;;　,;;　ﾞ　　u ヾi　　　 ,,./　,　,､ヾヾ　　 | '-- ､..,,ヽ　 j　 !　| Nヾ|
'"　　　　　　　_,,.. -─ゝ.､　　　;, "　;;　　　_,,..._ゞｲ__／/〃 i.! ilヾゞヽ　 | ､　 .r．　ヾ-､;;ﾉ,.:-一'"i
　　j　　　　／　　 ,.- ､　 ヾヽ、　;; ;;　_,-＜　　/／_,,＼' "' !|　:l ﾞi !_,,ヽ.l　`ー─--　 ｴｨ' (． 7 /
　　　　　　:　　　　' ・丿　　￣≠Ξｲ´,-､　ヽ /ｲ´ r．　`ー-'ﾒ ,.-´､　　i　　　　 u　　ヾ｀`ー' ｲ
　　　　　　 ＼_　　　 _,,......::　　　´ﾞi､　`¨　/　i　ヽ.__,,... '　 u ﾞl´.i･j.冫,ｲﾞl　 ／ ｀`-､..-　ノ　:u l
　　　u　　　　　￣￣　　彡"　　　、ヾ￣｀`ﾐ::.l　　u　　　j　　i､｀ー'　.i /　/､._　　　　｀'y　　 /
　　　　　　　　　　　　　　u　　　　　　｀ヽ　　ﾞ:l　　 ,.::- ､,,　,.　ノ　ﾞ u　!　/_　　￣　ー/　u　/
　　　　　　　　　　　_,,..,,_　　　　,.ｨ､　 ／　　　|　 /__　　 ｀`- ､_　　　 l　l　 ｀`ｰt､_　/　　／
　　ﾞ　　　u　　,.／´　"　 ｀`- ､_Ｊ　r'´　 u　丿　.l,...　｀ー一''/　　　ノ　 ﾄ ､,,_____　ﾞ/　／
　　　　　　　 ./＿_　　　　　　　　ｰ７　　　　/、　l　　 'ﾞ　ヽ/　 ,. '"　　＼｀ｰ--- ",.::く､
　　　　　　　/;;;''"　￣￣ ───/　　ﾞ　 ,::'　 ＼ヾﾆ==＝'"／ ｀- ､　　　ﾞー┬ '´　/　＼..,,__
、　　　　　 .i:⌒`─-､_,....　　　　l　　　／　　　　 ｀ー┬一'　　　　　 ヽ　　　 :l　 ／　 , '　｀ソヽ
ヾヽ　　　　 l　　　　　 `　 ｀ヽ、 l　 .／　　ヽ　　　　　 l　　　　　　　　　）　　,; ／　　　,'　　　　'^i

バイオインフォマティクス技術者認定制度
今年はもうやらないらしい。
やはり、採算合わないもな。
あの受験者数じゃ。

おいおい嘘付くなよ
まあ、今年からはもっと減るだろうけどね

>>177
　　　　　　　　　ナ ゝ　　　ナ ゝ　/　 　 十＿"　 　 ー;=‐　　　　　　　　　|! |!
　　　　　　　　　　cト　　　　cト　/＾､_ﾉ　 | ､.__　つ　 （.__ 　 ￣￣￣￣ 　 ・ ・
ミﾐ:::;,!　　　　　　u　　　　　　　｀ﾞ"~´　　　ヾ彡::l／VvVw、 ,yvヾNヽ　　ゞヾ　 ,.　,.　,.　、､ヾゝヽr＝ヾ
ﾐ::::;/　　￣ﾞ`ｰ-.､　　　　　u　　;,,;　　　j　　 ヾk'!　' l　/ 'ﾚ ^ヽﾍ＼　　 ,rﾞゞﾞ-"､ノ /　l!　!ヽ ､､　|
ミ/　　　　J　　　ﾞ`ｰ､　　　"　;, ;;;　,;;　ﾞ　　u ヾi　　　 ,,./　,　,､ヾヾ　　 | '-- ､..,,ヽ　 j　 !　| Nヾ|
'"　　　　　　　_,,.. -─ゝ.､　　　;, "　;;　　　_,,..._ゞｲ__／/〃 i.! ilヾゞヽ　 | ､　 .r．　ヾ-､;;ﾉ,.:-一'"i
　　j　　　　／　　 ,.- ､　 ヾヽ、　;; ;;　_,-＜　　/／_,,＼' "' !|　:l ﾞi !_,,ヽ.l　`ー─--　 ｴｨ' (． 7 /
　　　　　　:　　　　' ・丿　　￣≠Ξｲ´,-､　ヽ /ｲ´ r．　`ー-'ﾒ ,.-´､　　i　　　　 u　　ヾ｀`ー' ｲ
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　　ﾞ　　　u　　,.／´　"　 ｀`- ､_Ｊ　r'´　 u　丿　.l,...　｀ー一''/　　　ノ　 ﾄ ､,,_____　ﾞ/　／
　　　　　　　 ./＿_　　　　　　　　ｰ７　　　　/、　l　　 'ﾞ　ヽ/　 ,. '"　　＼｀ｰ--- ",.::く､
　　　　　　　/;;;''"　￣￣ ───/　　ﾞ　 ,::'　 ＼ヾﾆ==＝'"／ ｀- ､　　　ﾞー┬ '´　/　＼..,,__
、　　　　　 .i:⌒`─-､_,....　　　　l　　　／　　　　 ｀ー┬一'　　　　　 ヽ　　　 :l　 ／　 , '　｀ソヽ
ヾヽ　　　　 l　　　　　 `　 ｀ヽ、 l　 .／　　ヽ　　　　　 l　　　　　　　　　）　　,; ／　　　,'　　　　'^i

反省
ttp://mongoose.pinkengine.net/photo/futari/data/76592.jpg

暇だ

↑立体障害を起こさずにうまく相補的な結合をしている、と表現すればよいのか。

凹と凹がくっついているんだからfunctionalなinteractionではない
結晶中によく見られるpacking force由来のアーティファクトだ！
と構造生物学者はいうのではないだろうか？

最近うちら構造屋はcomplementarityいうよ

クラスタリングしかネタがないグループってどうですか？

よくないね

どうだといいんだい？

>>184
マルチポスト

>>184
何とかのひとつ憶え。。

実写版ネコミ萌え。イヌミより美人だな

>>184
それどのグループ？

「バイオインフォマティックス」を名乗っているグループは
「下請け系」と「開発系」とに大別されそうだな。

そうだね

既存のやり方では出来ないものを打ち破る方法を作り上げたり
新しいものを発見するのが研究なのに、確実に成果をだせるものにしか
予算を出さないから、既にできてるもの（言語・ツール・システム開発）や
作業すれば一応の形になるもの（データベース・応用研究）しかできないんだよ。
いまのバイオインフォマティクスが目指すべき道はそこじゃないのに、
三流研究者が評価がわに回りすぎたんじゃないか？

194

異化研のN井研考えてるんすけど、どうっすか？

駄目です

なぜ？

行けばわかる。

チョットだけでいいか教えてください。

アルゴリズムが理解できていても、対象のデータに対して誤った方法
を適用しているのにそれを指摘することもできず
『よく分類できているから良い』
程度の議論しかできないようではレベルが問われる。
ほとんどが『応用なんだからこれでいい』で済ましているわけだが

既存の三流バイオ屋がしたり顔で吐く
「バイオ研究とはこういうものだ」
的な言葉を信じて、新しいワンステップを
踏み出せずにいるのではないだろうか

生物学から生命アルゴリズムの研究をしています
http://www.geocities.co.jp/SiliconValley/4358/red_room1.html

203

欲しいデータを自分でだせればいいんだけどね
現状、ベンチに近づくことすらできねえ

>>196

195ですが、
研究室の訪問はしました。
みんないい雰囲気でしたよ？
研究の内容に問題があるのでしょうか？

>>205
N井先生もそれなりにすごい人だけれどもK舌先生はやっぱり業界内で評価が高いと思う
しかも怒ると恐そうだし・・・・徹底的にしごかれたらよいのではないだろうか？

>>200
つまるところ、それ（良く分類できる）が重要なんじゃないのか？
なにを根拠に間違ってるとかいうのかきちんと説明できない奴になにを言われてもね。

>>206


195&205ですが、
怖そうなんですか〜。やさしそうだと思ってました。
それと私、ドクターに行かずに就職希望でN井研受けるつもりなんですが、
しごかれたら就職先もいいところ決まるもんなんでしょうか？

>>208
N#先生ココ見てる予感。しーらないっと。

>>208
きっちりしごかれたらその分が自分の自信につながります。
就職の面接のときなどは、人事の人は、被面接者の人の中にどれだけ輝
いているものがあるかを見定めようとする、と言われています。厳しくても
思いやりのある先生のもとで、みっちりしごかれるのは、修士という一生に
一度しかない時期において、得がたい経験であることは間違い
ないと思います、、、
それを「いいところに就職」につなげられるかどうかは208さん次第・・・

>>201
こういうときは、勉強するに限る・・・って思ってる人ばかりなのかも

>>208
はなから就職希望を押し出していくのは危険な気が・・・。

208ですが、

>>210
しごかれればいいところに就職の可能性もあるわけですね。
がんばります。

>>212
なじぇ？！研究室訪問の際はそのことは言いませんでしたが、
受かったら言いますよ。言わないとドクターまでかかるような
壮大なテーマを与えられたら困るじゃないですか。
2年でできるテーマをもらってきっちりとこなしたいです。

虹彩（アイリス）のパターン画像をデータ化し、予め登録してあるデータ
　と照合し、個人を識別する認証方式です。
　虹彩とは、黒目の内側で瞳孔より外側のドーナツ状の部分のことです。

yahoo bioinfo ML
キモイ話題になっているのはなぜ？
たのしい予算の分け合い方を話し合っているようだ。

>>213
っていうか、中○＆木□ラボの受験者数たかが知れているんだから
2chで聞くにしてももっと身元を隠さなきゃ。
大学院の研究室は、そもそもハナから就職希望の学生を受け入れたくは
ないんだよ。他大学の大学院を受けて博士課程に行かないのなら、
まさにロンダと言われても仕方のない典型だなぁ・・・。
研究室側するとはっきり言って迷惑千万。即戦力でもないのが
4月にやってきて夏までは授業。12月からは就職活動で5月まで
続けるヤツまでいる。1月には修論査読で2月には卒業旅行。
そんな連中に来て欲しいかなんて考えれば分かるものなのになぁ。

ttp://www.smash-shop.jp/cgi-bin/s_search/search.cgi?equal1=11207&tid=list3

＃先生を中傷しているやつは切腹しろ

219

>>216
いや、そんなこともないだろ。
みんながみんなD志望でも、それはそれで困るだろ？

216です。

なんかお騒がせさせてしまっているようですみません。

>>213
>>220
そういうことは考えたことがなかったです。
私が現在属している研究室はマスターは就職のために
研究室にいるようなものなので嫌がられるなんて考えても見ませんでした。
研究室によって違うものなんですね。勉強になりました。

私は単に肩書きを上げるために大学院に行こうとしているわけでありません。
2年間できっちりと研究をしてそれを通じて得たことを
社会出てから実践してバイオ産業の発展に寄与したいと考えているわけです。

221は間違えました。

自分は213です。

>>222
こんなところにも、データ捏造人間ﾊｹｰﾝ。
こんな香具師、退学処分にしろ。

>>223
違う違う。213に書いた番号を書き間違えたというだけのこと。
もう一度書き直すと・・・・

----------

213です。

なんかお騒がせさせてしまっているようですみません。

>>216
>>220
そういうことは考えたことがなかったです。
私が現在属している研究室はマスターは就職のために
研究室にいるようなものなので嫌がられるなんて考えても見ませんでした。
研究室によって違うものなんですね。勉強になりました。

私は単に肩書きを上げるために大学院に行こうとしているわけでありません。
2年間できっちりと研究をしてそれを通じて得たことを
社会出てから実践してバイオ産業の発展に寄与したいと考えているわけです。

>>224
スマソ。激しく誤爆。

バイオインフォマティクスでアカデミックの道は、
険しいので、心してかかられたし。
(資金配分が歪んでいる)

PDとしても活躍の場はあるけど、短期(1年)の任期制ばかり。

>>221
君の考え方には大きな落とし穴がある。
「就職活動はM1の冬〜M2の春までが勝負」という事実です。
> 2年間できっちりと研究をしてそれを通じて得たことを
> 社会出てから実践してバイオ産業の発展に寄与したい
のはよい志ですが、採用する側はみな青田買いなわけです。
M1の冬の時点で、会社人事採用担当者に
「こいつはあと1年たって、2年間できっちりと研究をしてそれを
通じて得たことを役立ててウチの会社に寄与してくれるだろう」
と思わせなければなりません。
そのために、もし努力が進歩に結びつくタイプのひとならば、
最初の半年から1年間は、誰かに鬼のように厳しくしごいてもらえるという
のは、得がたい環境であることは間違いないと思います。

>>213
製薬、食品の研究職なんかはM1の10月には始まるし、IT系は
2月〜4月頃が多い。>>226の言うとおり、就活の時は、多くの
M1はB4同様に業績もクソもないから、将来使えそうかどうかという
「見込み」で取られる。
あと、>>213の志は良いと思う・・・一般世間的には。しかし
研究室というのは世間とは隔絶した魔境。教官が全てのルール。
正論は教官が作る。教官が正義。就職といってどう反応するかは
教官次第。もしかしたら杞憂で終わるかもしれないけど、最悪の
事態も想定して行動するに越した事は無い。はなから就職なんて
手の内はすぐに見せるな。いざとなったら家が苦しいから、とか
嘘付いてでも人間関係を破壊せずに就活した方が吉な事もある。
良いとか悪いとかじゃない。教官が正義。研究室の原理はこれに
つきる。

バイオ分野で就職したいなら、シリコではなくてvivoかvitroで
きっちりと修行する方がいいと思うけどなぁ。学部でwetをやった
程度で修士でdryに行ってしまうと、キャリアとしてはかなり
中途半端になるよ。

224です

>>225
バイオインフォマティクスの資金配分が歪んでいるのですか・・・。
厳しそうですね。有名な先生に集中しているということでしょうね。
私はPDを目指すつもりはないのですが
問題はバイオインフォマティクスを
いかせる会社があるかどうかですね。
製薬会社のHPをみても募集はなさそうですし。


>>226
最初の半年から1年間みっちりと鍛えられるかどうかが勝負の分かれ目ですね。
がんばります。

>>227
教官が正義・・・・というのは分かります。今私が属している研究室でもそうです。
だからこそ本当のことを隠さずに言った方がいいのかと思ったのですが。
その選択は難しいですね。でも227さんのほうが正論でしょうね。

>>228
中途半端になりますか・・。
バイオインフォマティクスで就職するなら当然今の時期に
移るべきだと思います。でもウェットで就職するなら移る必要はないですね。
問題はバイオインフォマティクスを
いかせる会社があるかどうかですね。
製薬会社のHPをみても募集はなさそうですし。

「バイオインフォはバイオバブルの負の遺産」


　

224は職種は何でもいいのか？

製薬では募集は出てなくても大手中堅ぐらいなら、
やってる人はいるので、面接くらいならよんでもらえるよ。

そこで入れるかどうかは運しだいだね。
そもそも製薬では採用しても一人だろうし、
生物物理系とか物理化学系の人と
勝負になる可能性もある。

ＩＴ系なら就職はそこそこあるのかもしれないけど、
どんな職種になるのかは知らない。
バイオインフォといっても生物系向けのソフト
を開発するだけみたいなとこもあるし。

大手のコンピュータ会社から、数人が製薬会社に常駐して一緒に
業務（創薬）なんてところもあるよね？住エレとかCTCとか
IBMとか日立ソフトとか、そういうことやってなかったっけ？
これからは網羅的な臨床データ取得とかのところがバイオインフォ
にのめりこむ可能性があるので、臨床試験を請け負っている会社
なんかもおすすめだとおもうな。

そういえば8月に創薬インフォマティクス研究会の
第4回があるんじゃなかったっけ？

未来創薬研究所ってどうよ？

まずその名付けのセンスに引いてしまうけど

DBや配列解析、マイニング、アルゴリズム開発などのいわゆる
バイオインフォ系からの就職を目指す所として、純粋バイオ系
企業だと味の素とかかな？インフォ部門があって、実験系とうまく
組み合わせてるっぽいので、会社でバイオしたい人ならいいかも。

製薬は上記の分野だと微妙かも。データベース買う側だし。
製薬はむしろ量子化学系でcomputational chemistryやdrug design、
virtual screeningができる人の方が需要があるかも。
molecular dynamicsは意外に口が少ないっぽい。
systems biology系は一部のトップ研究者しか必要とされてない。
製薬の研究職は実験系でも狭き門で、コネ or その会社への分野の適合
（＋業績）があってなんとか入れるくらい。有機合成、薬理は口が多い方？？
なのかも。あとは免疫、神経など、各会社ごとの重点分野か。
物理化学系はもっと難しく、バイオインフォはなおさら。
まぁ細かい事は、自分から動いて各会社のOBに会うか、研究部門の
人に学会などで会って、話しをして繋がりを作るといいかも。

「どちらにお勤めですか？」
「はい、未来創薬研究所に勤めております」

あとはIT系だと、データベース構築なんかでSEを雇ってる
とこが結構あるね。その他、富士通、NECがもっと専門的な
理論物理、量子化学の知識をバイオに活かすような商売してる。
立体構造解析のためのハード、ソフトの販売とか。
でもこの手の会社は、生物の知識は後付でもなんとかなると
思ってる節があって、バイオ系出身というのは絶対的なもの
でもないっぽい。

修士だとあんま関係ないかもだけどおまけで、IBMのワトソン研とか
で超オタッキーな研究職あります。外資製薬のバイオインフォ、
systems biology系は薬品開発に繋がらず、結構淘汰されてるっぽい。
商売に繋がるのはもうちょっと先かもね。

例えば、ファイザーがどんな人材を欲してるかはView Job Postings
で検索すると、リアルタイムでわかる。日本が含まれてるかはしらん。
ttps://www.pfizerjobs.com/servlets/iclientservlet/recruit/?ICType=Panel&Menu=ROLE_APPLICANT&Market=GBL&PanelGroupName=ER_VIEW_JOBS


で、漏れは就職蹴って医学部受験に走りましたとさ・・・。

↑の方々のご意見をまとめさせていただくと、
JBICとか日本バイオインフォマティクス学会が騒いでいる
割には、バイオインフォマティクス人材は求められていないし、
求められているのは、ごく一部の分野だけである。
このような分野を取り扱っているのは、
やはり薬学部あたりしかないということだ。

2000年あたりからついこの間まではやった、純粋なバイオインフォ
すなわち、なんちゃらオームに通じた人材はさして求められていないようだ。
少なくとも、一部のソフト会社や研究機関の任期採用以外はね。

ということで、我々は(嫌々)アカデミックに残るしかないのである、ケッ。

229です

みなさまありがとうございます。

バイオインフォマティクスに就職先があまりないなんて考えもしませんでした。
239様が言われているように２０００年に例の計画で刺激を受けて生物を選択したようなものです。
（おそらく当時生物を選択した人の大半はこの計画に影響を受けられていることでしょう）。
今はそれほど盛り上がっていないのですか。。。。。

富士通などのIT系企業がバイオをやっているなんて知りませんでした。
製薬企業の中にあると思い込んでいますた。
製薬がものすごく狭き門とも知りませんでした。
ただただ驚くばかりです。。。。。。。。。

皆さんは卒業後はどうされるおつもりなんでしょうか？
(嫌々？)アカデミックに残られるのでしょうか？

>>240
その頃は理学部生物系を筆頭に、工学系の生物系、農学の
偏差値が他の理工系分野より高めの傾向だった。しかし
ここ数年は落ち着いて、他の分野とあんま変わらない。
これが意味する所は・・・

うわ！き、貴様な、何をする！！Kねが久しいからって！！
さｋｄｆｋそいｄｇあｓｋｊｄｆさｋ

>>236
> 純粋バイオ系企業
宝バイオと武田じゃね？
なにげに化粧品メーカも穴場な気がする。市場規模も魅力的。

宝バイオは試薬作りとその営業というイメージだったけど、
確かにバイオっぽいかも。武田は製薬な気がするが・・・
ニッチな部門とか？

化粧品のバイオってどうなんだろ。化学屋の天下という
イメージだけど。エロイ人おせーて。

過剰コラーゲンパスウェイのアノテーションｗ

>>236　>>238
の表記で気になったのだけど「量子化学系」と「物理化学系」は
全然ちがうよ〜。ドラッグデザインやインシリコとかバーチャルスクリーニングは
むしろ、構造生物学系とか物理化学系の人が占めていて、製薬会社では
量子化学系の計算や理論の人は、ほとんど採用してもらえないよ。
なんか「小難しいこといっててもものづくりには役立たない」と
ほとんど憎まれているとしか思えないような待遇です・・・・orz

バイオインフォ専業の会社としての勝ち組＝ファルマデザインという
ことでいいでつか？

>>245
ファルマは新人の採用を全然していないじゃん

バイオインフォも知っているバイオの人の方がたいてい好まれるのは
確かかもね

量子化学で製薬に行ってる人なんているんだろうか。
いたとしても、おそらく特定されそうなくらい少数だと思うｗ

ちなみに、今ドラッグデザインやインシリコやバーチャルスクリーニングを
やっているのは、ほとんど元有機化学者だと思う。
それらの分野（構造生物、物理化学など）でさえ、専門家はあまり採用されていない。

>>247
本当の専門家(すでにPDBに複数のエントリー持ってるような人たち）
は十分アカデミックでくっていけちゃうからね・・・製薬会社を
受けないのでしょう・・。

修士の時に結晶「化」をやってました。ディフラクションはでまちたが
解析は助手の○○先生にやっていただきまちた・・・・なんて人が
構造生物系を自認しても製薬に行けるわけがないでつ・・・・・。

ともかく、日本の製薬会社のTOP20社全部あわせて、研究職の新卒採用は
実は400名行かないくらいだってことですね。そのうち基礎系は半数以下
（のこりは合成、薬理、毒性）。生物系/IT系修士のほぼ
半数がそこに志望をだして、PhD持ちもそれに参戦するわけだから、
どのみち倍率は50-80倍ですよ。

>>248
400人の中に臨床開発は含まれているのでしょうか？
それとも純粋な研究部門？？

ちょっと方向は違うが、製薬会社の創薬〜データ解析などの
システムを構築したり効率化をコンサルする仕事なら
ありそうな気がするのだがどうでしょう？
アクセ○チュアとかのコンサル系でやってそうだけど・・
これならバイオの知識も活かせどうだし。
やってる会社があるかはしりませんｗ　知ってたら教えてください。

日本のブームは米国の2年遅れという傾向に注意しなさい。

インテックW&Gについてもしくは他のお奨め企業について教えてください。

プロジェクトマネジメントを考えるときに、失敗からの経験が大いに役立つことがあ
ります。僕たちの会社では、失敗した要因の本質を追求するケースでＷＨＹを５回繰
り返すと、根本原因が見えてくると教えられています

240です。
バイオインフォマティクスに限らずバイオ自体就職がかなり厳しそうですね。
あわわわわわわわわわわわわわ。。。。
意外すぎ。
バイオインフォマティクスのITの部分をきちんと勉強したほうがいいということでしょうね。
ウェットのままいるほうが得策かもしれませんけど。
でも今の研究室は願書を出していないので続けることができないんです。

ぶっちゃけ下の３通りではどれがお得なんでしょうか？？
１．ウェット１年＋ドライ２年
２．ウェット１年＋ウエット２年（マスターで研究室を変更）
３．ウェット３年（研究室を変更せず同じテーマで）

お願いします。

やりたいことをやれ。
きれい事だと思うかもしれないが、「やりたいこと」より「得なこと」を優先した人は結構挫折することが多いよ。

研究職にこだわるから就職難なんだと思うよ。
MRか臨床開発するんだったら就職は難しくない。
だが、製薬会社に仮に研究職で入ったとしても、７−８割
の人は3-5年でいずれ研究職から別部署に異動するよう打
診されるので、要するに研究職にとどまってられるのが早いか
遅いかの違いだと思う。PhDをもっていれば、中途・キャリア採用で
別会社の研究職かアカデミックに横滑りできるが、そうでなければ
会社の人事に黙々と従うだけ。
ずっと研究職から離れたくないんだったら、バイオベンチャー系
で研究職するほうがむしろカタイと思われ。

どうしても研究職で就職したいんだったら、大手の会社の即戦力になり
そうなテーマの研究をやらせてくれるラボを選んでラボチェンジすべき
でしょう。１でも２でもいいけど、テーマ選びが重要で、予算の都合や
前任者の都合で先生から押し付けられるテーマに諾々としたがっているようで
は、就職はどんどん遠くなります。
製薬会社向けなら
・疾病関連遺伝子以外は興味なし
・GPCRかチャネル以外興味なし
・毒性、ケモインフォマティクス以外興味なし
IT関連向けなら
・ユビキタス、組込みLinuxカーネル、B-TRON
・軽くて使いやすいGUI
・SQL/XML/JAVA/PHPアプリ

漏れは255の意見にある程度賛成だけど、ちょっとちがう。
「やりたいこと」をやれ、
ではなくて「本当になりたいもの」になるために、一瞬たりとも
妥協するな、だと思う。
「製薬会社の研究職になりたい」とはどういうことか？その場合
「やりたいこと」＝「製薬につながる研究」のはず。
逆に「製薬にはつながらない研究」がやりたい、あるいはそれを
やっていても特に人生の無駄とは思わない人間は、「製薬会社の
研究職」になれる可能性は低い。

バイオインフォってやってる会社自体少ないでしょ

結局はそこまでなりたいわけじゃないんだろ。
まあその基準で言えば、本当に銀行員になりたかった銀行員も、
本当に商社マンになりたかった商社マンも、そんなにはいないだろうけど。

ウェットで修士博士とって趣味でシリコが妥当かと。
バイオインフォって設備コストそんなにないし独学可能だしね。

>>260が的を得てるかも。SEっぽいことやユーザーとしてインフォを
活用するなら、後からやってもいいと思う。wetと組み合わせてる人は、
dryに関しては後から学んだんだろうし。バイオ系を狙うなら
ウェットがしっかり出来て、さらにインフォも出来ます！って方が、
使える人材だと勘違いしてくれるかも？
インフォだけで頑張るなら、数学力か政治力の勝負？

数学------コンピュータ------生物
エレガント----------------泥臭い

バイオインフォはほどんど泥臭い側

数学得意な奴は何屋ってもできるきがする

そうでもない・・・と言うより双方が巡り合わない

数学がとくいなだけでは高校の数学教師くらいしか職ない

銀行員も商社マンも
１．それにものすごくなりたかった奴か
２．本人はそんなでもなくても、ものすごく適性のある奴
が現実には大多数だとおもうけどね。
「製薬会社の研究職」ではないただの研究職になりたいだけの
奴が製薬会社を希望しすぎるのがそもそも滑稽なんだよ。

>>1
「バイオインフォ・・・教えてください」より
「セックル教えてください」の方がイイ。

システム生物医学ってどうよ？

そんなものは存在しない

プラスミドのいい書き方（ソフトウェア）教えて

>>269
最近本屋でそう言うタイトルの本を見かけたよ

>>270
無料ソフト＆Win環境なら、BioEdit最強

なるほど

パワポでかけ

>>272　ありが�d

>>274
うーん、Powerpointでも書いたけど時間がかかるし自動で制限サイト
書いたりした方が便利じゃない？

>>268
世界のキタノですら「まだすんごい先の話し」と
言ってるのに、一部の人が役人を騙すために言ってる
だけでつ。

武蔵工業大学研究用原子炉で漏水
武蔵工業大学（本部・東京都世田谷区）は学校法人五島育英会が運営する大学である。五島育英会（東京都渋谷区）は東急グループの一員である。
学校法人が営利企業の傘下にあるとされること自体、好ましいこととは思われないが、首都圏三千万住民の生命・健康を脅かす事故が起きている。
武蔵工業大学原子力研究所の研究用原子炉が1998年12月に冷却水の漏水事故を起こした。
12月4日、原子炉照射室内の熱中性子取出し口下部壁面より、水のしみ出しが見られた。しかし、多くの事故に共通して見られることであるが、この時点で大学は対策をとらず、12月21日まで原子炉の運転を継続した。
12月21日夕方、原子炉の運転終了後に照射室内の点検を行ったところ、熱中性子取出し口下部台上に水溜りを発見した。調査により、原子炉タンク胴部に漏洩箇所を発見した。
また、使用済燃料貯蔵プール水の一部が熱中性子柱床面下部空洞部へ漏れて来ていることが判明した。以後は炉を停止し、休炉状態としている。
1999年の年明けに新聞報道で事態を知った地域住民は、早速に研究所に出向き事情の説明を求めた。
その後、地域の住民と市民団体で「武蔵工大の原子炉事故を考える会」を結成し、大学側に対して、老朽化した原子炉の廃炉を要求してきた。
大学側は当初、住民側の要求を拒んでいたものの、2003年5月に至り、廃炉を決定した。
原子炉は老朽化が進行しており、安全性の問題とともに、使い勝手からも廃止は当然である。
しかし廃炉で全ての問題が解決するわけではない。廃炉で放射性廃棄物が消滅してくれるわけではない。運転停止後の維持管理、安全性確保にも万全が尽くされなければならない。

>268
詐欺師の仲間ﾊｯｹｿ

254です。

みなさんの的確な書き込みを見て、バイオインフォマティクスを修士でやるのはやめることにします。
N＃研は出願はしましたが受験はしないことにして、他のウェットの研究室を探します。
今の状況だとたとえ受かっても研究生活や卒後の自分が描けないです。
先生から見ても就職希望は感じが悪いようですし、今の間にやめたほうが双方ともいいことでしょう。
ありがとうございました。

>>276
世界のキタノってあの北野武（ビートたけし）さんのことですよね。
お笑いや映画や政治だけでなく、バイオの世界にも興味を持っているんですね、たけしさん。
そのような偉大な人物になってみたいものです。

>>279
くっ!!超突っ込みてぇ!!だっ、だがこれはワナに違いない!!!

>>279
良い選択をされましたね・・・
バイオインフォは宣伝が上手過ぎるのか失望を感じることが多いよ
有名教授がろくにバイオの知識が無かったり、
ツールの使い方は知っていても、数学的原理を理解している人が殆ど居なかったり
冗談抜きでまともなレベルの人って十数人しか居ない気がする

>>281
（でも、まあ、N井先生K下先生はその十数人のレベルに達してるのは間違いないと思いますけどね）

279です

>>280
ワナ？？

>>281 >>282
たったの十数人しかまともな先生がいないんですか？！
やっぱやめて正解みたいですね。ウェットでは考えられないことですから。
産業的な応用もできそうもないみたいですし。
宣伝。。。。私も２０００年の例の計画で興奮しましたがそれも宣伝のうまさにのせられてしまったバカな証拠ですね。
このようなこと失敗が今後２度と内容に精進したいものです。

新分野には山師が多いだけのこと。
すっかり確立した分野で馬鹿の一つ覚えのような人真似研究もどきをやりたいか、
新分野を切り開いていきたいかは自分次第だよね。
就職の安定を求めてるひとにいっても無駄だろうけどね。

>>279
も、もしやこれが釣りというものか！？ｗ
まぁ君がそう思うなら、行かない方が賢明かもしれん。
世界のキタノも泣いてるだろう。

>>284
まぁ、その程度の意志なら止めた方が良いかもね。
N,K研は>>282の言う様に高い能力の人たちだよ。
でも、君にはそのことが分からない。人の言うことに右往左往する。
ちなみに、>>284の言う様に既存の生化学や分子生物学にもちゃんとした
能力を持っている人はそれほどいるわけではないよ。方法論が整った
分野では、それほどの能力がなくても決まり切ったパターンでそれなりの
ポーズを取れるだけ。

バイオインフォは詐欺師集団でつか

質問があります。

バイオインフォの手法でヒトの遺伝子を発見したという事例は今までありますか？

またヒトの遺伝子は３万種というのはどのようにして分かったのでしょうか？

ぐぐっても見つけられませんでした。

>>288
ベンターあたりが言ったんじゃないの？誰かソースを
張ってください。エロイ人。

そういえばヒトゲノム解析真っ盛りの頃のセレラ社は、
研究員の6割が情報系の人間だって新聞で見たような気が。

今は全員回顧。

古のヒトゲノム特集号(ねーちゃー)でも見れ。
さらにもっと詳しく調べてみるとゴニョゴニョな世界だが。

僕はねーちゃーんのヒトゲノムとの融合を目指したいです。

fu

294

295

ベクターをbioeditで書くとして、
どこからplasmidの配列データを手に入れるんですか？

ベクターデータベース。ちうか、ポリクローニングサイトだけあればいいんじゃ？

298

SVGA というと 800×600 ドットの解像度を指すことが多いですが、
　　　SVGA の本来の規格は、複数の解像度や色数に対応させたものを
　　　指すようです。

SVGA=support vector-based genetic algorithm ?

SVGA=スーパーベリーガンコアタマ

ＳＶＧＡ [svuga]
日本語ではスヴガと表記されることもある。
２つのアミノ酸の相同性が80%以上の場合、
２アミノ酸配列はＳＶＧＡであると言う。
主に、古細菌の一種であるMethanococcus furiosus.の
ゲノム比較をする際に用いられ、一般の生物には用いられない。

いわねえよ。

セリン・バリン・グアニン・アラニン

セリン・バリン・グアニン・アンニン

アンニン？

ｸﾞァ二ン？

この並びならグリシンでは。。。
と、つっこんでみる。

グリ芯

ＳＶＧＡ [svuga]
日本語ではスヴガと表記されることもある。
4残基のアミノ酸モチーフであり、
N末よりセリン・バリン・グリシン・アラニン
の順に並んでいる
生体内では、100反復以上のSVGA_REPEATSをもつ
アミノ酸が見いだされている。立体構造は
明らかになっていないが、
細胞膜近傍に局在していることから
細胞骨格の一種だと言われている。
とりわけ、高圧性細菌である
hewanella harveyでは全蛋白質の50%が
SVGA repeated proteinより構成されていると
言われており、耐圧性機構に関与していると言われている。

PROSITEのエントリ
-----------------
ID SVGA_REPEATS_1 ; PATTERN.
AC XX00345;
DE Actin family protein-1.
PA S-V-G-A.
-----------------

　ログを取得することにより、操作記録が残りますので、アクセス制御方針
　に基づいた計画と運用とのずれを発見できたり、インシデントが発生した
　時に、証拠資料として事象を残すことができます。

酢豚？
SVTA

大抵の事故原因は、人為的なものが多い。その主な要因として、危険を危険
と気付かない（感受性の欠如）、つい、うっかり、ぼんやり（注意力の欠如）
というのが大半を占める。加えて、危険を避けることへの意欲に欠けるとい
うこともな。

つまり危険が危ないということですね。

なるほど、例えば馬から落馬するということだな。

バイオインフォやってる企業についてネットで調べてみたら、
三菱○研、三菱ス○ース、三○情報、
日立○作所、日立○フト、イン○ォコム、
中電○ＴＩ、日鉄○立、日○ＨＰ・・・
が見つかったのですが、
実際に利益を上げているところって
あるのでしょうか？
学会とかでも上記の半分の企業は目にしないし・・・

>>316
サーベイが足りないぞ

ゲーム会社というのも良かろう。

任天堂
ソニー
マイクロソフト

>>316
未来創薬研究所もあるぞ

とりあえず大きめの会社ということで・・・

海外のソフトを売ってその使い方の講習会を開いているだけの会社も
入ってるんだが。ダイキンあたりも入れたらいいかもな。
バイオインフォ事業部が事業部単独で黒字かどうかなんて情報
調べてもわあんねぃよ

>>316
SIer上位の新日鉄○リューションズもやってるぞ。
黒字かどうか知らんけど。

すいません。では新日鉄○リューションズ追加でｗｗ
こういった企業でバイオインフォしている方々の
ご意見、感想とかないですか？

もう一歩でＣＮＳに届かなかった！
やった！姉妹紙に出せたぞ！
色々な人がいると思いますが、素晴らしい雑誌であることは間違いなし。
レビューの時のことや、実験の苦労話を語ろう

ｺﾞ爆ぽ

326

>>316
そのうちのいくつかは、ただのSIだぞ
研究じゃない

総研とかインテックW&G辺りは大学・産総研辺りの受託中心でしょ。
社内の仕事も色々あるのだと思うけど。内容は本人次第。
バイオの受託は研究者として仕事をすることを期待される場合が多い。
メーカー系もDB構築とかは少なさそうで面白そうな気がする。

　バイオメトリクスが普及してきた要因として、導入及びランニングコスト
　費用が安価になったことが挙げられますね。
　バイオメトリクス分野は日々研究されていますので、動向を追っていくと
　時代の流れについていけるかもしれません。

なんでいきなり、バイオメトリクスの話をするんですか？

訳分かんねーカタカナ学位なんてどれも一緒だろ

測定装置が高額のものもあります。
　　体調の変化などによって、本人を本人でないと誤認識する可能性があり
　　ます。
　　また、バイオメトリクス認証を利用するには生体的特徴の事前登録が必
　　要となりますので、生体を利用した認証に抵抗を感じる人がいることも
　　挙げられます。

その生体認証とやらの研究に生物屋はどれくらい寄与したと言うのだ。

生物屋は解析ぐらいしか出来ない能無しだろうが。

なるほど　生体認証を実用化したから情報屋は有能なわけだ　ぷげら
そもそも従来型のパスワード型認証のセキュリティーが脆弱なせいで、
生体認証が必要になったというのに・・・・コスト高も消費者に
押し付けて、責任もとらず、まったくいい気なもんだ。

バイオインフォマティクス博士
略して「バイ博」。ｶｯｺｲｲ

336

>>336
そこ買わされそうになったよｗ

システム生物医学が最高だとおもうよ

んなとこであそんでちゃダメだよ

システム生物医学がこれからバイオ界をリードするという演説を聴いた。
それに関わるバイオインフォマティックスが注目されるそうです。

>>339
フケツ
システムキッチンはホーロー仕上げが基本だろが

システム生物医学がこれからバイオ界をリードするという演説を聴いた。
それに関わるバイオインフォマティックスが注目されるそうです。
現場に根ざしたバイオインフォマティックスが世界を変えるそうです。

343

言うのはタダだからなぁ･･･

「現場に根ざした」→「現場主導の」だったら意味が通じるが。
根ざす・・・・ってなによ？

リードするのはいいが、
で、どれだけの成果を出しているの？

リードする・・・には、ミスリード・ミスディレクションも
含まれているからな。

システム生物医学は
今までの生物学、医学、バイオインフォマティクスと
どうちがうの？

雰囲気は数理生物学に似ている
俯瞰的な観察に重きをおいて、因果関係を追及しないあたりは
博物学に似ている

なるほど

要するに難しそうだけど大したことじゃないってこと？

難しくはない。やっていて面白いと思えるかどうかが最重要。

カプセル化(encapsulation) とは、オブジェクト指向で
　オブジェクト同士の独立性を高めるための方法です。
　データとメソッドをひとまとめにして、オブジェクトとして定義し、
　外部に対しては必要な情報（メッセージ）の交換だけとすることで
　独立性を高めます。

>>353
???

民間の中途採用ってほとんど見つからないのですが、
バイオインフォはオマケな企業ばかり？？

アカでもバイオインフォはオマケな所が多い。
DBの管理がメインで、得られたデータを利用させて
もらって「何かやってます」みたいな所とかね・・

教授を雇ってもその香具師が方々から使い捨て研究員を
連れて来てくるだけで、何らかの結果を出させては
last authorに収めてもらって辛うじて延命をしているとか・・

バイオ絡みの情報屋さんは気をつけた方がいいかもよ。

<356
ラボを選ぶときには気をつけようも
あるけど、ビジネスにしようとしているところに
対してはどう注意すればいいっすか？？
先日、日＠日＠って会社からバイオインフォ興味ないですか？
って電話がきてビビッタんですがｗｗ

>>356
漏れの知ってる教授は、データベースをマウスクリック
でちまちま調べて、タンパク質の一覧表を作るのを
バイオインフォとか抜かしてましたよｗ

>>357
ウチのラボにもバイオインフォの時々営業電話がかかってくるよ。
バイオインフォと言っても、シーケンス解析ソフトなんだけど
日＠日＠？　日○岩井のことですか？

<< 359
＠鉄＠立ですｗｗ
修活ちゅうに「説明会参加しませんか？」
だそうな。
バイオインフォ事業を伸ばすとか言ってました。
中規模のＳＩ会社です。
雰囲気はよさげでしたが。。

今、狙い目だょ。

そうですか

バイオインフォは興味なかったので
辞退しましたｗｗ
説明会の雰囲気はよさげでしたが

>>358
それこそまさにバイオインフォの真髄

naruhodo

今後、バイオの時代が来たとき
バイオインフォマティクスがその流れの切り込み隊長になっているのでしょうか？

363 名前：357 ：2005/08/07(日) 22:51:14
バイオインフォは興味なかったので
辞退しましたｗｗ
説明会の雰囲気はよさげでしたが


364 名前：名無しゲノムのクローンさん ：2005/08/08(月) 03:15:51
>>358
それこそまさにバイオインフォの真髄


365 名前：クオリア門前仲町 ：2005/08/08(月) 23:44:09
naruhodo



366 名前：名無しゲノムのクローンさん ：2005/08/09(火) 01:07:23
今後、バイオの時代が来たとき
バイオインフォマティクスがその流れの切り込み隊長になっているのでしょうか？

結論からいうと
切り込み隊長になるバイオインフォマティクスと
そうでないバイオインフォマティクスがある

小企業・ベンチャーが起業したり他社との競争力を増すときに、
バイオインフォマティクスがまったくなし、というのはありえない
かといって大手他社に外注やコンサル依頼ができるほど財務に
余裕があるのか？というとそれも疑問。

じゃあ自社でどこまでやる？クラスターマシンも商用のモデリングソフトも
ものすごく高い。起業したてのベンチャーには無理。
いまのバイオインフォ業界の欠点は、結局「大手」しか相手に
していないところ。大手製薬会社があと10年でさらに統廃合をすすめて
上場・中堅以上の会社の数が1/3に減ったらどうするつもりなんだろう？

A社には○社から10名
B社には▲社から5名
バイオインフォの人が業務提携出向してたとする。
A社とB社が合併して新会社Cができました！
A社には出向のほかにプロパーのバイオインフォマティシャンが10人
B社には出向のほかにプロパーのバイオインフォマティシャンが5人

さあ、合併後に何人生き残るでしょう？

3人

2人？？

正解は？

合併してtotalが20人以上の規模になることはまずないと思われ
武田ってバイオインフォそんなに何人もいないでしょ？

>>369
0名
だって社会のクズだもん

>>372
むしろ武田は業界の中でもその辺に力を入れていない部類に入るかと。

遺伝子のDNAのらせん構造を発見してノーベル賞を受賞した
　
　ワトソンもスパイを相当使って、情報を盗み実験をしたそうです。

おいおい、実名でそんなこと書き込んでると、
○○ソンに県警刑事一課強行犯係に通報されちゃうぞ。

バイオインフォマティクスで情報盗難、６件

R化学研究所から、研究用のデータサーバから
研究員の知らない間に、データが盗難されていた
ことが、10日の記者発表で明らかになった。
ログの解析によると、9日未明までに6件の不正アクセスが
認められ、実験データの所外への持ち出しが明らかになった。

同研究所に所属するバイオインフォマティクス技術者の
話によれば、「バイオインフォマティクス技術を使って
データの盗難が行われた世界初の事例だ」と胸を張っている。

これらの被害を受け、警視庁ハイテク犯罪対策総合センターは
10日から操作を始め、全国のバイオインフォマティクス技術者に
対して、不正アクセス禁止法違反などの疑いで捜査を始めた。

同研究所によると、被害は重要な実験データが含まれ、
推定被害総額は３千万円に達すると試算されている。なお、
これらのデータの中には、Winnyを使って
バイオインフォマティクス研究者が
丹念に収集したエロ動画も含まれるという。

>>374
そして、日本の他の製薬会社も、ほとんどが
「武田に習え」なんだよな。ってことは・・・？

>>378
少なくとも今はそんなことないよ。
武田は良くも悪くも特殊な会社だと思われているので、あまりあそこに習おうとはしていないと思う。

>>377
ソースプリィズ

>>377
最後ﾜﾛｽ

スキルスタンダードだって
http://www.bs-network.com/okayama-u/skill/index.html

383

< 316
日鉄○立はＳＩ企業だろ！
研究じゃなくていいなら選択肢の一つかも

385

お暇でしたら、
bioperl,biorubyの使い方を教えてください。
どのようなときに役立つのでしょうか？
忙しい方、荒しの方はスルーしてください。
よろしくお願いします。

タンパク質の一覧を作りたいとき。

なるほど

役立たず

>>387-389
さんくす

Thank you.

Biorubyの存在意義がまったくわからないのだけど、
（ﾀﾀﾞでさえマイナーなRuby言語を使う理由とか）
だれか教えてくれませんか。

いってみれば、こういうものはライブラリー的なものであって、
というか、ライブラリーそのもので、これを使って何をするかが重要なわけですよね。
つまり、既存のツールやライブラリがあっても不都合があって、Biorubyを使えば
劇的な改善を臨むことができるか、あるいは既存のツールではできないことができるようになる
という状況がないと、あえて多大な労力をかける意義がない、というのが
ソフトウェア工学の基礎の基礎だとおもうのですが、Biorubyを眺めていても
その辺のところが全然浮き上がってこないんですよ。
どなたか、詳しい人、教えてください。

日本発のという触れ込みで論文書いたり、助成金を
貰えたりして、某氏が幸せになる所に意義があります。

>>392
既存のありきたりのものの「単なる組合せ」であっても、
アプリを作る人が作りやすくて、
ユーザの要望にすばやくこたえてレスポンスできるのだったら、
それをアプリ開発のためのソフトウェア言語として選択する価値は
あると思うよ。
Tcl/Tk vs python vs ruby vs Perl
ドレが一番マシ？

そこから出てきたアプリはあるのか。
どんなユーザを対象にしてて、具体的にニーズはあるのか。
研究としてやる意義があるのか

ぬるぽ【NullPointerException】[Java・クラス・例外]

参照する変数がnullであるため処理を続行できなくなったときに
プログラムまたはJava仮想マシン(JVM)が送出するランタイム例外
ガベージコレクション(GC)のタイミング、処理が重いときや
JVMのバージョン等の影響で再現性なくこの例外が送出される場合がある

別名　　 なるぽ
類義語　ぬるり【NullReferenceException】[.NET・CLI・クラス・例外]

関連
null・Java・例外・ランタイム例外・変数・参照・Java仮想マシン・ガーベジコレクション

>>396
がっ！

ぬるぽ

>>395
アプリではなく、使い捨てのコードが必要な時に役にたったりする。
もっとも漏れはruby使ってないけど、がしがしコードを書く代りにライブラリ呼び出してワンライナー、楽そう。

"Perl"に対して"Ruby"っていう時点でアウト。
すごいセンスだ。いろいろな意味で。

>>399
使ってない時点で論外なんだけど。

>>400
それは、Biorubyに対する批判？それとも・・・

>>400
それってPerlをけなしてるの？それともRubyをけなしてるの？
どっちにもそれなりに欠点があるのはわかるが・・・

そういうRubyでライブラリを作ろうと考えることが理解できないと。

>>398
がっ！

やーいやーい

わーいわーい

ｋ大学強いよね

こわい。

バイオインフォ屋の主なお仕事
�@塩基配列・アミノ酸配列のデータベース化と相同性検索
�Aアミノ酸配列に基づいたタンパク質の立体構造と機能の予測
�B代謝経路マップの作成

�@と�Aは最近流行ってるからわかるんだけど、
代謝経路マップってどうやって作ってるの？
E-CELLプロジェクトみたいなので検証してるのかな。
生物板にこの手のスレが少ないのが残念。

東京化学同人とRocheを起点として、
こつこつとデータを作っているお方がいらっしゃる。

411

>>410
その表現は正しくない。
既存データをPC上に乗せてる、というのが正しい。
データ作ってるというのは、自分でKｍはかったりすることでしょ。

なるほど

Kmって何ですか？

つミカエリスメンテン

既存データをPCに乗せるために、いくら使ってるのよ。

遺伝研のこの分野での実力ってどうなの？

カナマイシン
kanamycin

カナマイシン耐性
kmr

419

420

>>409
E-CELLで検証なんてありえないっしょ

>>409
＞�@塩基配列・アミノ酸配列のデータベース化と相同性検索
日本では遺伝研DDBJのお仕事ですな。

＞�Aアミノ酸配列に基づいたタンパク質の立体構造と機能の予測
立体構造予測は何人か取り組んでる人がいます。
機能予測はどのレベルを指すかによるが、ab initioなのは皆無。

＞�B代謝経路マップの作成
ええ？KEGGのことかな？
部外者の意識ってそういうものなんだな。

　スプーリング(spooling) とは、プリンタでデータを出力する際に、
　いったん高速の補助記憶装置（ハードディスク）などに出力データを
　書き出しておくことで、他に実行しているプログラムの処理をスムーズに
　続けさせることを言います。

>>423
…資格スレの方が良くないか?

祝・隔離スレ復活

分子生物学＝バイオインフォマティックス

ゴラァ。分生を、下劣な学問と同格に扱うな。

>>423
スプーフィング（spoofing）とは？

　ビジネスの変革とは、問題認識だけでなく、その次の
ステップに踏み込まなければなりません。しかも、それ
は「改善」ではなく「改革」レベルが求められるのです。
また、社内の業務改革ではビジネスの変革にななりませ
ん。ビジネスとは、社外があって成り立つものであり、
つまり改革は社外を巻き込んだり、社外に貢献できる内
容でなければなりません。

プロジェクトマネジメントはサイエンスだと思い勝ちであるが、むしろ、アートの
要素の方が多いだろう。それは、経験を重視する人が多いことからよく分かる。
しかし、アート的な部分についても、単に経験をすればよいということではない。

扇子だよな

ページング方式では、プログラムをページ(page) という固定長の単位に
　分解して、補助記憶装置（ハードディスク）に入れておきます。
　プログラムを実行する時には、必要なページだけを主記憶にロード(road)
　して実行し、実行中に必要なページが主記憶にない場合は、いらないページ
　をハードディスクに戻して、必要なページを主記憶にロードします。

スワップ、スワッピング、ページフォルト、MMU・・・

ところで、主記憶に道があるんですか？

>>432
＞必要なページだけを主記憶にロード(road)

・・・ロード・・・・？

435

436

最近、本スレより隔離スレがにぎわってる件について。

賑わい

439

>>438
枯れ木も山の

枯れ木 → 枯葉

442

乙葉

444

東急電鉄と高秀秀信横浜市長の癒着
東急電鉄と往時の横浜市政の癒着は悪名高い。主に高秀秀信横浜市長（元建設事務次官）の在任中である（1990-2002年）。
癒着は東急電鉄の土地開発においてなされた。
東急が取った方法は、東急沿線の同社がすでに所有する土地の一部を横浜市に無料提供し、市はその土地を沿線地域の自治会館（町内会館）建設のためにさらに無料提供することだった。
市はその上物建設のために建設費の半分の補助金を出した。
東急電鉄は土地の無償提供で行政や地元を懐柔し、地主との交渉や区画整理を有利に進めた。
自治会（町内会）の役員にはだいたい古くからの有力地主が就いており、高秀市長にとっては市長選挙の際には自治会の推薦という形で選挙マシーンになり得る。
東急電鉄を中心とした三身一体の癒着構造がバブル時代に出来上がった
（「中田宏代議士出馬で昏迷。高秀秀信現職横浜市長と東急電鉄との癒着」東京アウトローズNo.10 2002年3月20日）。

>>445
それのなにが問題なんだ？
無私とはいわんが、公共のために十分貢献してるジャマイカ。
しかもなぜこのスレ？

自然言語処理の研究がしたいのですが
TOEICは何点くらい必要ですか？

TOEICの点数よりも君の自然言語処理能力の方が重要だと思う。

>>447
９４０てんくらいじゃね？

バイオインフォ ろ　集団遺伝学　の関係について

リエントラントとは、記憶領域を節約するために考えられたもので、
　　　あるプロセスが実行しているプログラムを他のところで、
　　　他のプロセスが同時に実行できるようにしたプログラムをいいます。

452

　　　　　　　　　　 ∩＿
　　　　　　　　　 　〈〈〈　ヽ
　　　　　　　　　　〈⊃　　}
　　 ∩＿＿＿∩　 |　　 |
　　 | ノ　　　　　 ヽ !　　 !
　　/　　●　　　● |　　/
　 |　　　　( _●_)　 ミ／ ＜こいつアホ？
　彡､　　　|∪|　　／
/　＿＿　 ヽノ　/
(＿＿＿）　　　/

何か言って欲しいことあるんじゃない？替わりに言ってあげたら...

455

>>454
く、くまー

東急リバブル・東急不動産不買運動と言ってください

なんで？

なんでだろー

悪事はたらいたのか？
トラブルか？
ライバルか？

Javaサーブレット(Java servlet) とは、HTTPなどを利用して呼び出され、
　Webサーバ側で実行されるアプレット（Javaプログラム）のことです。
　CGIのJavaバージョンと言ってもいいかもしれません。

バイオインフオはITリテラシー弱者を保護するための柵

くわしく

「ここを何の研究室だとおもってる?」

何でしょう

466

487

プロジェクト品質マネジメントはプロジェクトが取り組むべきニーズを満足するため
に、品質方針、品質目標、品質に対する責任を決定する母体組織のすべての活動から
なっています。母体組織のすべての活動という部分が他の知識エリアとは異なってい
ます。

469

470

受信者は、受信した平文にハッシュ関数をかけ、ハッシュ値を求めます。
　　また、署名データを送信者の公開鍵で復号して、ハッシュ値
　　（メッセージダイジェスト）を求め、２つのハッシュ値を比較します。

カレントディレクトリからパスを指定する方法を
　相対パス(relative path) と言います。つまり、現在のディレクトリから
　目的のファイル（ディレクトリ）までの道のりを表します。

なまもののにおいがしてくるのがいつになるのかたのしみにしているよ。

楽しみですね

・主張　青色ＬＥＤ訴訟 米国特許法では「追加報奨金」はゼロだ　田中朋之（米国カリフォルニア州弁護士・特許法）

日米の法律を比較してる。冒頭部分：

中村氏は、「日本は文系社会。個人を重んじず、大企業に『滅私奉公せい』というシステムだ」と日本社会を批判し、「日本の司法制度は腐ってる」と憤慨した。

日本の司法制度が腐ってるとはどういう意味か？　中村氏は「裁判官は用意した準備書面さえ読んでないのじゃないか」等と述べただけだった。
有能なエンジニアにアメリカ移住を勧める中村氏のことだから、日本の司法制度が発明者に不利で、
米国の司法制度ならば自分にとってもっと良い結果になった−−と、そういう意味にとるのが普通だろう。
米国メディアの報道も中村氏の唱える「日本では企業内の発明者を冷遇」という視点を守っている。

しかし、カリフォルニア州の弁護士である私にとって、中村氏が米国法の知識を踏まえてあのような発言をしたとは思えない。
それどころか、中村氏の主張こそが日本的な法的甘えそのものであり、米国の法的判断基準では、青色ＬＥＤ訴訟は中村氏の全面的敗北に終わったであろうと思えるのだ。

ONU(Optical Network Unit) は、DSU の光ファイバ版と考えれば
　　　良いでしょう。光回線を終端するための装置です。

477

>>475
米国法でも、あの判決はありえないよ。
つか、民事だからなあ。

中村教授は傲慢

中村教授は世間知らず

ですね

|￣￣￣￣￣￣|
| 次でﾎﾞｹて!　. |
|＿＿＿＿＿＿|
∧∧ ‖
(ﾟдﾟ) ‖
/　 づΦ
スレ主が待ってます。記念ｶｷｺしてね！
嵐ｫｹｰだがｷﾞｬｸﾞセンスなぃﾔｼ書き込み禁止('ε'*)

青色ＬＥＤって青なんだか赤なんだかどっちかはっきりしろよ。

はっきり白よ。

プロジェクトには最初不明確な点がたくさんあ
る。リスクが発生する原因になっているものはすべて不明確である。仕様が実現でき
るかどうか、要員がちゃんと確保できるかどうか、顧客が思ったとおりに対応してく
れるかどうかなど、挙げだせばきりがない。

486

東京急行電鉄、トラブル多発の日本航空と提携
東京急行電鉄はトラブル多発の日本航空とカード事業での提携を発表した（2005年10月3日）。
日本航空は2005年3月に、度重なる運航上のトラブルにより国土交通省から業務改善命令を受けた。
同年4月には国土交通省による立ち入り検査も行われた。しかし、その後も整備上のミス等、様々なトラブルが続発している
（「乱気流でコーヒー浴び男児大やけど、日航対応に問題」読売新聞2005年9月30日、「JAL機がまた無許可離陸、宮崎空港で23日に」読売新聞2005年9月26日）。
そのJALと東急電鉄の提携である。「類は友を呼ぶ」ということであろうか。
双方の企業風土に類似性が存在するのだろうか。「悪友を親しむ者は共に悪名を免る可らず」とも言われる（福沢諭吉「脱亜論」）。
今回の提携に東急電鉄の不誠実さを見ることもできる。元々、東急電鉄は日本エアシステムJASの筆頭株主であった。
しかし、グループのリストラ（東急建設への資本注入、東急百貨店の日本橋店閉鎖等）に追われて余裕がない東急電鉄が、日本航空に経営統合させた経緯がある。
JASを裏切った東急が今度は提携と節操のなさには呆れるほかない。
そもそもJALのトラブル続発はJASとの経営統合に端を発している。あまりにもカルチャーが違う企業同士の急な統合が現場で軋轢を生む結果となった。
JALの混乱も東急が元凶と言え、東急の罪は深い。

488

マイクロアレイのデータマイニング＆データ解析ビジュアライズにオススメのソフトを教えてください。
シリコンジェネティクスのジーンスプリング以外でお願いします。

　　　ADSL などで PPPoE(Point to Point Protocol over Ethernet)
　　　という言葉の見覚えがある方もいると思いますが、これは PPP を
　　　イーサネット上に設定するためのプロトコルです。

まんま。

ウイルスが、人間同士の間で感染するように変異す
る一つの可能性は、ヒト・インフルエンザにかかっている人間が鳥インフルエン
ザに感染して、体内でウイルスの遺伝子が一部入れ替わることだそうです。ヒト
・インフルエンザにもかからないよう、風邪気味も馬鹿にしてはいけません。季
節の変わりめです。みなさまもお体にご注意ください。

頭が弱いことを晒している文だな。
前半と後半はどう関係している？
頭の中で情報の組換えでも起きたのか？

バイオインフォの求人ってそんなにあるんですか？
検索してもあまりヒットしないので・・

ほとんどないんじゃない？米国でさえもポスドクあまりまくりで就職至難の技だし。

そうですね

求人は自分で作れ

CNSだせる本物のデータを、一年いないに出して
それを、あっさり明け渡して、自分で勝手に次の
ﾎﾟｽﾄﾞｸの口を見つけて消えてくれる人なら
引っ張りだこ。

>489

GeneSpringが不満でしたら、Avadisが良いかと思われます。
処理速度速いし、GeneSpringで可能なメニューは全部もってたし。(たぶん)
年間使用料制じゃなく買取りなのもお得。
フリートライアル版あるんで、試してみてはいかがでしょ？

>>499
レスどうもありがとうございます。さっそくフリートライアル試してみます。
他にもオススメのマイクロアレイデータ処理用ソフトがあればどなたか
教えてください。待ってます。

↑
さり気なくキリ番をさらって行く香具師

プロジェク
トチームである限り、まずはチームの業績があり、その業績によってまずは評価され
る。そして、その業績に対して、プロジェクトマネージャーをはじめとする各メンバ
ーがどのような貢献をしたかによって個人の業績は評価される。

へんなところで改行してるので、縦読みかと思ったよ。
「ぷとるー」？

個人やチームリーダのレベルにおいては、仕様項目単
位に計画対実績は管理されなければなりません。しかし
それは、あくまでも個人やチームリーダのレベルであっ
て、プロジェクトマネージャとしてはそれをグロスにし
て見なければならないのです。

マネージャーが無能でも実務者が有能なら
ｶﾊﾞｰできる。
逆はない。

そういう場合にはマネージャーを廃業して実務者に戻るしかないだろ。

そもそも生物学に大規模ﾌﾟﾛｼﾞｪｸﾄなんて必要ない。
お金に興味移ったｵｯｻﾝが国だまして金巻き上げてるだけ。

物理と違って馬鹿でかい
専門の施設はいらない。
ゲノム計画で買ったｼｰｸｴﾝｻｰだって、
他の実験にも使えるし、下取りにも出せる。

マークシート形式の模試で、なぜか回答欄が一つが足りなくなっちゃったな。
ズレを直そうにも、残り時間があと一分だ。そんな最悪な状況が展開されてい
る気がするのは、ボクだけ？

文献検索ってビジネスの方向としてはどうよ？

むしろ論文を受理させるビジネスは需要がありそうだぞ。
科研費吸い上げまくりw

文献検索関係の業績は、国際レベルでどれくらい評価されているの？
全く対等に競争できると思えないんだけど。
製薬会社にシステム提供できればそれで終わりなのか？

小さな世界。

文献検索だけでは研究が成立しないから、バイオ系の研究室にぶら下がって
お手伝いをしているだけなのでは？

だいたいデータマイニングで大きいビジネスなんて考えられないだろ。

>>508
ｼｰｸｴﾝｻｰの操作なんて、全自動洗濯機と
たいして違いないのに、ただのオペレータを
専門家のように扱ってしまった。
機械は下取りに出して有効利用できるけど、
そこに張り付いている人間には市場価値が
ないということ。自分達の虚像が壊れる
のを恐れる彼女たちはｼｰｸｴﾝｻｰからも理研
からも自分から離れようとはしない。
黒字出してる国の機関でさえ民営化するのに、
赤字垂れ流すだけの役立たずで嘘つきのｲﾝﾁｷ
研究所を維持していくなんて民間でも官でも
できないものはできない。

？？契約を更新していないが。

は?
くび?
どこいくの?
どこもいけんでしょ、
あんなｽｷﾙの低いいい加
減な仕事しかできんのに。

ですね

噂になってますよ〜

ttp://science4.2ch.net/test/read.cgi/life/1118062373/691

電脳妖精を発動させて噂を鎮火しないとだめですよ〜

献血ルームが女子高生であふれている
http://news.livedoor.com/webapp/journal/cid__1442778/detail?rd
おまいら、性病のチェック代わりに使い過ぎ。

そして未来予測

試験会場にキモヲタ集合
http://www.jbic.or.jp/bicert/
キモいヲタが就職率うｐの為に大集合
所詮、キモヲタはキモヲタ
メイド喫茶逝ってしまえ

　「ISO/IEC 15408 情報技術セキュリティ評価基準」は、情報技術セキュ
　　リティの観点から、情報技術に関連した製品およびシステムが適切に設
　　計され、その設計が正しく実装されているかどうかを評価するための
　　セキュリティ基準です。

灯台のBIの研究室ランキング作ったら一位はmoney久研でつか？

おいｗｗｗﾁｮﾝのHPがハッキングされてるぞｗ
1 ：姦国人：2005/10/22(土) 06:24:45 ID:litDG7lp0
おいｗｗｗサイバー独島がハッキングされてるぞｗ
http://www.dokdo.go.kr/kor/index.php
しかも流れてるBGMがｗｗﾃﾗﾜﾛｽｗｗｗｗｗ
http://www.dokdo.go.kr/kor/util/util_notice_list.php?b_idx=12841&mode=read&bcode=notice&category_id=

　　　　　　重くてみれない香具師に説明してやる
　　　　　　http://up.kabubu.net/cgi/img/8310.swf
　　　　　↑のFlashが韓国独島主張のHPを占領ｗｗｗｗｗ
　　　　　　ｸｫﾘﾃｨ高ｽｗｗｗｗｗｗｗｗｗ

まとめ
http://2chvipquality.seesaa.net/

あわわわ〜、大変ですよっ＞＜

http://science4.2ch.net/test/read.cgi/rikei/1077883321/658-659

何せ、１日遅れると億単位の金が吹っ飛ぶと言われる
プラント・プロジェクト。しかもこの方は、プロジェクト管理のソフトウェアパッケ
ージの開発も経験されているため、ITとプラントの両方が見えるので、両方で使える
知見を得られるのではないかと思ったのだ。

社会人以外は大学院に入っては行けません。とんでもないことになります。

http://d.hatena.ne.jp/dice-x/20041129

「東大で大学院に入るのは自殺行為、それ以外の大学で大学院に入れるのは殺人。」

（東大以外の）大学院担当教員のみなさん、院試の面接の際には、
まず「一生何もしなくても食っていけるくらいお家がお金持ちか」を訊き、
次に「食い扶持が十分稼げるサイドビジネスを持っているか」を訊き、
そのいずれでもない人には、ちゃんと「死ぬ覚悟があるか」と訊きましょう。
それを訊かないと殺人です。訊いたとしても自殺幇助ですが。
東大大学院の場合は、訊かなくてもいいですが、やはり自殺幇助です。
----------------------------------------------
博士が100人いる村
http://www.geocities.jp/dondokodon41412002/index.html

子供じゃないんだから自己責任だろ。何でも人のせいにしてるんじゃねえよ。

足の裏の米粒

そもそも大学院を就職予備校かなにかと勘違いしてるのが
まちがい。だが、大学院に行くくらいなら、
修士＋博士で５年じゃむりで、ふつうは６年くらいかかるから
それなら薬剤師とりに薬学部いくのが賢いと思います。

それこそ就職予備校だろ。

ですね

就職予備校かどうかはともかく、実家に金があろうがなかろうが
二流大学じゃ４年卒の８割がＮＥＥＴかフリーターなんだから
大学院に行くっていうと親は安心するよな。

バイオインフォマティクスセミナー開催のお知らせ

「明日使えるバイオインフォマティクス講座」
　最近注目されるバイオインフォマティクスですが、今回 日本バイオインフォマティクス学会のご協力を得てセミナーを開催します。
生物系、工学系研究者のみならず、新しい分野に触れてみたいという学生の皆さんなど多くのご参加をお待ちしております。

　　日時：　平成17年11月 5日(土) 14:00〜17:00
　　場所：　東北大学医学部臨床大講堂
　　　　講演１　「バイオインフォマティクス概論」　
　　　　　　　東京大学 医科学研究所 ヒトゲノム解析センター 機能解析イン・シリコ分野　中井　謙太　先生
　　　　講演２　「プロテインバイオインフォマティクスと創薬」
　　　　　　　産業技術総合研究所生命情報科学研究センター　広川 貴次　先生

　　問い合わせ先：　東北大学病院循環器内科　中山雅晴
　　E-mail: [email protected]
　　ＵＲＬ：　http://gonryo.med.tohoku.ac.jp/kyoushitsuinkai/bioinfo/
http://www.hosp.tohoku.ac.jp/top/topic.html

バイオインフォマティクス・・・
職にあぶれたプログラマーが集う分野よ

ttp://forza.cocolog-nifty.com/blog/cat1445519/
バイオインフォマティクス
RDBとグリッドコンピューターつかうだってさ、プ。
彼、いつの自体の人間？

こちとら、いわゆる理論屋なので彼らと
つきあうことはないが、
誰かが勘違いをとかないと、
ラボに有象無象が寄ってきそうだよ。

素人さんの一年前のブログを引用して「プ」とか言ってるよ！

言ってるね

病んでるのは、医学的にも生物学的にも、喫煙。

その通り

>>522
> 灯台のBIの研究室ランキング作ったら一位はmoney久研でつか？

作ってくれ！どこに行けば良いんだ！

そこで一体何を学ぶんだい？

バイオインフォに興味があり、ＫＯ理工の生命情報を考えているのですが
ここってどうなんでしょう？内容/研究の方向性は？またその先は？
（インフォは出来たら道具として使えるようになりたいと考えています）
知っている方いたら教えて下さい。もし場違いだったらすみません。

>>539
作ろう。ただはじめにノミネートされるのは十数の研究室しかないが。

>>540
学ぶ？
大学院は研究するところだ。勉強するところじゃない。
それを勘違いしてmoney久研に進んだ日には・・・・・・

大学院も、学生にとっては、（研究について）学ぶためのものではないのか？

実践的なオンザジョブトレーニングの場であるが，同時に
コンペティション・オーディションも行われているような
イメージでよいのではないか？単なるトレーニングだけでは
済まないし，そもそも文部科学省も大学も，「単なるトレー
ニング」のための予算はわずかしか措置していない．

money久研では修士の学生すら研究者として扱われる。
すなわち、自分でテーマを決めて自分でサクサク解析して、自分で論文を書く。
そして論文完成時に言われるのは、
「論文はこれでいいけど、これでドクターは取らせないから。次のテーマ決めて進めてよ」

「自分の会社の利潤だけを追求する会社というのは長続きしませんから。世のため人のために貢献してきたことの代償としてお金がもらえるシステムが会社です」
（門井大介「お客様へのサービスが先、利益は後からついてくる」ベンチャー通信13号、2005年、53頁）。

547

>>541
文献検索をやれ

それがいい

文献検索こそ、生物屋ができる唯一の計算機的手法。
それ以外の生物学的手法は混ぜるだけ。

混ぜた後、プロトコル通りに
暖めたり冷やしたりしないと
駄目だろ

そうですね

>>545
money久研のことは分かったが，ここって京大では？
東大のバイオインフォな研究室は？

東大にもmoney久研あるでよ。
論文がない助手ばかりで不安感を正直持つがｗ

555get

E-Cellってバイオインフォマティクスでしょうか？
ならばしつもんさせてくだあい
・日本語マニュアルの場所
・解析例
エロイ人、これらの情報ｷｳﾞｫﾝﾇ

E-cellはバイオインフォマティクスであるような
システムズバイオロジーであるよな。
いずれにしても、人の研究に乗っかった研究はスジが悪いよ。
＃特にE-cellじゃあ・・・。

パスウェイ・インフォマティクスのシンポジウムとか出てみれば？
http://www.biopax.org/japan_symposium/

>>548
どこで研究するのが賢明なの？

東大T木？産総F田？いっそＮＥＣA川？

それらはＸのグループ？

いや、マシなグループ。
他にもまだあるかなー。

>>559
まあそんなところかな。
文献検索に関わる業績で、国際的に競合できる
グループはあるのか？
うだつのあがらない情報屋がゲノムなら何とか
新しい業績になると思って参入している印象が
強いのだが・・・

>>562
文献検索以外の分野ではどうなのでしょうか？

文献検索の何が楽しいのでしょうか？

仕事が楽しくないのは当たり前。

文献検索ってモロぶら下がりじゃんｗ

>>565
世間知らず。

>>561
その人たちでマシなの？バイオインフォマティクスのレベルって．．．

>>568
あなたは、そこに書かれていない研究室で文献検索をやっている人でつか？
自分達が取り上げられないからといって妬まないように・・

やたらと流動的で競争が激しい分野だと聴くが、実際どうなの？
ビジネスとして技術移転しても、その時点で先を越している業績とかあれば
立場がないし・・
技術移転を実現するまでモタモタしているところは駄目ということでいいの？

文句があるならBioPaxでぼこぼこにすればいいじゃん。
五○さんもお台場に行くみたいだね。

>>569
>>568 はあまりに偉大なんでつよ。馬鹿な大学院生が自分は
優秀なんだと思いこんでいる哀れさに似ているｗ

でも文献検索、ニーズだけはたくさんあるぞ
俺はウェット系がメインの研究者（教員）だが
大学院生でまともに文献探せない、読めない、
アヤシィデータも鵜呑みにする香具師が続出
して困ってるからな

例えば、疾病に関係するタンパク質とリガンドや遺伝子変異の
ようなものがあるとき、文献検索から結果のコンセンサスが
取れているのかどうかだけでも分かると便利だということ？

>>571
それは卒業させた方も入学させた方も悪い。自分とこの学部1,2年でそれくらいできるようにすれば、他所の人間よりマシな筈。
>>572
結果のコンセンサスは、自分で(実験屋とのコラボで)取ればいいかと思うが、どうよ。

>>571
そんなことが文献検索をやるモチベーションかよｗ
それだったらバカ検索システムでも作って各大学
を相手にビジネスをした方がいいんでないかいｗ

薬学系でCOE取った大学は、
東大　http://www.u-tokyo.ac.jp/coe/list03_j.html
東北大　http://www.crescendo.pharm.tohoku.ac.jp/index.html
京都薬科　http://www.kyoto-phu.ac.jp/coe/ja/index.html
の３大学。

当方生物屋の学生だがついついbioinformatics sequence and analysis 2nd edition
を買ってしまった。
これくらいスラスラ読めて普通か?
んで入門書としてどう？

普通ですね

普通です

P. KarpがNAR誌上で、
KEGGを秘密主義的且つ間違いだらけのデータベース
（つまり、Gabage In Gabage Out, GIGO）であると指摘しているが、
反論は?

反論すべき点がない。

英語は苦手だけど頑張って読んでみます。
レスありがとうございました。

やってることはの○猫

なまねこ

猫ひろし

ぽーつます。ぽーつます。

586

587

まいやひー。まいやほー。

>>579
どういうこと？　詳しく、

KarpはKEGGのライバルじゃん。ライバルを引用して自分の利点を
協調するのは当たりませなんじゃ・・・

>>576
買う前にmedsiにメールしとけば良かったのに…

メダカを飼育しています。

水換え後も元気です。

沼エビは全滅してしまいました。

それにしても、クワガタ、カブトムシ、金魚、ザリガニ、メダカ。

長男に「ドジョウが欲しい」とせがまれています。

私は、イモリが欲しいです。

妻には、「もうだめっっ」と叱られております。

エビはなぁ、脱皮時に魚とか他の生き物に狙われるんだよぉ。

>>590
データベースなのにデータが間違ってると
いうのは、存在価値ゼロといってる
ようなもの。

外にあるデータを大金を費やしてデータベース化しやっているのだから、
責任はデータベースではなく、データを作った出版社と製薬会社にある。

全く的はずれな批判で不愉快だ。

要は国の金でデータベースを作った我々に責任はなく、
アホ研究者が出したデータが腐っているから
批判を受けているんだ

と自分の低脳さを棚に上げて自己弁護する馬鹿が１人誕生
こういう香具師はガソリンぶっかけてライターで火をつけるのが
日本国国民の利益にかなう
と2ﾁｬﾝﾈﾗｰ達は思った・・・けどそんなことは到底口にできない。
595に燃料を投下しちゃうからｗｗｗ

>>595
信頼できるデータだけを集めてこそ、価値のあるデータベースになるのでは。
もちろん、100%間違いの無いデータベースにしか価値がない、とは言わないけれど。

>>596
くだらん煽りをするような者は、自分でガソリンかぶって火をつければいいと思う。
くだらん煽りなどしていない、と思うのなら、釈明してみろ。

ここは597のオナニースレかしらー
２ｃｈでまともな議論汁やついねーよ
オフラインでしか吠えられないなんてｶﾜｲｿｳ
と2ﾁｬﾝﾈﾗｰ達は思った・・・けどそんなことは到底口にできない
キレた597が幼女犯罪を起こしちゃうからｗｗｗ

>>598
オフラインでしか吠えられないなんてｶﾜｲｿｳ

まさかマジレスが必要とは思わなかったが、>>595はどう見てもネタだろ
>>596-597はいわゆる「ネタにマジレス」状態なわけだがｗ

>>598
コンピューターの前で粘着乙ｗ

　　　　　　　　　　　　　　＿--　( ヽ、
　　　　　　　　　　　　／　　＿＿＼ ＼)ノ/ﾘ
　　　　　　　　　　／　　　 <＿＿　＼　＼／ノ
　　　　　　　　　/　　　／<＿＿　＼　＼　ﾍ /⌒/　　>>598 さん、あなたさぁ．．．
　　　　　　　　 /　　〆　　└--、ヽ、＼　-　＼　|
　　　　　　 　 ／ ﾚ＼　=ミ=、__/丶　　-　　　　　〉なんてゆうか．．．
　　　　　　　/ ﾝ/　　（- =、 >　<( ＼　　　　　　 |
　　　　　　　し/　 ﾐ 　 'ｰ--ヘ/　＼ﾐiヽ　　　　　{ 　言葉に説得力がないんだよね。
　　　　　　 ﾘ/ 　 /　 　 ン　/("ﾐ 、 、ﾍ　　　　　 > 、
　　　　　　　| 　　　／<.o　ｲ 　'ｰ ヾ /　>、　　∠／ヽﾍ　苦労したことのない人間が言う．．．
　　　　 ,.-／| 　　-=、_/　"|　　　_∠／　 ＼(⌒)　　 ﾉ　＼
　　 ／ |　＼ヽ 　　ヽ,-＼}　　 ∠ノ 　　　　　ヾ、　／　　　 ＼そう、「ウソ臭さ」
￣<　　 !　　`＼　　　　　　／＿＿＿　　　　＼／ ＼(
＿ ＼ 　 !　　　 > ー-- イ　 ＼_　　　￣￣＼_＼　　　　(　みたいなものを感じてしまうんですよ。
!　￣￣　ヽ　／{　　)＼　|　　　∠　　　　　　 ノ）ヽ、
　　　　　　 ＼　/⌒＼　〉　　￣　/　　　　　　 /　>＼
　　　　　　 　 ＼　い　/　　　　 /　　　　　　 /／ノ
　　　　　　　　　 ＼　/　　　　 /　　　　　　 / ／￣
堀之内九一郎（54歳）
株式会社生活創庫　代表取締役社長／年商50億

　　　　　く　　　マ　す　598 　　ヤ　　ｌ　　　　　　　　　　　　　　　ｊ　　出　出　キ
　　　　　　）　　ヌ　.る　 が　　ダ　　|　　　　 　 _......＿　　　　　〈　　 た　た　ャ
　　　　　ノ　　　ケ　と　 射　　あ　　ｉ、　　　／　　　　⌒ヽ　 　 ﾞｉ 　 ┃　　　 ハ
　　　　　ヽ　　　 ）　こ　 精　　　　　　〉　 ／　　　　　　　　ヽ　 　|.　 ┃　　　 ハ
　　　　　　}　　 （　　っ　　　　　　　　 |　 /　　　　　　ｨi ｉ　　 ｀、 ｊ　　 っ　　　 ハ
　　　　　　ｉ　　　）　.て　　　　　　　　 ｌ　 {　　 从　　ﾉイ!_ヽ ｆｉ ﾞｉ、）　！！
　　　　　 ﾉ　　　　　　　　　　　　　　　ｊ　丶、〈,ニ､ｲ　 {1 ﾞ〕ｉﾚ　 〉 ヽ
　　　　　∫　　 ！　　　　　　　　　 ／　　　} .{､⊥i　　　¨ ´|　 _（　 レ'⌒ヽ_ｒ-ｖ⌒
　　　　　　）　　　　　　　　　　　　 /　 　 　 ｊ　ゝ、　､’‐ｧ ／Ｖｰ―-- 、
　　　　　　⌒``' ‐'⌒⌒ヽ、_ノ⌒　　　　　　ヽ- ｆ ﾚｸｧﾆ'´／ | ヽ　 |　　＼
　　　　　　　　　　_,,...､､ｒ− ､　　　　　　　　,r'´ｆ! 　 ｸｖィ介ヽ|＜　 .i　　　 ＼
　　　　 ,ｨ⌒ｖ'´￣＿...,,ト､,_　ヽ　　　　　　　{　 |　　八 　｢.|　ｉ　/　ヽ＼　　　 ＼
　　　　 ｌ　　）)V'´　　　　　 ＼ ｉ　　　　　　　!　ｊ＿〈ヽゞ.､! .| | .ｊ　　　　|ヽ、　　　＼
　 　 　.{　　　/　　　　　　　　 八　　　　　　 ゞ＝-┤　＼{　}ﾚ’　 _,.....⊥､..ヽ　ヒ��
　　　　ｌ　　 ./　　!ｊｒ从ｖﾊｒn、ﾊ .ヽ　　　　　 ‖　　 |　　　ﾞV　 .／　　　　　　＼　ク
　 　 　 i　/ i'　　ｊｲ{ ｉ`　　|!_!|.| ヽ　＼　　　　|!　　　ﾄ、 　　　./　　　　　　　　　ヽ＼
　　　　 川　ヽ　ﾐ 亠’　　､ ｒュi　＼_ミｘ　　　ﾞi　　　| !ゞ　　　i　　　　　　　　　　 ヽ
　　　　　ﾚヽ、ヽト､　 <_フ=E, .|　　　　　　　　 ＼_ノ ｊヽ、　　|　　　　　　　　　　　 }
　　　　　　 __ヽﾙトｰ｀ｰｨｬく（.　ﾄn、　　　　　　　　　/　　　 �＝U从Ｗｎ　　　　　　ﾘ
ｒｎ⊂ヽ　/＾ヽ　 .ヽヽ /〈_〕 ト!ﾆﾉﾉ＼　　　　　　　 ./　　　ヒ　　ハ　ゞ| ﾞｉ　　　　　ｊ
トｒ　　}　|　　ヽ　　＞ヽ |. i ｊ ト、　　＼　　　　 　 〈、　　　　ク ッ .＼ｊ　 ゞｖｖｒ-_

　　ボクは598　　　　　　　　　　　　　　････
　　ｵﾀﾀﾀﾀﾀﾀﾀﾀﾀﾀﾀﾀﾀﾀﾀﾀﾀ･････　　　　∧＿∧
　　　　　　　　　　　　 へ　　　　　　　　 　（´<_｀　）
　　　　／￣￣￣￣＼ヽ￣￣￣￣￣￣⌒　　　　＼
　　　（　　人＿＿＿＿） ￣￣￣￣￣＼　　　　　　　 ）
　　　 |ミ/　　ー◎-◎-）　　　　　　　　 |、　　　　　ﾉ .|
　　　（６　　　　　(_　_)　）　　 　 　 　 　 |　　　　　　|　|
　　　 ｜　∴　ノ　　３　ﾉ　＿　　　　　　|　　　　　　|　|
　　　　 ＼＿＿＿＿_ノ　＿ E〕 　　 　　|　　　　　　|　|
　　　 （　　　　））＿＿＿〕＿＿E〕 　 　 |　　　　　　|_丿
　　　　|　　　　　　ヽ＿＿〕＿E〕　　　 　|　　/ヽ　　|
　　　　|_＿_＿＿＿＿＿＿）　　 　 　 　|　　|　|　　|
　　　 （三三三三三[□]三）. 　 　 　 　 |　　|　|　　|
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　　　　　／　　 　　　　　　　　　　　　　　　　　　　＼
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　　　/　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　 ヽ
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　　.|　　〉,,・^'' - .,, 　 　 　~ 　i　~　　　　__,,.- ＾`・､.〈　　|
./￣|　 /,／~ヽ､　　`'' ‐--‐ ,.| ､‐-‐'' "~　　 _ノ~＼,ヽ　|￣ヽ
| （` |　/ ヽ,,_____`‐-､_､..,,___ﾉ八ヽ___,,.._-‐_'"´___,, ノ ヽ .|'´） |
|　｝.| ./'　　 ＼二二・二../ ヽ　 / ヽ､二・二二／　　'ヽ | ｛　|
.| //| .|　　　　　　　　　 ／　|　 |.　＼　　　　　　　　　|　|ヽヽ|
.| .|　| .|　　　　　　　 ／　 　 |　 |. 　　 ＼　　　　　　　|　|　| .|
｜ヽ.|　|　　　　　　/　　　　 .|　 |. 　　　　ヽ　　　　　 .|　.|./ .|
　| 　.|　|　　　　　/　　　　　 |　 |　 　 　 　 ヽ　　　　 |　 |　/ 　 ／￣￣￣￣￣￣￣￣￣
　ヽ　.|　|　　　　/　　　　 　 .|　 |　　　　　　 ヽ　　　 |　 |　/　　|　　今夜のターゲットは>>598か
　　.ヽ.|　| 　 　/　　　　　'二〈___〉二` 　 　 　 ヽ 　　|　 |./　　＜ 　　はっきりいって阿保
　　　　|　|　　　　　　　　　　`-;-′　　　　　　　　　|　 |　　　　 |　
　　 　　iヽ|.　　　　　　,,... -‐"`‐"`'‐- ､、　　　　　|／i　　 　 　 ＼＿＿＿＿＿＿＿＿＿
　　　　 |　 ヽ　　　　 /...---‐‐‐‐‐----.ヽ　　　　/　 .|
　　 　　|　　 ヽ.　　　　,, -‐ ''"~ ~"'' ‐- ､　　　　/　　 |
　　　　.|　　　 ヽ　　　　　　　　 !　　　 　 　 　 ./　　　.|
　　　 ,,|　　　　　ヽ.　　 　 　 　 |　　　　 　 　./　　　　 |、
　　　 |＼.　　　　　ヽ　　　　　　　　　　　　／　　 　 ／.|
　　　.|.　　＼. 　 　 　ヽ､＿___　　　＿__／　　　 ／　　 .|

まぢでシネ氏ね死ね市ねしね士ね詩ね紙ね四ねｼﾈ刺ね私寝シネ誌ね４ね
市ね　　　　市ね　＿＿＿＿市ね　 　　　市ね スレスト 嘔吐
　　市ね　　　 ／∵∵∵∵∵ヽ　 市ね　　　　　　市ね　市ね　市ね市ね
　　　　　　／∵∵∵∵∵∵∵＼ 　　　　　市ね 　　　削除依頼
　市ね　/〃''　　’　　 '''ヾ　∵∵＼ 　　　　市ね 　削除　削除 ｺﾞﾙｧ　
市ね　 .|:-=o=-ヽ　-=o=-　　 ∵∵|　 ／￣￣￣￣￣￣￣￣￣￣￣￣￣
　　　｜::｡ﾟ::/　/　/:ﾟ;:｡;ﾟ｡ﾟ::｡　∵∵|＜　>>598、逝きる価値なし
市ね　｜ﾟ:｡ﾟ(_．_．人ﾟ:｡:;ﾟ｡ﾟ:｡::　:::6）|　　＼　ヴぇアー！　
　　　　ヽﾟ／,,ﾉﾉﾊヾヽ,＼｡ﾟ::ﾟ｡:｡　　　|　 　 ＼＿＿＿＿＿＿＿＿＿＿＿＿＿＿　
　獣姦　　＼　 |￣￣/.|　　　｡　　　/ 市ね 　　市ね　　市ね　　　　　　　　　市ね
市ね　　　　＼lヽ／ﾉ丿　　　　　 ／| 　　　市ね　　　市ね
　　吐血　　　　し∪/ﾉ＿＿_-／ 　　　　　　　市ね　　市ね
　　市ね　　　　　し ∪ 　　市ね もうだめぽ 発狂炸裂
　　　　　　　　市ね　　ｳﾝｺー！　絶滅２分前 　　措置入院
　　　市ね　　　　　　市ね　　　市ね 　市ねシネシネ市ね

>>598
　　　　　　　　　　　　　　卒卒卒卒　　　　　　　　　　　　
　　　　　　　　　　　　　　　卒卒卒　　　　　　　　　　　　
　　　　　　　　　　　　　　　卒卒卒　　　　　　　　　　　　
　　　卒卒卒卒卒低脳卒卒卒卒卒卒卒卒卒卒卒卒卒
　　　卒卒　　　　　　　　　　卒卒卒　　　　　　　　　卒卒
　　　　卒卒　　　　　　　　　卒卒卒　　　　　　　　卒卒
　　　　　卒卒卒卒卒卒卒卒卒卒卒卒卒馬鹿卒卒
　　　　　　　　　　　　　　　卒卒卒　　　　　　　　　　　　
　　　　　　　　　　　　　　　卒卒卒　　　　　　　　　　　　
　　　　　　　　　　　　　　　卒卒卒　　　　　　　　　　　　
　　　　　　　　　　　　　　　卒卒卒　　　　　　　　　　　　
　　　　　　　　　　　　　　　卒無卒　　　　　　　　　　　　
　　　　　　　　　　　　　　　卒職卒　　　　　　　　　　　　
　　　　　　　　　　　　　　　卒卒卒　　　　　　　　　　　　
　　　　　　　　　　　　　　　卒卒卒　

バイオインフォを一から学ぶには？
バイオインフォ系のベンチャーの行方は？
今後大きく発展するのか？？

などについてのご意見お願いします。

> バイオインフォを一から学ぶには？
読める本から全部読んでいく。
http://www.saiensu.co.jp/books-htm/ISBNsgc-41.htm
とか分かりやすい（他にも同等の本が５冊位ある。）
バイオインフォマティクスは情報科学の全ての知識を使う。
他に、シミュレーションもあるから物理や化学の知識も使う。
と言っても何でもできる人は殆ど居なけど。

> バイオインフォ系のベンチャーの行方は？
最近話題にならないねぇ。就職なら大手企業。

> 今後大きく発展するのか？？
相当長い目で見ればする。しかし、基本的にはたいしたお金にならない。

>>608
自分も初心者だから詳しくはわからんけど、
やっぱり大学行ったほうがいいと思うんだよね。
というわけで、アメリカの良いラボ等の情報教えてください。

英国だったらMRCとかSanger CentreとかCambridgeとかじゃない？

もうない。

SchemeやCommonLispがまずい理由を聞かせてくれ

遅い。どうしようもなく、遅い。

>>614
確かに

まー後で読むこと考えたら Perl よりは CommonLisp/Scheme がマシだろ？

SchemeはともかくCommonLispについては
perlでXMLはかせたほうがまだマシ、という
気がするのは漏れだけ？？？

まあ同意
俺だったらBioRuby

何故？

>>913
Lisp系がまずいという意味ではなく、
「Lisp系ばっかり並んでるYo...(超マイナーな)MLまで出てきたし・・・、ちょっと暴走ぎみかな？」
と思って書いた。インフォ系の人間としてやっていくには必要なんだろうとは思う。
文字列、db、数字いじるだけなら要らないといえばそうかも。

また宗教論争。。。

>>619
藻前は全スレをdb化でもしてるのか(w
ごっつひさしぶりに見たら漏れのカキコがサクッと出てきて、ムチャびびった。
本筋に関係ないのでsage

>>616
ML はネタですた、正直スマンカッタ

>>913
シム系段々と充実してきましたなあ。
OBIYagnsねらいでOBiGridの登録してみました。
##誰かばれたりそう。

システムバイオロジーの隔離スレ見れないんだけど、
どんな話があったの？
情報き盆ぬ

これでございますな？
ttp://giw.ims.u-tokyo.ac.jp/giw2005/

修論中でいそがしいじゃねーの？

バルタン星人がジャンケンで負けないようにするための補助具の開発

我々はバルタン星人がジャンケンで一方的に不利にならないように
するための補助具の開発に成功した．昭和40年代，祖国滅亡の危機に
瀕し，一時期全滅が危惧されていたバルタン星人は，その後の侵略政
策と他星への移民政策が功を奏して，現在では11億人程度まで人口が
回復したといわれている．その一方で，異星系における多指人種（＊
注：バルタン星系では指が四本以上ある人種をこう呼ぶ）との文化
交流において，武力衝突以外の問題解決手段の重要性が増しており，
いわゆる「じゃんけん」が使用される機会の増加が著しい．そこで我
々は，バルタン星人がじゃんけんでその身体的特徴により一方的に不利
にならず，かつじゃんけんの公平性を損なわないような補助具の開発
を行った．本製品は，もし適切な通商ルートが確立できれば，潜在的
な市場規模は７０億〜１２０億宇宙元であると試算されている．

目的も方法も間違っていない(あるいはもっともらしい）が
明らかにクライアントが不在の（開発者はいると主張している）
ツール開発の例．

一つ聞きたいのだが、
あなたの生命科学・生物学関連の研究にはクライアントがいますか？
何かの役に立ちますか？　それはどのような形で？　誰にとって？
それって自己満足じゃあないんですか？

っていう質問はどうだろう。

需要の無い研究には公的にも私的にも資本投下されない
（つまり研究の継続が不可能）のだから、需要の無い研究というものはもともと存在しない。

もしそのような研究があるのだったら、それは自己満足だからあくまで私的資金と自己責任によって
行うべき。

自己弁護に他の分野を巻き込んで迷惑をかけるな。

>>629
研究（純粋理学的基礎研究）と開発（工学的ツール開発）とを一緒に
してはいけない。
基礎研究には人類の知的好奇心の充足という需要がある。
それは役に立つかどうかを評価の基準としない。
「何かワカッタ気がする」という集団幻想を惹起すればよいか
または「なんかおもしろい」と思わせればよい。

需要のないツール開発には公的にも資本投下されない。
それは自己満足だ。

バイオインフォマティクスは、だから、純粋理学としての
知的好奇心を満たすための研究をするべきである。有用性
という判断基準の鎖を断ち切るべきである。

そういえば情報科学と情報工学という言葉があるな。
工学は役に立たなければいけないから評価がシビアだしつらいな。

工学と科学をわけるのは不可能だしナンセンス。
工学にも科学的要素が必要だし。基礎研究にも
目的はある。

工学と科学を区別したがるのは、
できの悪い基礎研究者のみ。
ほかの人にはメリットなし。

区別したがらないのも出来の悪い工学研究者のみ。

無意味な区別しない人が工学でも科学でも
結果を残す。

結果を残す人が工学と科学を区別しないとは限らない。

科学と工学を区別するひとは結果を残せない。

しつもーん。
若くて駆け出しのボスと、大御所のボスの研究室、どっちがいいかな。
この分野、就職ってボスのコネ必要？

どの分野でもコネがあれば就職は楽になる
だがコネを使って就職したら最後
ボスからの縁が切れなくなるのも事実
ボスはよく選んでね〜★

就職のことを第一に研究室を選んだ奴は必ず後で泣く、という話を
あちこちの大学で聞く。
くれぐれもご注意あれ。

>>637
逆だろ。純粋理学できっちり結果を残そうと思ったら、
「工学的な仕事」「工学的な分野」はかなり意識して排除しない
と一流にはなれない。
それから科学と工学の区別は簡単だ。
科学→"nothing new"が論文のrejectの理由になる
工学→"nothing new but useful"で論文がacceptになる
この差はめちゃめちゃ大きい。

逆に工学で一流になろうと思ったら
"usefulness""robustness"を極めなければ一流になれないだろうし
結局どちらでも中途半端な香具師らが
「科学」と「工学」は分けられない
とか甘えたことをいっているというのが現実なんだと
思う。そしてそれが現在のバイオインフォマティクスの
病巣となっているんだと思う。

誤解を避けるために付け加えるけど、漏れは「工学」「科学」どちらが上かなんて議論は
していないのでよろしく。
「工学」はusefulness有用性が判断基準のひとつとなり、それをつきつめるとクライアント
の多寡というポピュリズムの問題に行き着くので、純粋理学よりもはるかにしんどいだろう
な、と予想しているだけだ。

学生がどっかで聞きかじった話を鵜呑みにして
書き込みしても、現場で仕事してる人は
誰も同意しないよ。

正直匿名掲示板で「大きな話」をしたがる気持ちがわからん。
昔のアカの連中や、今のネットウヨク連中と同じノリなのだろうか。

僕頭悪いので分かりましぇん！って宣言したがる気持ちがわからん。

はいはい、僕ら頭悪くてわからないから、もうここでうざい話しないでね。

>>630
> 需要の無い研究には公的にも私的にも資本投下されない
> （つまり研究の継続が不可能）のだから、需要の無い研究というものはもともと存在しない。

ならバイオインフォ研究には需要ありまくりなんですね。なあんだ。


>>631
> 「何かワカッタ気がする」という集団幻想を惹起すればよいか
> または「なんかおもしろい」と思わせればよい。

つまりわかった気にならないのが問題だと？

> 需要のないツール開発には公的にも資本投下されない。

資本投下されてるようですが・・何か？

> バイオインフォマティクスは、だから、純粋理学としての
> 知的好奇心を満たすための研究をするべきである。有用性
> という判断基準の鎖を断ち切るべきである。

資本投資するひとの価値観でいいってことですかね？
とすると、有用性も一つの価値観でいいんじゃないすか。

「大きな話」をこういうところですると叩かれるのは、わからないから
ではなくて、いかにも書生的（実際には何もできないのに、あたかも
天下国家を動かせるかのように語る）に見えるから。
とマジレスしてみるテスト

照れ屋なんだから・・・

工学がクライアント多寡って逆だろ。
工学は応用範囲を絞るから、取りあえず
モデルを立てて解析可能に話をもってく
のは容易い。
だけど、その方法論の妥当性を検証し
ようとすれば、他の類似の仕事があれば
別だけど、新規の仕事ならサイエンスの
領域で演繹的手法を取らざるを得ない。
科学のクライアントは、現在の該当分野
だけではなくて、未来及び周辺分野に及ぶ。

就職するだけなら大ボス。
就職後10年後くらいに、ひょっとして
会社やめちゃうような可能性がある場合には
若くて今後のびるボスの方。
転職時の元ボスのコネっていう観点も取り入れ
るべし。退官したボスには転職コネがないことも。

生物しかしらない修士院生です。
ドクターからバイオインフォ系のラボに移ることは可能でしょうか？

楽勝です。
バイオインフォ系のラボには生物を全く知らないのに
バーチャルな机上の空論をこねまわしてる人たちばかり
ですので、あなたの実践的な生物学の知識や切り口は
強力な武器になるでしょう。
ただし、「自分はウェットの実験は苦手だからバイオイ
ンフォにうつる」という程度の考えだったら、やめといて
ください。生物学の実験のセンスがわるい人が、情報いじって
ても、ゴミの山しか築けません

分子出身のシミュレーターは大概使い物にならんぞ

>>654
「ｳｪｯﾄが上手い」人っていうのも
アレだけどwww

654みたいなこと言う人もいるけど、そういう人の尻馬に乗らず
謙虚にやっていくのが分野変更のコツ。
「こいつらはみんな何も分かってない」と思う状況になったときは、
大抵自分が一番何も分かってないものです。

バイオインフォの研究室でなかったら、
その手の仕事しようとしてもできない。
やろうとすれば、研究室移るしかない。
それが現実。

アドバイス＆励ましのお言葉ありがとうございます。
実験が苦手というよりバイオ分野の勉強が好きでコンピューターにも
興味があるので・・・・といった流れで気がついたらバイオインフォ
の勉強がしたい!!と思うようにｗ
ですが、現在バイオインフォのソフト系の会社の内定もあるので
迷っていますが（汗

サンクス！
そかー、企業でも出身研究室とか気にするのか。
教授の推薦とかで入社したりすんのかな？

営業職や技術職は気にしないな

バイオインフォから就職した場合ほとんどは研究職じゃなくて技術職で
しばしばSEさんと同じ部署に配属されるよ

バイオインフォのソフト系の会社ってどこだよ具体的に教えて。

人煮物頼む態度じゃない

世の中そんなに甘くない。＞東大京大ならどの研究室でもオッケー

若くて駆け出しのボスと、大御所のボスでとで研究内容変わるの？
やっぱ研究内容にもよるし論文出るようなところでないと
きついのでは？？　アカデミックの場合は特に

若くて駆け出しのボスと、大御所のボスでとで研究内容変わるの？
やっぱ研究内容にもよるし論文出るようなところでないと
きついのでは？？　アカデミックの場合は特に

灯台は怪しいところがあるから気をつけろ

バイオインフォの看板出していながら、そこの教授クラスが過去にデータを
いじったことがないというグループだと災厄だからな。
書物や論文を読んで知識があるだけでは駄目だからな、やはり経験的なもの
がないとデータは扱えない。

なるほどー。つまり実験チームと手組んでて論文も出せそうな
東大京大のどっかだったら大丈夫そうですな。
でも東大京大だったら大体R研とかと組んでるのではないのですか？

えっと京大って化研でしょ？あそこは実験と組むっていってもメタボロのひとたち
ばかりですよね？東大で実験と組んでるところってどこよ？

一昨年位に分生年会でJSBi主導のバイオインフォマティクスのワークショップがあっったとき、
会場にいた実に半数以上の聴衆が演題の中ほどで退席したのだが、そのとき
毅然として退席してゆく多くの人たちを見て、
「ああ、この人たちは研究に信念を持っている人たちだな」と頼もしく思った。
そして、残された面々を見て、「ああ、彼等は末期の不感症だな」とも思ったことを思い出した。

詳しく。

>672
さらに詳しく

その位付き合ってあげてもいいじゃないかという気もするが

サクラだけ残ったという可能性もある

>>676さん、
仰る通りです。ただ、彼等は他の実験系セッションを聞いても訳が分からないでしょうから、次のセッションのために
椅子を暖めてもらうのもいいかな、と思って眺めていました。

>>675
貴方がもし学生だったら（よもや助手クラスとは思わないが）、もう少し研究世界のしきたりについて
学ぶ必要がありますよ。

しきたり=芽のうちに潰す

まあフォーマットしてないディスクは使えないわけでw

しきたりも重要だろ？w　馴染めない人は鬱になる前に受け入れられるとこに移動。

昼飯につきあわなくなったら追い込み

OSのファイルシステムが変われば
古いフォーマットのディスクは
使えないけどな。

上位互換性あげ

東急不動産・東急リバブル不買運動Part2
賢い消費者の主張です
買ってはいけない東急リバブル東急不動産

ゲノム研究の最先端
ホワイトヘッド研究所に対抗すべくシルバーヘッド研究所が
新たなオーム解析のプロジェクトをこのほど立ち上げた。(ロイター)

なるほど

なんとかオームって名前だけ編み出して
中身の仕事は丸投げ。
金と成果は一つ残らず吸い上げる。

上位互換は新規開発の足をひっばる

>>687
詳しくお願いします

なるほど

オーム転がし@ge

バイオインフォの看板出していながら、そこの教授クラスが過去にデータを
いじったことがないというグループだと災厄だからな。
書物や論文を読んで知識があるだけでは駄目だからな、やはり経験的なもの
がないとデータは扱えない。

そこの教授クラスが過去にデータを「いじっただけ」
でも災厄の度合いは減らないよ
実験屋とコラボなりディスカッションなりして
一定の評価をうけていなければだめっす

「京都議定書で求められたようにCO2の排出量に関しては建築による影響がかなり大きいことを考えると、戦後の社会がつくり上げてきた土建国家のような勢いではもう建築はつつくられるべきではない」
（松岡拓公雄「建築の学生は団地再生に興味があるのか」月刊ウェンディ199号、2005年、9頁）。

楽しみだなｗ

バイオインフォマティクス ゲノム配列から機能解析へ 第2版
メディカル・サイエンス・インターナショナル
ISBN: 4895924262
第2版 2005/12/15

ttp://www.amazon.co.jp/exec/obidos/ASIN/4895924262/qid=1135929051/sr=8-1/ref=sr_8_xs_ap_i1_xgl/249-2327459-5397139

とりあえず、京大東大でいくつか候補を調べてみた。学科でみるとあんまり選択肢ないね…
ここはあかん/イイ！(・∀・)ってのあったら情報き盆ぬ。

京大 K久研
京大 Ak津研
京大 F研

東大 M野研
東大 新領域情報生命(いろいろあるね。ボスみんな若そう)

あと、人材養成プログラムってのもあるみたいだけど、
普通に研究室に入るのよりも何か(゜д゜)ウマーなのかな。
留学もできますみたいなことも書いてあったけど…
詳しい人お願い〜（´・ω・`)

自演

>京大 K久研
>京大 Ak津研
>京大 F研
>東大 M野研
>東大 新領域情報生命(いろいろあるね。ボスみんな若そう)
>あと、人材養成プログラムってのもあるみたいだけど、


はっはっは

全部ハズレ。いったら最後、アカポスの道は閉ざされる。ここいらのラボ
出身者の跡を追跡してみるが良い。

前にも出たが、このスレでよく叩かれているような研究室は
おおむね大丈夫だね。
本当に箸にも棒にもかからないような研究室の場合、>>699
みたいなことを言ってくれる奴さえいない。

>>697=>>700

>>699
と言って、あなたのｼｮｯﾊﾟｰｲ研究室に人を呼び込もうという戦略か？
そこは無難なところと思うが・・

灯台でもにわかに作ったような研究室があるが悲惨なものよ。
既存の分析法を拡張しただけで大騒ぎしているし・・
それも内輪だけでｗ

イコール厨になってまで東大京大を叩こうとしなくても。

>>703
叩くまでもないっしょ
事実なんだから

どの分野のスレでも、その分野での有名人は叩かれている。
単なる嫉妬のときもあれば学閥的な対立（T大系の人がK大系を貶めたり）
もあるし、学問的な対立のときもあれば私怨のときもある。
それを真に受けて地雷研に進まないように、とだけは忠告しておくよ。
まあ、当たり前のことだけどな。

「バイオインフォマティックス」とかいいながらデーターベース管理が主なところがあるな・・
特に情報系から参入してきたところとか、産学連携絡み。
単にデータを作り出したものを管理することが主体で、解析や分析となると既存のソフトへの
入力出力の繰り返しか、論文参照程度のところが多いかもね。
>>699あたりもやっていることは同(低)レベル・・・
やはり>>692がいうようにデータの扱いに対して突っ込んだ議論ができる環境の方がいいかもね。

あと文献検索システムのお手伝い程度で「バイオインフォマティックス研究」というのはありか？？
何でもありで野次馬臭くて、ちょっと不安な分野だな。

不安だね

？
>東大 M野研
>東大 新領域情報生命
はいい方でしょ。
灯台では、これ以外の地雷研に気をつけないといけないのでは？
明らかに流行りモノに便乗したような所とか・・・
まずはボスの研究業績を調べるのがいいかもね

この分野の研究はほとんどオモチャのレベルだな｡
毒にも薬にもならない｡
独創的論文を発表できる者が今の日本にいるのか?

「この分野」が生物学全体を指しているのなら、まあおっしゃる通りだなｗ

>>710
>「この分野」が生物学全体を指しているのなら、まあおっしゃる通りだなｗ

ほう。なるほど。じゃあバイオインフォなんとやらは生物学の蚊帳の外という御主張か。
なら分類はよく分からないけど別のカテゴリ（e.g. 情報システム、シミュレート）に移動したら如何?

多変量解析や統計の分かりやすい本ない？
バイオインフォっていっても数学に行き着くことが多いので・・

>>712さん、
新年早々感心なので質問を上げておきますが、そこら辺を的確に答えられる（若しくは解説できる）のは、
少なくともこの分野の人間ではありませんよ。それから、貴方が「数学」と思っているのは
工学的な応用数学の一分野だと思いますよ。

>>711
710はバイオインフォも含めて生物学全体が、と皮肉っているのでは？
と煽り合いにマジレスするテスト

>>713
その通り
バイオインフォ系の研究室のHPに研究概要が載せられていたり
するけど、勘違いなことを書いているところがあるね
統計解析と言えないようなことを「統計分析」とか書いていたり

他人の批判ばっかりしてないで、>>712に答えてあげたらどうかと思うが。
最近このスレ他人を貶めるだけのだけの評論家（≠研究者）が増えたな。

という漏れも>>712には答えていないわけだがｗ

「だけの」が重複しているのは見逃してくれorz

712 に対する答えの一例
まずアマゾンなどで、それらのキーワード検索すること。
日本語の専門書は訳本も含めて山ほどある｡
英語の本は当然もっと多い｡10冊ぐらい選ぶとよい｡
ただしこの分野の専門書は無味乾燥の記号が
羅列されていて退屈極まりない。

多変量解析なら、完全素人向けの入門書から入った方がいいような気がする。
ただ、そっちはそっちで数式を極端に削減していて、かえってわかりにくいという問題もある。

数式を見ても理解できない生物屋は諦めるしかない。

数式を見て理解できなかった後が真価を問われる場面だろう。
そこで数式を使える奴をうまく操縦できれば全く問題なし。
「数式だけをいじくってるような奴は生物屋じゃない」とか負け惜しみを言い出したらおしまい。

できないやつができるやつを操縦しよう
というのがおこがましい。

>>722
それがまさに今の姿

>>718さん
その10冊くらいある本の中でどれか一冊だけ
あえて指定するとしたらどれがおすすめですか？
独断と偏見で構いません

>724 誰も答えていないようなので。
ほんとに素人からなら岩波の「シリーズ入門統計的方法」
あとプログラミング言語の専門書も必要｡

どうもありがとうございました！

どういたしまして

「シリーズ入門統計的方法」は難しい（と言うか説明不足の）本が多いよ。
バイオインフォのは結構良いと思うけど。
数学の専門書の方が分かり易い。

あ、「統計科学のフロンティアシリーズ」と勘違いしてた。
「シリーズ入門統計的方法」は知らない。

「シリーズ入門統計的方法」は古い本だが、この分野の基礎は
ほとんど変らないので問題ない｡少なくとも統計解析ソフトを
使いこなしたり、自分のアイデアで研究したければ統計解析の
基礎知識は不可欠でしょうな｡

このスレもときどき役に立つ情報が発信されるから捨てがたいな（ｗ

統計解析ソフトってRのことだと思うけど、
言語としてMathematicaはどうですか？
http://itpro.nikkeibp.co.jp/article/NEWS/20051116/224709/
を読むと言語として相当良い感じなんだけど。
http://www.amazon.co.jp/o/ASIN/4434011189/
でも評価が高いらしいです。

値段が高いことを除けば相当いいらしい。

喫煙者はゴキブリ。

全く個人的なことだが、VMWareをバージョンアップしたら、
シリアルが期限切れで使えなくなってしまったよ。
まあ、シリアルを買えばいいし何とかならないではないのだが、
VMWareへの印象が悪くなった。

736

VMwareなんて今時使う必要ないでしょ。
WINEもcolnxもあるんだし。

フォールトトレラントとは、システム障害の発生確率を抑えるために、多
　重化つまり冗長性を持たせたコンピュータシステムのことです。

プリンタなどの処理速度の遅い周辺装置に多くの出力を行う場合、
　他に実行しているプログラムの処理が待たされてしまいます。

　この待たされる時間を短縮させるために、その出力データをいったん
　高速の補助記憶装置（ハードディスク）などに書き出しておくことで、
　スムーズにプログラムの処理を続けさせることをスプーリング(spooling)
　といいます。

　レーザープリンタなどには、実行中に「スプール中」と
　表示されたりするものもありますね。

740

情技の自習はよそでやれ

寂れてるんだから多めに見

大目に見よう

第５回創薬インフォマティクス研究会（日本薬学会・構造活性相関部会共催）
＝酵素阻害剤創製のためのBio-Chemo-Informatics＝

日時：2006年01月20日(金)13:00 〜 18:00
場所：東京大学医科学研究所1号館講堂
(東京都港区白金台4-6-1Tel 03-5793-4431)
事前登録 不要
参加費：JSBiおよび日本薬学会構
＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝
アジェンダ
ご挨拶 ：白井宏樹（アステラス製薬、創薬インフォマティクス研究
会主査）
第1部：酵素阻害剤創製のためのChemoinformatics, SBDD
座長：松末朋和（持田製薬）
・リガンド−タンパク質のドッキング・シミュレーション
　　　　平山令明（東海大学・医学部）
・創晶プロジェクトとバイオグリッドの連携による阻害剤開発に関
する研究
　　　　井上豪（大阪大学・工学部）
（休憩）
第2部：酵素阻害剤創製のためのBioinformatics
座長：廣明秀一（横浜市立大学）
・Atomic reconstruction of metabolism (ARM)
　　　　有田正規（東京大学大学院・新領域創製科学科）
・Enzyme catalytic mechanism database (EzCatDB)
　　　　長野希美（産業技術総合研究所・生命情報科学研究センター）

総合討論・総括：清水良（田辺製薬、日本薬学会構造活性相関部会）

UCSDの大学院ってどうですか？
知り合いのアメリカ人の神父さんも「すごく有名デス」といってた。

すいません、UCSDのbioinformaticsの大学院です。
ttp://bioinformatics.ucsd.edu/faculty/
とかみてもよくわからないので、なにか情報があれば
教えてください。きびしさとか。

UCSDは良い場所だと思うよ。教官も優秀。厳しさを気にするなら
アメリカなんか行くな。日本でもちょっと厳しい教官だと簡単に
めげるぞ、それでは。

>>746のリンク先を見る限り、実験系のみの人もまじってそうだけど、
ちゃんとインフォと実験の両方をやってるのかな？実際のところは
どんな感じなんでしょう？

レス大変ありがとうございます。

>747
2007年に入学しようとすると、今年末までに書類を送らないとだめらしいのですが、
よい場所だというのはきくのですが、具体的にどの研究室がどうとか、
そういうとっかかりがなくて、、、、

748>
そうやって見ていくんですかね。
私はコンピュータ系なので、748さんの書かれているとおり、
実験系の研究室は避けないとだめですね
（きらいというわけではまったくないのですが）

とりあえず、746のリストにあがっている人の名前を
順番にみていくことにします。

たびたびすいません。
> 私はコンピュータ系なので、748さんの書かれているとおり、
> 実験系の研究室は避けないとだめですね
上にこのように書きましたが、
748さんはそのようなことはかかれてないですね。
748さんがかかれたことをもとに私がそう考えました。
失礼しました。

自分の専門によって選ぶ教員全くちがうじゃん。
リンク先には配列から構造まで幅広くいるような。
コンピュータ系っていうだけではどの研究室なんて言えないよ。
普通は、大学院なら大学名で選ぶよりも指導教員で選ぶの
だから気になった人の過去の論文を2,3本ずつでも読んでみる
ものだと思うのですが。

そういえばUCSD Pascalって一度一世を風靡したよな！

古ぅー！
WizardyもUCSD Pascalだった。

749です。
リンク先をみてみまして、
Garrison Cottrell
Charles Elkan
という二方について論文等をみてみようとおもいます。
(写真は一応みてみましたが、Garrisonという方のほうが親しみがわいた)
いろいろありがとうございました。

がんがれ。
あそこにはいろいろと優秀な教員が多い。もし行くのなら、そこでの
見聞を広める（可能なら自分の研究室以外のセミナーに出てみるとか）と
良いよ。配列、構造、システムと楽しく・真面目に頑張っておいでよ〜。

頑張ります

757

先日GenomeNetのサイト内に人事採用情報があったので見てみたのですが、
[KEGG人事採用情報]
http://www.genome.ad.jp/Japanese/jobs_J.html
（以下一部抜粋）
技術者・研究補助者
1. 仕事内容：KEGG データベース開発
2. 応募資格：週５日の勤務ができる方、理系の大学卒またはその他の大学卒（音楽、デザイン、編集等も歓迎）
3. 待　　遇：交通費支給、社会保険完備、年休有
4. 勤務場所：京都大学宇治キャンパス（宇治市五ヶ庄）または東京大学白金キャンパス（港区白金台）
5. 雇用形態：契約社員
(ここまで)

2.の応募資格の音楽のスキルは研究用データベース開発と関係ない恣意的な要素だと思うのですが、
第三者的に本当に妥当な求人なのですか?

また、バイオインフォマティクスセンターのリンクから、KEGGのスタッフを見てみたら、ほとんど女性と思われる
のですが、データベース開発、またはキュレーションの業務適性と性別は関係ないと思うのですが、なぜですか?
[スタッフリスト]
http://kanehisa.kuicr.kyoto-u.ac.jp/people_J.html

これには、触れてはいけないカラクリがあるのでしょうか?
どなたかお願いします。

貴方のお書きになったレスにおいて、「また」の前と後は、
貴方が薄々感づいていらっしゃるように、「原因」と「結果」の関係にあります。
「目的」については、お察しのとおりとしか言えません。

年末のためだ。

>>759,760
どうもありがとうございました。

なんかこの研究室は迂闊に深入りするとヤバそうですね。
今後はあまり近づかないようにしたいと思います。

>>760
年末って、年末調整ですか？
それって、普通、コピー用紙とか文房具とか消耗品でやるものじゃないんですか？

バレエのビデオもみんなに見せちゃうもんね。

・・・公然で見せて良いモノと悪いモノの区別が出来なくなってる？！

>>762
決まっているだろ、クリスマスコンサートの為だよ。

>>764
へ？コンサートって、一般的に想像するあれですよね？
すいません、それってデータベース開発とか、研究とかとどう関係しているんですか？

君みたいな下々の者がエリートのすることに口を出す必要はこれっぽっちもないから気にしないでいいよ。

>>766
少し聞きすぎたみたいですね。すいません。

でも、不適正なら糾弾されるべきなんじゃないんですか？
たとえエリートだからって例外ではないでしょう。

例外をエリートって言うんだよ。覚えておきな。

>>768
何か理不尽ですけど、とりあえず納得しときます。

島国の中の島国根性のなせる技

>>765
実質コンサートで、いちおうクリスマスパーティってなっているね。
アルバムをみるべし。

>>771
クリスマスパーティーもコンサートも開催する事自体はおかしいとは思いませんが、
それを>>758 の求人の要件に含めるのは･･･いえ、もういいです。

何のために代謝系データベースなんか作っていると思っているんだ？

>>773
え〜と、かなりうろ覚えなんですが、たしかゲノム情報にもとづく細胞情報の可視化…だったかな？
それでどこかの製薬会社の代謝地図をもとにGIF絵を入力したとか。

違ってます？

本気でそう思っているのか？？

もう一度、よーく >>758 を見てみろ。

>>775
？？ちょっとにわかには真意を測りかねるのですが、
KEGGの開発、維持、管理とは、データベースではなく、このスタッフグループ自体の
開発、維持、管理を指していると仰りたいのでしょうか？

マジレスすると、彼女らは「KEGGガール」と呼ばれておる。

あそこは北朝鮮ですからね。
単純に将軍様のための喜び組の募集ですね。

それで、女性でありかつ音楽が出来ることが条件である理由が説明が付く。
せいぜい、喜ばせ。

>>777
なるほど･･･KEGGにはKyoto何とか以外に
K(リーダーの名前) Empress Girls Group みたいな意味もあったのですね･･･
いずれにしろ、関係ないことに首突っ込み過ぎたようなので、もう自分の研究に戻ります。

いろいろ有り難う御座いました。

まあ世の中には知らなくてもいいことのほうが多い。
下賎な者はおとなしく解析していればいいだけのことだよ。

ここの書き込みには悪意を感じる。
事実かどうかは調べてみればわかることだ。

だから、誰か調べて報告してくれない？

スパイを送るということか？
音楽ができる女性見てる？

>>781
悪意どころかみんな控えめじゃない。
Ｋ研のＯＢでなくてもKEGGの10周年パーティに出たりするだけで
分かるじゃない。

そんなところに潤沢なお金がつぎ込まれるのはなぜ？

だいたい、何でオペラ座の怪人を教授が歌うんだ？

ちょ、おま、それ･･･

くわしく？

Parlの入門として↓はどんなもんでしょう？
http://www.amazon.co.jp/exec/obidos/ASIN/487311103X/ref=lm_lb_6/250-3492769-4765818
C、Javaは多少使えます。
現在生物の勉強をしてるんですが、バイオインフォマティクスに進む予定です。
やっぱParlは覚えておくに越したことはないですよね？

↑突っ込まれない内に訂正します・・・
×Parl
○Perl

あぁ、俺は馬鹿だなぁ。

馬鹿なあなたには Perlは無理なので ruby をお勧めする

>>788
その本、褒めてる人もいるにはいるけど、漏れはあんまり良くないと感じた。
記述が中途半端なのと、日本語訳が下手なのとで。

記述は古いが既存のバイオインフォマティクスツールをざっと知るにはいい本かもしれない
perlを覚えたいんなら、ちゃんとperlの本を読むべき
perlだろうがjavaだろうが出来ることはあまり変わらないと思うがどうか？

訳者のなまえがばかっぽいよね
原書の翻訳にいちいちペンネームつかうあたりの
自意識過剰さがものすげぇイタイ
本人をしっているひとがいたら晒しちゃってくれ

>>790-793
なるほど。
まずはプログラミングPerlで勉強してみます。
参考になりました。ありがとうございました。

どういたしまして

読み返してみた。perlの本としては必要最低限以下の事しか書いていないと思う。
perlがわかっていれば、バイオインフォでのperlの使い方はこんなもんか という感覚はつかめるかも知れない
ぎゃくに、こんなもんでいいんだと安心してしまっても行けない気もする。

射影(projection)とは、関係データベースで用いられる演算の１つで
　表の中から特定の列だけを取り出すことを言います。

　関係データベースの代表的な演算として、選択・射影・結合があります。
　具体的に例を挙げた方が分かりやすいと思うので、やってみましょう。

>>794
最初に覚えるならPERLはどーかな?
本格的なコンパイル言語をマスターした後で
スクリプト言語の有り難みを知るというのが
流れのような気がします。

キットサイエンスに慣れきったバイオ系なんて、混ぜてスイッチ押すだけしかできないんだから
機械扱いの基準で理系・文系を分けるとしたら、バイオ系は理系に分類したくなくなるぞ

それをなぜこのスレに書くｗ

ぷ

> デッドロックとは、二つ以上のプロセスが互いに資源の解放を待ちあって、
> 硬直状態となることです。
> デッドロックを回避する一つの方法は、リソースの取得順番を
> 統一することです。

803

エラーの発見率を調べる方法としては、２つのグループに分かれて
　　　テストを行い、それぞれのエラーの発見率から全体のエラーを推定する
　　　方法などがあります。

　　　あまり実用的な方法ではないと思いますが、意図的にプログラムの中に
　　　エラーを埋め込み、発見されたエラーと埋め込んだエラーの割合から
　　　エラーの発見率を求める方法（バグ埋め込み法）もあります。

本当に実用的でない方法ですね。

そうだね

システム開発においては、全体の期間を幾つかの開発工程に分割し、
　それぞれの始めと終わりを明確にすることが有効であり、
　その中である意思決定をする時点をマイルストーンという。

パケットには、データをインターネットでやり取りするために必要な
　「ヘッダ」と呼ばれる情報が付加されています。

　パケットフィルタリング型ファイアウォールでは、このヘッダ情報から得
　られる送信元IPアドレス、宛先IPアドレス、TCPやUDPといったプロトコル
　種別、ポート番号などを指定して、あらかじめ設定したルール（ACL）に
　従ってパケットを選別し、許可／拒否といった処理を行います。

　これにより、外部ネットワークと内部ネットワークの通信において、不正
　な通信を出入り口で防御することができます。

未確定な部分がある場合は
　　　まず機能を確定させるための作業を受託し、その後に確定した機能を
　　　請負契約で受託して開発を行うのが、リスクが少なくなります。

そんなことばかりを得意気にかきこんでいると、
この業界にいる学生が高々資本情報処理程度の知識しか持ち合わせていないことが
ばれますよ。

>>810
$mesg = s/資本/基本/g;
print;

いかん、つい代入してしまった。
>>810
$mesg =~ s/資本/基本/g;
print;

グダグダにもほどがあるｗ

>>812 何語？

>812
println $mesg;

sed -e 's/資本/基本/g'
perl -ne 's/資本/基本/g'

まちがえた

sed -e 's/資本/基本/g'
perl -pe 's/資本/基本/g'

みなさん、お久しぶりです。
夏ごろここでお世話になりました、異化研のN＃研志望だった者です。

先週卒論発表が終わり、重荷が取れました。
夏はこのスレッドで皆さんの貴重な意見を賜り、
最終的にN＃研の受験を辞退する決心をしました。

進路は結局この4月からは某公立高校の生物の非常勤講師として
勤めることになりました。

非常勤という不安定な立場ですが未来を担う高校生に生物のよさを分かってもらえるように努力します。

今回のことでN＃先生やK下先生というすばらしい先生のことを知ることができよかったです。
そして力及ばないことを諭して下さった皆様にとても感謝しております。

やはりあのブログが濃すぎるのか・・・

多数のプロセスが開始・終了を繰り返すうちに、連続した空き領域が少
　　なくなり、未使用領域が断片的に発生します。

　　このような状態に陥ると、メモリ領域の新たな確保、走査に時間がかか
　　るため、コンピュータのパフォーマンスが低下する傾向にあります。

>>820 最後の文の主語を答えなさい。

>>821
パフォーマンス

ワークステーションが必ずしもサーバと言うことではありません。
　　　基本的にはサーバの方がクライアントよりも高性能なマシンが
　　　使われますが、最近のパソコンなら十分サーバの役割が果たせます。

　　　例えば、自宅で余ったPCをサーバにして、ホームページを
　　　公開している人もけっこういます。

DMZを設置することにより、社内ネットワークと物理的に分離することが
　　でき、万一、DMZ上サーバが攻撃を受けたとしても、適切にACLが設定さ
　　れていれば社内ネットワークへの侵入を食い止めることができます。

>>758-787 続きを・・　誰か・・

　↑
これって、妬みじゃないの？？

ともったけど、>>758のリンク先を見ると現実だ・・（どんより）

Q. 「どんより」を使って短文を作りなさい。


A.　うどんより、そばが好きだ。

面白い

温故知新という奴ですか

楽しい国語厨はAA板に帰れ

スクリプト　とは。。。

　　インタープリタ形式のプログラムのことです。

　　スクリプトはそのプロセスを自動化して簡単にプログラムを実行できま
　　す。

　　通常、プログラムはプログラマの書いたソースコードをもとにコンピュ
　　ータの理解できる機械語に変換されて実行されます。

バイオ研究が人類を幸福に導くなんてウソでしょ

私は幸せですがなにか？

>>833
だろうね。歩くゴシップライターさん。
あなた自身の話はネタにもならないね。

Q. 「うってかわって」を使って短文を作りなさい。

A.　彼は麻薬をうってかわってしまった。

システムバイオロジーとバイオインフォってどう違うのですか？
教えて、ｴﾛｲ人。

別次元だな。

>>836
バイオインフォは生命情報の解析やDB構築のための方法論の研究。
システムバイオはあくまでリアルの生物を対象に、細胞周期や代謝系
といったシステムの挙動を研究する。
これまでの分子生物学の研究でシステムと逝ってるのは、より下位の
サブシステムを研究していたと思えばよい。分子生物学だと、基本は
個別の分子の性質の研究か、もしくはシステムと逝っても、数個の
タンパクがくっついたり離れたりという議論で終わる。

例えばある病気なんかの研究で、関連してそうな遺伝子の挙動を
100個とか1000個のオーダーで実際の生物で研究するのは、システム
バイオに入れていいんじゃないかな。
前にScienceに出てた、シミュレーションと実験からアポトーシスの応答を
予測する数値的なモデルを作ったなんていうのは、まさにシステムバイオ。

>バイオインフォは生命情報の解析やDB構築のための方法論の研究。

という定義を勝手に作ったのが、システムバイオロジーの人。
本来は、

＞リアルの生物を対象に、細胞周期や代謝系
＞といったシステムの挙動を研究する。

の部分まで、バイオインフォマティクスに含まれるべきものだった。
また、マクロレベルでの挙動に関しては、古来から遺伝学で研究されており
分子レベルでも生化学で研究されてきている。

新しい言葉に飛びつく役人のために、常に新しい造語の必要に迫られ
それらしく体裁を整えたのが、システムバイオロジーに過ぎない。

＞例えばある病気なんかの研究で、関連してそうな遺伝子の挙動を
＞100個とか1000個のオーダーで実際の生物で研究するのは、

これなんてまさに、技術の発展に伴う分子生物学の、あるいはゲノム情報学の
一片鱗に過ぎない。したがって

>シミュレーションと実験からアポトーシスの応答を
>予測する数値的なモデルを作ったなんていうのは、

システムバイオロジーなんていう造語ができる20年も前から、
この手のシミュレーションは盛んに行われていたわけだ。


なーんて言われたらどう反論するのかな？

↑と吼えたところで、役人達が飛びついてくれた時点で
潮流はすでに定まりました。長い反論乙。

＞の部分まで、バイオインフォマティクスに含まれるべきものだった。

含まれなくていいよー。その結果、moneyが久しい先生とかが
勘違いして毎年豪勢にクリスマスパーティ開催するわ、あほみたく
サーバーに金掛けちゃうわ。

システムバイオロジーが有名無実だということを
認めてる訳なんだな

有名友実ですが、何か？これからは分子生物学が
システムバイオロジーに取って代わられるんだお（^ω^）
分子生物学にしがみついてる人達は予算取れずに
ソルジャーになるんだお（^ω^）

有名有実

シスバにチャネラ多し。（要注意）

yanokenもチャネラーなんか？

大証が東京で個人投資家向けのセミナーを開く。
これまでソフトフロント，ブロードバンドタワー，三光ソフラン爆騰のきっかけとなったいわくつきのセミナー。
今度はプレシジョンが出てくる。ＤＮＡ分析装置作ってて，最近材料出て人気。セミナーでもうひとつ出るか。
セミナーの後，新興株好きでオフでもしませんか？
　　大証の案内↓
http://hercules.ose.or.jp/topics/ir_rounge20060422.html

かつてのバイオインフォスレでは「システムバイオロジーのネタは荒れる」が
共通認識だったはずなのだが、すっかり忘れられていたようだな。
そしてやっぱり荒れるｗ

そうですね

どうでもいい

そうか？

日本でシステムバイオロジーといえば誰ですか？
無知なオイラに教えてください。

ttp://www.jst.go.jp/erato/project/kks2_P/kks2_P-j.html

バイオインフォマティクスベンチャーってどう？
医薬分子○計研究所、ダイ○コム、メデ○ビック、・・・

医薬分子以下略は元々バイオインフォじゃなかったけどな。

そうですね

いまは？

どうでしょう

応答時間やターンアラウンドタイムは、ユーザの視点に立った
　　　性能評価指標です。

　　　システム運用管理者は、スループットなどを評価指標としますね。

そうですか

結合度が強い順
・制御パラメタを引数として渡し，モジュールの実行順序を制御す
る方式。
・必要なデータだけを外部宣言して共有する。
・共通域に定義したデータを，関係するモジュールが参照する。

セグメントはページとは異なり大きさを変更できる。
仮想記憶方式でページを複数個まとめたものをセグメントという。

それなりに異質な分野なせいなのか、断続的に新しい読者が来て、そのたびに
「今まで誰も語っていないようだが（と本人は思っている）、バイオインフォ
とやらに物申す！」みたいになるのは理系専門板的には正直つらいっす。


ここの>>1の投球不買ってﾅﾆ？

東急リバブル東急不動産の不買をする運動です

フェールセーフとは、システムの一部に故障が発生した場合に
　　　システムが安全な方向に向かうように設計しておき、
　　　被害の拡がりを最小限に防ごうとする方法をいいます。

　　　システム構成の例ならデュアルシステムがこれに当たります。
　　　Windows のセーフモードもそうです。

　　　フェールソフトは、無理をして続けると言うイメージで、
　　　フェールセーフは、無理せず休むと言うイメージです。

エイプリルフールにさむいネタをメーリングリストで送るのは止めたらどうだ？
と、誰かあいつに伝えてくれ。

今年もエイプリルフールなのかぁ？
確かに毎年寒いネタをやってくれるんでわからんが、
co.jpドメインでセミナー紹介みたいなのをやってるので
本当かもしれない。

もしこれがエイプリルフールなら、ちょっとやりすぎだと思うが。
というかフィッシングだわな。

リピータ　とは。。。
　　物理層のプロトコルでLAN間接続を行う装置で、信号を増幅します。
　　１つのポートに流れるデータが残りの全てのポートにも流れてしまうた
　　め、ネットワークの使用効率が良くなく、セキュリティ上望ましくあり
　　ません。
　　また、ブロードキャストも通過してしまうため、ネットワークに負荷を
　　かけてしまいます。

え？

リピータって何度も来てくれる顧客のことだろ。

Perlを使いたいのですが何から勉強すればよいですか？
初心者です。
オススメ本教えてください。

このへん
ttp://takenaka-akio.cool.ne.jp/doc/perl_kiso/index.html
ttp://www.lr.pi.titech.ac.jp/~abekawa/perl/perl_lecture.html
ttp://www.tohoho-web.com/wwwperl.htm
ttp://www.kent-web.com/perl/index.html

>>871
4月からバイオインフォの研究室に入った新人ならperlの講習会くらいあるんじゃないの？

Schemeは？

ありがとうございます。

ゲノムデータの配列処理をPerlを使って解析したいと思っています。
GenBankファイルのアノテーション情報etc
必要な部分を抽出する解析をおこないたいと思っています。
基本はWetですが色々と必要になると思うので少し勉強したいと思っています。

まさかN＃研？？ｗ

まさかです。

N＃研とはなんですか？
全然そのような研究室ではありません。
wet系なのでインフォは独学です。

>>878よ

>>195-286 >>818　あたりを見よ。
N＃研のすごさが分かるだろ。
インフォはwetの片手までできるような生易しいものではない。
N＃先生やK下先生のようなすばらしい先生につかないと大成できないのだ。

マイクロアレイのことならオペロン　バイオテクノロジーにお問い合わせ
ください。とてもリーズナブルな価格かつ技術担当からの適切かつ迅速な
対応をいたします。

>>879
何年も前から、議論が進まないな

N＃研ナンバー１！！

「流出のパターンは、「公」のデータを「私」のパソコンで扱ったために起きている」（「ネット社会の倫理確立を」沖縄タイムス2006年3月18日）。

K下先生のブログどこ行った？

なんてタイトルだったっけ？
ハテナに引越ししたんだっけ？

Today's dinner

とにかくエネルギー療法で治癒したければ、あるいは能力を開発したければ、リラ
ックスし素直に受けることである。
それが出来ない人は、はっきりとお断りさせていただく。
お互い時間は限られているし、不愉快な思いはしたくないのだから…。

888

889

　　　　 　 ('(ﾟ∀ﾟ∩_　おいらをどこかのスレに送って！
　　　　　　／ヽ 　 〈／＼　お別れの時にはお土産を持たせてね！
　　　　 ／|￣￣￣|.＼／
　　　 　 　| .ﾓﾂ煮..|／
　　　　　　 ￣￣￣
現在の所持品：たばこ・ライター・コーヒー・ブラックブラック・枕・ケータイ電話
睡眠薬・聖教新聞 ・ダッチワイフ・外付けSCSI340MHDD・ネットランナー4月号
TYG02・小嶋進社長・ゲルトモ・ディプスファンタジア・抵抗1kΩ(黄紫橙金)・媚薬
バーボン・メシマズ嫁のお手製弁当・吉牛の割引券・木刀・アバンテ･クレイモア
Ｍ２４ＳＷＳ・カレー ・納豆ﾁｬｰﾊﾝ・ウッドベース ・重力子放射線射出装置
V2ガンダムAB・ZGMF-X20A・ADFX-01・E-767・南部煎餅

ITエンジニアの求人は堅調で、好調を持続しそうです。
特にキーワードとなりそうなものは、セキュリティ、金融、
Web系開発言語などです。セキュリティエンジニア需要の背景には、
今年4月に施行された個人情報保護法を受け、情報セキュリティに
対する関心の高まりがあります。いまや情報漏洩は会社存亡に関わる
問題ともいわれており、今後も企業の投資は続くでしょう。
金融は特に電子決済市場の広がりに向けたカード業界でのエンジニア需要が
高まっています。キャッシュレス化に向けたシステム投資も当面続き
そうです。ほか、証券、銀行など金融業務知識をもったエンジニアの
求人は今後も継続的に寄せられそうです。

ブリリア代官山プレステージの駐車場問題
ブリリア代官山プレステージの駐車場台数は110台とするが、「一部事業
協力者所有含む」とある。等価交換の元地主所有分が含まれている。マ
ンションの駐車場については株式会社ヒューザーも不明朗な権利設定を
していると非難されている（「小嶋社長の悪ラツ駐車場代二重取り」週
刊大衆2006年2月6日号、山岡俊介「マンション住民から駐車場代金を二
重取りしていた!? 　ヒューザー・小嶋進社長」ストレイ・ドッグ2006年
1月1日、「識者に聞く、耐震偽装物件・ヒューザー設定の専用使用権」
マンション管理新聞673号（2006年4月15日））。ヒューザーは姉歯秀次
元建築士らによる耐震強度偽装物件の建築主である。
駐車場110台の内訳は平置9台、機械式100台、身障者用1台である。駐車
場の9割以上が機械式である。「機械式の駐車場は最悪で、非常にメンテ
ナンス費用がかかり、管理料金がバカにならない」（河北義則『３年間、
家を買うのはやめなさい！』ダイヤモンド社、1999年、217頁）。
http://www.geocities.jp/shouhishahogo/news.htm

893

。　　　　　　　　　　　　　　　　　　

。

。

。

全身の血液が大量の酸素とアドレナリンを脳細胞の末端にまで送り込み、細胞レベルのシナプスは発光しそうなほど活性化していた。

す、凄く寒い状況になってる…
MLに寒いネタ、と言えないぐらいこっちが寒いのは気のせいだろうか。

?

投球不買君はなんでここにいすわってる？

何故でしょう

一般的なDoS攻撃は、リモート攻撃者に乗っ取られた感染PCであるボット
　のネットワークが、標的となるユーザーのウェブサーバやネームサーバ、
　メールサーバなどに大量のクエリを送信するという方法で行われます。

>>903
ほ〜、なるほど。
じゃ、最近のDDoS攻撃事例で君の印象に残った奴を教えてよ。

JAPの靖国神社攻撃

もうだめかもしらんね

家のドアがあいたので、嫁さんが帰ってきたと思ったんだ。
「うーん、うーん、さびしかったよー」と言いながら、抱きついて胸に顔をうずめてフリフリした。
おとなしかったので顔をよーくみたら、嫁さんの妹だった。
「うわー、ごめん」とすぐに離れたんだが、妹さんは「いえ…」と言いながら顔を真っ赤にしてた。

コピペ乙

>>905
>JAPの靖国神社攻撃

おぉ!! 確かに(手法はさておき)興味深い事例でしたね。では、どのサービスが
どういったソフトでどの様に攻撃されたんでしょうねぇ?
そしてそれらの攻撃に対する現状における対応は?ルーターで対処できたりしますか?

Ｆ５キー連打じゃないですか

911

912

913

914

http://science4.2ch.net/test/read.cgi/life/1094051380/
資格板【資格】ﾊﾞｲｵｲﾝﾌｫﾏﾃｨｸｽ技術者認定制度【新設】
全然盛り上ってないんですけど、人気ないんすかね

人気ないです

917

といいつつ、動向が気になっている>>916

情報処理技術者試験だって人気なしなのに
なにをか言わんやだな

「BICERT過去問題集（平成17年度版）」

JBICでは、平成16年と17年の2回にわたりバイオインフォマティクス技術者認定
制度（BICERT）2級検定試験を実施して参りました。本年度も10月29日（日）
（予定）に２級検定試験を実施いたします。

JBICでは、過去問題集（2ヵ年分の過去問題と正解番号を掲載）を販売しており
ますのでご興味のある方は、下記ウェブサイトをご覧ください。

http://www.jbic.or.jp/bicert/

社団法人バイオ産業情報化コンソーシアム　バイオITセンター
JBiC(JAPAN BIOLOGICAL INFORMATICS CONSORTIUM）

わざわざ、お金払って烏合の衆の仲間入り
することに何の意味がある?

この話題が出るたびに異常反応する人がいるのは何故なのか
考えてみましょう。

産業として確立されてないのに、資格商法なんて
ポスドク一万人と同じく改革を逆手にとった
悪質な囲い込みだからじゃない?

いや、漏れが言っているのは>>923のような反応のことなのだがｗ
この世界も結構勢力争いが激しいので、jbic関係者に敵愾心でも
持ってるのかな、と思ってね。

むしろそういう意見をここで集めてみたら?
自分は誰々の被害者だと思っていても、証拠がなくて、という人も多いだろうから。
その人の勘違いであるならそれも明らかになるし。

>>924
>勢力争い
詳細！

題名の通りかなりやばい状況です＞＜
ハマグリについてなのですが
１エサの食べ方
２消化の流れ
３成長方法
４生殖方法
５血管系について
６神経系について
をできれば教えていただきたいｍ(＿）ｍ
ｸﾞｸﾞってもいいものが見つからず困っています
お願いします！！

>>927
とりあえず氏んでみたら？

>>927
　ﾜﾛﾀ
　スレ違いでは？


私も質問。ＢＩＣＥＲＴのインフォマティクス試験２級ですが、情報処理に関する分野の問題は、情報処理系の資格だとどのくらいのレベルなのでしょうか？
初級シスアドくらい？基本情報処理くらい？もっと上かな？
教えてください　<（＿　＿）>

ハマグリについてなのですが

４生殖方法


それをきいちゃうの？ｗ

>>927
１の食べ方なら
http://gourmet.biglobe.ne.jp/cgi-bin/recipe_sozai_search.cgi?order=code&skip=0&image=yes&sozai0=%A4%CF%A4%DE%A4%B0%A4%EA&cond=and
に５件ヒットしたよ。

東急不動産システム障害
東急不動産でシステム障害が発生した。2006年4月3日（月）20：55頃〜5月11日（木）14
：35頃までの間、Webサイト上の資料請求フォーム内のプログラムの停止により、「送
信」ボタンを押しても、資料請求者のパソコンから情報が送信されず、それにもかかわら
ず「資料請求のお礼」のメッセージが表示される障害が発生した（東急不動産株式会社
「資料請求プログラムの障害について」2006年5月17日）。障害自体も問題であるが、一
週間以上も障害が継続したことは粗末である。
資料請求に障害が発生した可能性がある物件は以下の通りである（センターフィールド浦
和美園、(仮称)ブランズ美しの森プロジェクト、ブランズ調布、ブランズ上大岡、ブラン
ズ文京本駒込、ブランズ平和台、ブランズ中野上ノ原、シーサイドコート鎌倉若宮大路、
クオリア荻窪、アルス習志野大久保、アルス桜上水、あすみが丘東、ミルクリークヴィレ
ッジ、東急ニューシティ あすみが丘、あすみが丘プレステージ、東急季美の森、ブラン
ズガーデン南大沢、アルス吹田穂波公園、ブランズ甲子園一楽荘、ブランズ大和高田、ア
ルスひばりが丘、アルス月寒中央通、アルス平岸ステーションフロント）。
キャピタルマークタワー　セレクトプラン

933

個人情報の漏洩事件が続発し、新聞やテレビ、雑誌などのメディアでも連日報
道され、企業など法人でのセキュリティ対策が注目されています。これら重要な
データを暗号化しておくことが、重要情報の漏洩防止に有効な手段となります。

935

936

ウイルス対策ソフト(anti-virus software)とは、コンピュータウイルスに
　感染したファイルを検出し、除去を行うためのソフトウェアです。

　検出には、ウイルス定義ファイル（パターンファイル）と呼ばれる
　検知するための情報とパソコン内のファイルを１つずつ比較していき、
　ウイルスを検出します。

　ウイルス対策ソフトは、ワクチンソフト、アンチウイルスソフトと呼ぶのが
　一般的ですね。

そうですね

バイオインフォマティクスって何を調べるものなの？

第11回システムバイオロジー研究会

2006年6月30日（金）13:00-18:00

「様々な生物におけるゲノムネットワーク」


近年、様々な生物システムにおいて、遺伝子制御ネットワークの構造が細胞の安定性や分化・増殖といった
細胞運命の決定に大きな役割を担うことが明らかに なってきました。フィードバック制御をはじめとした、
これらの制御ネットワー クは、細菌の代謝システムから、哺乳類の発生まで多層的に普遍的に見られ、
生物現象の本質を理解するためには、そのシステム制御のメカニズムを知ることが ますます重要になって
きています。本会では、転写制御ネットワークを対象に、 細菌の代謝および酵母の転写相互作用ネットワークを
招待講演としてお話いただ くと共に、これらの生物現象をシステムレベルで理解するために必要な
理論・情報科学研究者からの発表を広く募ります。

「酵母ツーハイブリッド法による転写因子ネットワーク解析」
日立酵母ツーハイブリッド(Y2H)システムは、Y2H系を自動化・ハイスループット 化することにより、
高速・大規模なタンパク質間相互作用解析を可能にしたシス テムである。また本システムは、
独自の特異性確認実験と5万回以上のスクリー ニングにより蓄積されたデータの統計処理による徹底した
偽陽性排除が特長であ り、精度の高いデータを産出することが可能である。このY2Hシステムにより
1600種類以上と推定されるヒト転写調節因子と相互作用するタンパク質の網羅的 な探索・同定を目標に、
大規模ネットワーク解析を実施している。現在、すでに 700種類を越える転写調節因子について解析を進めており、
今回の発表では、解 析した転写調節因子の中から核内受容体を中心に解析結果を報告する。
なお、本研究はゲノムネットワークプロジェクトの一部として文部科学省より委 託を受けて実施しているものである。

刑法では、データの改ざんや消去といった行為が行われた場合は、
　　処罰の対象になりますが、こういった犯罪の下見としてネットワークに
　　侵入したり、覗き見にとどまる場合は、処罰の対象になりません。

　　不正アクセス禁止法は、この犯罪の前段階にあたる行為を罰するものです。

　　つまり、具体的な被害が発生していなくても、権限を持たない者が、
　　他者のサイトにネットワークを介して勝手にアクセスする行為や、それを
　　助長する行為などを罰することが可能となります。

942

ユニコード(Unicode) とは、パソコンでのデータ交換を円滑にするために
　世界中の文字を２バイトで表そうという狙いで作られた文字コードです。

　ただ、日本語、中国語、韓国語で微妙に違う漢字に同じコードを
　割り当てていたりするので、まだまだ問題点が残っている文字コードです。

944

945

女友達が「知り合いでのあんたこと好きって人がいるんだけど」
「え！だれ？だれ？」って聞くと「飯奢りなさい」・・・女って意味わからんね
で、ファミレスで奢ると「さて、誰でしょう？」ってクイズ形式
「もう帰るぞ」って切れ気味で言うといきなりキスしてきた
そんで「これがヒント」だって・・・わかんねーよ
アホらしくて帰宅・・・早く誰か教えろっつの

答えがわかったらこちらで教えてくれ↓
http://hobby7.2ch.net/test/read.cgi/point/1146442166/

学会で常にボスと歩いてる香具師のことか
はげ頭ペロペロ

みっともないね

　　　＃バブルソートは、隣り合う要素を比較して、大小の順が逆であれば、
　　　＃それらの要素を入れ替えるという操作を繰り返して行う方法である。

思ったような結果が出ない。スケジュールが遅れていく。その一方で締め切りは
動かない。さらにはある程度開発が進んでから「ここはこうしたほうがいい、ああ
したほうがいい」ということも分かってきて、仕様が変更される。仕様が変われば
関連する部分はやり直しだ。また締め切りがきつくなる‥‥最後に破滅がくる。プ
ロジェクトの失敗だ。

>>947 あの女キモイ、むしずがはしる

データ構造の表現方法の１つに「木構造」というものがあります。
　木構造は、ある要素と他の要素を親子関係で表し、
　ちょうど植物の木をひっくり返したような図で表します。

毎日毎日、日本中で個人情報関連の事故・事件が発生しています。
　　　昨年度は、企業が自ら発表または新聞等で報道された事故・事件は、なんと
　　　約１,０００件。経済産業省に届けられた事故・事件（公表・報道されないものを含む）
は、昨年上期（４〜９月）だけで５００件。他の省庁分は不明ですが、恐らく金融庁
には山ほど届出があったと思われます（行政処分も２件あり）。原因は様々ですが、
紛失/盗難・誤送信などうっかりミス、不注意が多くを占めています。私たちも他所
の出来事と他人事に思っているといつ被害者・加害者になるか分かりません。

新スレ
http://science4.2ch.net/test/read.cgi/life/1150724036/l1

おまいら文政でなんか出す？

確かに新スレの時期ではあるが、東急不買で立てるなｗ

クライアントをWebブラウザにすると，HTTP通信経由で画面イメージはHT
MLデータ，システムへの指示はURLとパラメータでやりとりできるように
なります。画面の項目変更などが発生しても，Webサーバ側のプログラム
ロジックを修正するだけでよいので，クライアント側の保守作業は小さ
くなります。

JRAM（JIPDEC Risk Analysis Method）
　　　日本情報処理開発協会（JIPDEC）が、1992年に開発した手法で、JRAM
　　　質問表を用いて組織がどのような脆弱性を有しているかを分析すると
　　　いうアプローチ方法とJRAM自己分析シートを用いて現実に発生した事
　　　故や損失から問題を明らかにするアプローチ手法とがあります。

　　　その後、JIPDECでは、JISQ2001などを踏まえつつ、近年の情報ネット
　　　ワーク環境を前提とした新たなリスクマネジメント手法の調査・研究
　　　を進め、その結果をJRMS(JIPDEC Risk Management System/JRAM2002)
　　　として2003年3月に公表しました。

DHTML（DynamicHTML）は，ユーザのキーボード，マウスの操作やその他
の状況に応じて，文章のレイアウトや内容を変化させるための技術です。
画像の上にマウスポインタを移動して画像ファイルを入れ替えたり，テ
キストボックスに入力した文字列を検査してメッセージを出力したりす
るなど，Webサーバと都度通信せずに，ブラウザ上で動きをつけることが
可能になります。

リスクが顕在化したときの予想損失額を算出するなどの定量的分析は、非
　常に重要なプロセスですが、みなさんご存知のように、情報セキュリティ
　は、予算があればセキュリティが維持できるといったものではありません。

　セキュリティに対するコストと損失のリスクのバランスを考慮し、セキュ
　リティ対策を立てて行かなければなりません。

　予算を出したから、あとは、情報システム部がセキュリティを維持してく
　れるだろうなどと考えている経営陣は、言語道断ですね。

悪文の典型。論文を書いたことがない人に違いない。

スラッシングが発生しているときは，主記憶装置と補助記憶装置との間
でページの入れ替えが激しく行なわれています。主記憶装置のメモリ読
み書きは高速ですが，補助記憶装置は主記憶装置に比べて桁違いに遅い
ため，時間的なロスが大きくなります。このとき CPU は，ページング処
理に時間を割いてしまうので，アプリケーション自体の CPU占有率は低
くなっている点に注意しましょう。

第二次世界大戦後、日本は様々な国家的技術開発プロジェクトを立ち上げたが、ものにな
ったものはほとんどない。「YS-11」旅客機、原子力船「むつ」、高速増殖炉「もんじ
ゅ」、サンシャイン計画にシグマ計画に第五世代コンピューター、短距離離着陸機「飛
鳥」に「スーパーテクノライナー」などなど。その根本には、いたずらに国費を使ってハ
イテクばかりを追いかけ、誰もが便利に使えるものを作るという視点が欠如していたよう
に思える。

＞「YS-11」旅客機


これは成功例だろw

EDI(Electronic Data Interchange) とは、
　インターネットなどの通信ネットワークを用いて、
　企業間で見積書や発注書、請求書など、取引に関するデータを
　電子的にやりとりする仕組みを言います。

このスレで「オムロン」と書き込みするとおみくじができます
http://ex13.2ch.net/test/read.cgi/mlb/1149732685/

　↑
バーボンハウス

文献検索の未来はどうよ？

将来性はあります

970

971

SCSI(Small Computer System Interface) とは、パソコンに
　　　ハードディスクや CD-ROM 、CD-R(CD Recordable) や
　　　CD-RW(CD ReWritable)、MO、スキャナなどを接続するための規格です。

　　　複数の周辺機器を SCSI を用いて接続するときには、
　　　下のように数珠つなぎ状態にします。

フェールセーフ(fail safe)とは、システムの一部に故障が発生した場合に
　システムが安全な方向に向かうように設計しておき、
　被害の拡がりを最小限に防ごうとする方法をいいます。

　システム構成の例ならデュアルシステムに該当します。
　Windows のセーフモードもそうです。

リモート端末とアクセスサーバ間でのユーザ認証は、アクセスサーバで実
　現可能ですが、リモート端末の利用者が多かったり、異なる支店、営業店
　など、複数のアクセスサーバを利用する必要があるときは、管理が煩雑に
　なりますので、セキュリティ上、脆弱になってしまいます。

さっそくかい！（藁

さっそくです

てすと

リアルタイム構造化分析技法は、システム内でのデータと制御の流れに焦点
　　をあてたもので、DFD を使った構造化分析技法にリアルタイムの拡張機能を
　　追加した技法である。制御系システムの分析に利用される。

てすと%

> HDLCではフレームの区切りを"01111110"で表現します。これをフラグシーケンスと
> 呼びます。フラグシーケンスではさまれたフレーム内部では"1"が6つ以上連続する
> ことは許されません。このため、データを送信するときに"1"が5つ連続した場合に
> は直後に"0"を挿入しなければならず、また、受信したデータで"1"が5つ連続した場
> 合にはその直後の"0"を削除しなければならないことになっています。この操作によ
> り、"1"は最大でも５つしか連続せず、フレームの区切りであるフラグシーケンスを
> 識別することができます。

割込み
割り込みは割込み信号によって実行中のプログラムを中断して他のプログラムを実行し再び元のプログラムを実行する機能である。内部割込みと外部割込みがある。
内部割込みは実行中のプログラムが原因で起こる割込みである。
プログラム割込み…けたあふれ、ゼロ割り、セグメント/ページ不在、記憶保護例外
SVCコール割込み…モード切替命令の実行
外部割込みは実行中のプログラムに関係無い割込みである。
機械チェック割込み…主記憶装置の障害、ハードウエアの故障、電源異常など
入出力割込み…入出力装置やチャネルの動作完了か中断など
タイマ割込み…所定時間が過ぎた時
コンソール割込み…オペレータが割込みスイッチを押したとき

RAID 3 / RAID 4 / RAID 5：
　　　　　データの修復情報としてパリティを利用します。
　　　　　（パリティチェック(parity check)）
　　　　　RAID 3 ではバイト単位、RAID 4 ではブロック単位で、データを
　　　　　分割して記憶します。パリティビット用ハードディスクを別に用意
　　　　　して記録し、データ破壊時の修復を可能にします。

　　　　　また、RAID 5 では、パリティビット記録用ハードディスクは
　　　　　特定しないで、各ハードディスクで分担して、エラーチェックを
　　　　　行います。誤り訂正符合を各ディスクに分散することで、
　　　　　一つのディスクに障害が発生したときでも、システムとしての
　　　　　機能を果たします。

ばいおいんふぉまちくすの研究室を立ち上げようと思うのですが、皆さんはどういったネットワークを構築していますかね

東急不買ネットワークを構築しています