バイオインフォマティクス各論-物理・化学的情報-
566 ：名無しゲノムのクローンさん：03/11/16 12:30
あまりKEGGのこと知らない人が多いような気がしてきた。漏れもだが。
>>548読め。
まず、KEGGのことを悪意抜きで説明してみよう。話はそれからだ。
と書いても悪意付きでしか説明されないのだろうけど。
>>548読め。
まず、KEGGのことを悪意抜きで説明してみよう。話はそれからだ。
と書いても悪意付きでしか説明されないのだろうけど。
567 ：名無しゲノムのクローンさん：03/11/16 12:43
>>566
KEGGは ttp://www.genome.ad.jp/ の一部。
システム構成は ttp://www.genome.ad.jp/dbget/dbget.links.html で概括できる。
基本的に ttp://www.genome.ad.jp/kegg/kegg4.html から pathway 偏重が伺えよう。
でいいかな？
KEGGは ttp://www.genome.ad.jp/ の一部。
システム構成は ttp://www.genome.ad.jp/dbget/dbget.links.html で概括できる。
基本的に ttp://www.genome.ad.jp/kegg/kegg4.html から pathway 偏重が伺えよう。
でいいかな？
568 ：名無しゲノムのクローンさん：03/11/16 16:05
ときどきしかアクセスしないが、ユーザからひとこと。
pathwayは一応重宝しているぞ。
pathwayは一応重宝しているぞ。
569 ：名無しゲノムのクローンさん：03/11/16 19:03
論理レベルとメタ論理レベルの仕事をごっちゃにして評価しようというのが
乱暴な話しだ。KEGGはメタ論理レベルでみれば単なる一つの仕事ということ
認識していただきたい。別に日本の生物学のあり方を変えようとか、他の
メタ論理を否定したりすることがあってはならない。
また実験科学では、論理はメタ論理に従属するものではないという事も
重要で、従属してたとしたらとても危険。
乱暴な話しだ。KEGGはメタ論理レベルでみれば単なる一つの仕事ということ
認識していただきたい。別に日本の生物学のあり方を変えようとか、他の
メタ論理を否定したりすることがあってはならない。
また実験科学では、論理はメタ論理に従属するものではないという事も
重要で、従属してたとしたらとても危険。
570 ：名無しゲノムのクローンさん：03/11/16 19:51
>>567
偏重という表現は悪意そのものじゃないのかなｗ
偏重という表現は悪意そのものじゃないのかなｗ
571 ：名無しゲノムのクローンさん：03/11/17 00:01
ときどきしかアクセスしないが、ユーザからひとこと。
pathwayは重宝しているが他は使ったことがほとんどないぞ。
GTOPってKEGGのコンテンツだっけ？
あれは結構すきだぞ。
pathwayは重宝しているが他は使ったことがほとんどないぞ。
GTOPってKEGGのコンテンツだっけ？
あれは結構すきだぞ。
572 ：名無しゲノムのクローンさん：03/11/22 12:00
573 ：名無しゲノムのクローンさん：03/11/23 19:07
>>568
次の文との違いを的確に指摘してください。
「生物学辞典はときどきしか使ってないが重宝してるぞ」
>>572
話し、噛み合ってるか？
結論としては、KEGGは内容の割りに予算取りすぎてるので嫉ましい、ということでいいですか？
p.s. K久先生
以前、GIWに数十人秘書連れで会場近くのレストランで食事してるのをお見かけしましたが、
会場近くであのハーレム状態、費用はいったいどこから？なんて勘ぐられても仕方ないと思います。
あれはちょっとやりすぎじゃないですか？
それと、以前○○費でエレクトーンを購入し、演奏専属の秘書を雇用していたという噂を聞きましたが、
それはさすがに悪意ある噂に過ぎないんですよね？
次の文との違いを的確に指摘してください。
「生物学辞典はときどきしか使ってないが重宝してるぞ」
>>572
話し、噛み合ってるか？
結論としては、KEGGは内容の割りに予算取りすぎてるので嫉ましい、ということでいいですか？
p.s. K久先生
以前、GIWに数十人秘書連れで会場近くのレストランで食事してるのをお見かけしましたが、
会場近くであのハーレム状態、費用はいったいどこから？なんて勘ぐられても仕方ないと思います。
あれはちょっとやりすぎじゃないですか？
それと、以前○○費でエレクトーンを購入し、演奏専属の秘書を雇用していたという噂を聞きましたが、
それはさすがに悪意ある噂に過ぎないんですよね？
574 ：名無しゲノムのクローンさん：03/11/23 23:05
>>573
>KEGGは内容の割りに予算取りすぎてる
これは真。数十万円のオーダででも構築可能だ。
>嫉ましい
これは偽。厨房の課題に相応しいシステムに何故嫉妬心を抱かねばならんのだ？
>噂
奴の話など興味無し。単に祭り揚げられた無能者なんだろう。
ラボマネージメントのみで研究時間を奪われた者の末路の何と酷いことか。
>KEGGは内容の割りに予算取りすぎてる
これは真。数十万円のオーダででも構築可能だ。
>嫉ましい
これは偽。厨房の課題に相応しいシステムに何故嫉妬心を抱かねばならんのだ？
>噂
奴の話など興味無し。単に祭り揚げられた無能者なんだろう。
ラボマネージメントのみで研究時間を奪われた者の末路の何と酷いことか。
575 ：名無しゲノムのクローンさん：03/11/24 01:03
>>574
>>嫉ましい
>これは偽。厨房の課題に相応しいシステムに何故嫉妬心を抱かねばならんのだ？
>>噂
>奴の話など興味無し。
これらの表現から嫉妬以外のものを読み取るほうが難しいのだが。
正当な批判として述べたいのなら、「KEGGがどういうシステムで、
どういうところが悪いのか」を冷静に述べたほうがいいんじゃないかな。
バイオインフォ系スレはこの手の「平常心を失ったレス」が多いような気がする。
>>573の「嫉ましい、ということでいいですか？」もだけどさ。
賛成するにせよ反対するにせよ、自分の感情を持ちだすなよ。
>>嫉ましい
>これは偽。厨房の課題に相応しいシステムに何故嫉妬心を抱かねばならんのだ？
>>噂
>奴の話など興味無し。
これらの表現から嫉妬以外のものを読み取るほうが難しいのだが。
正当な批判として述べたいのなら、「KEGGがどういうシステムで、
どういうところが悪いのか」を冷静に述べたほうがいいんじゃないかな。
バイオインフォ系スレはこの手の「平常心を失ったレス」が多いような気がする。
>>573の「嫉ましい、ということでいいですか？」もだけどさ。
賛成するにせよ反対するにせよ、自分の感情を持ちだすなよ。
576 ：名無しゲノムのクローンさん：03/11/24 01:25
>KEGGがどういうシステムで、
>どういうところが悪いのか
>を冷静に述べたほうがいいんじゃないかな。
ではKEGGを語って下さい
>どういうところが悪いのか
>を冷静に述べたほうがいいんじゃないかな。
ではKEGGを語って下さい
577 ：名無しゲノムのクローンさん：03/11/24 05:14
つーか秘書数十人は流石にネタだろ。
578 ：名無しゲノムのクローンさん：03/11/24 11:30
579 ：名無しゲノムのクローンさん：03/11/24 15:01
>>577 二十名＋ほどでした。実際に見た人も多いのでは？ GIWの受付業務等をやっていた人にしても多すぎます。
580 ：名無しゲノムのクローンさん：03/11/24 15:02
>>576 栗被るマプ
581 ：名無しゲノムのクローンさん：03/11/24 16:34
KEGGがなにかを語るのも大切だが、
KEGGのように一度サーバで予算をとって
プロジェクトを立ててしまったラボの
悲哀と、そうなってしまった日本の科学技術予算の
ありかたについても語るべきだと思う。
たとえばJBIRC/CBRCや蛋白研（阪大)は大丈夫
だろうか？
バイオインフォマティクスで継続的に大型予算を
中断せずにとりつづけることの難しさ。
KEGGのように一度サーバで予算をとって
プロジェクトを立ててしまったラボの
悲哀と、そうなってしまった日本の科学技術予算の
ありかたについても語るべきだと思う。
たとえばJBIRC/CBRCや蛋白研（阪大)は大丈夫
だろうか？
バイオインフォマティクスで継続的に大型予算を
中断せずにとりつづけることの難しさ。
582 ：名無しゲノムのクローンさん：03/11/24 17:22
>>581
それが「物理・化学的情報」だと思うなら語ってもいいが、とてもそうとは思えん。
別に厳しくスレを使い分けろ！というつもりはないが、そういう
いかにも荒れそうな（そして素人さんを呼び込みそうな）ネタは
システムバイオロジースレか教えてくださいスレでやってはどうだろう。
このスレくらいは、もっと専門的な話題を細々と（1日1レスくらいで）
語るスレでいて欲しいなあ、と勝手に思っているのだが。
各スレが順番に（素人・専門家入り乱れて）全部荒れていくのはちょっと…。
それが「物理・化学的情報」だと思うなら語ってもいいが、とてもそうとは思えん。
別に厳しくスレを使い分けろ！というつもりはないが、そういう
いかにも荒れそうな（そして素人さんを呼び込みそうな）ネタは
システムバイオロジースレか教えてくださいスレでやってはどうだろう。
このスレくらいは、もっと専門的な話題を細々と（1日1レスくらいで）
語るスレでいて欲しいなあ、と勝手に思っているのだが。
各スレが順番に（素人・専門家入り乱れて）全部荒れていくのはちょっと…。
583 ：名無しゲノムのクローンさん：03/11/25 16:39
文句あるなら、四の五の言わず、きちんと誘導しろよ。
誘導するってのはURLをちゃんと貼るってことだぞ。
それがメンドクサイなら御託はほどほどに。
誘導するってのはURLをちゃんと貼るってことだぞ。
それがメンドクサイなら御託はほどほどに。
584 ：名無しゲノムのクローンさん：03/11/25 19:06
バイオインフォマティクスを教えて下さい 6
http://science2.2ch.net/test/read.cgi/life/1060124095/l50
システムバイオロジーを教えてください
http://science2.2ch.net/test/read.cgi/life/1031844104/l50
http://science2.2ch.net/test/read.cgi/life/1060124095/l50
システムバイオロジーを教えてください
http://science2.2ch.net/test/read.cgi/life/1031844104/l50
585 ：名無しゲノムのクローンさん：03/11/25 19:29
本スレを知らない人まで出て来たんだな。
あのスレはそこまで廃れたか。
最近来た人にはバイオインフォスレの歴史はわからんな。
このスレの場合関連スレが>>2と>>14に分断されてる上に、>>14にも「5」までしか書かれてないしな。
その辺が、このスレに「スレ違いを指摘されると逆ギレ」というパターンが多い理由かもしれん。
ただ、>>582程度の指摘に逆ギレするなって。自尊心強すぎ。
あのスレはそこまで廃れたか。
最近来た人にはバイオインフォスレの歴史はわからんな。
このスレの場合関連スレが>>2と>>14に分断されてる上に、>>14にも「5」までしか書かれてないしな。
その辺が、このスレに「スレ違いを指摘されると逆ギレ」というパターンが多い理由かもしれん。
ただ、>>582程度の指摘に逆ギレするなって。自尊心強すぎ。
586 ：名無しゲノムのクローンさん：03/11/27 05:01
(゜д゜)age
587 ：名無しゲノムのクローンさん：03/11/28 22:32
>>585
581です。583とは別人です、念のため。
581です。583とは別人です、念のため。
588 ：名無しゲノムのクローンさん：03/11/30 14:27
age
589 ：583：03/11/30 22:10
583です。
こんな閑散板の閑散スレで話題提供もせず、
自分のルールを押し付けようとしていたので
苦言を呈しました。
別に切れたわけじゃありません。
つーか、ageとか言ってるくらいならすれ違い
の話題でもイイト思う。
こんな閑散板の閑散スレで話題提供もせず、
自分のルールを押し付けようとしていたので
苦言を呈しました。
別に切れたわけじゃありません。
つーか、ageとか言ってるくらいならすれ違い
の話題でもイイト思う。
590 ：名無しゲノムのクローンさん：03/12/01 08:08
582っす。
高圧的に見えたのならｽﾏｿ。そこまで厳しく指摘したつもりではなかった
のだが、書き方が悪かったな。
>>589
言いたいことはわかるし、正直漏れもそれほど厳密にスレを分ける必要が
あると思っているわけでもないが、学術スレでスレ違いまでして
盛り上げる必要はないんじゃないかなあ、という程度のつもりだったのだが。
ちょっと盛り上がったらすぐ荒れるしね。
ageしか書いてないやつも同様。こっちのほうが悪質だとは思うけど。
というか、結局バイオインフォスレが乱立しすぎなんだよな。今は
「なるには」スレで就職以外の話題が展開されてるし。
何度も訪れている人以外は、結局最初に目に付いたスレに書き込もうと
思うだろうし。
正直、無理に盛り上げるくらいならdat落ちさせたほうが整理されて
いいんじゃないか、と暴言を吐いてみたり。
高圧的に見えたのならｽﾏｿ。そこまで厳しく指摘したつもりではなかった
のだが、書き方が悪かったな。
>>589
言いたいことはわかるし、正直漏れもそれほど厳密にスレを分ける必要が
あると思っているわけでもないが、学術スレでスレ違いまでして
盛り上げる必要はないんじゃないかなあ、という程度のつもりだったのだが。
ちょっと盛り上がったらすぐ荒れるしね。
ageしか書いてないやつも同様。こっちのほうが悪質だとは思うけど。
というか、結局バイオインフォスレが乱立しすぎなんだよな。今は
「なるには」スレで就職以外の話題が展開されてるし。
何度も訪れている人以外は、結局最初に目に付いたスレに書き込もうと
思うだろうし。
正直、無理に盛り上げるくらいならdat落ちさせたほうが整理されて
いいんじゃないか、と暴言を吐いてみたり。
591 ：名無しゲノムのクローンさん：03/12/01 10:45
まあ、最初からスレ分ける必要なんてなかったんだよ。
このスレ立てた奴は偉そうなこといってた割に
建て逃げだし。
幸い、板自体がまったりしてるから
目についたとこに書き込みでいいんじゃないの
このスレ立てた奴は偉そうなこといってた割に
建て逃げだし。
幸い、板自体がまったりしてるから
目についたとこに書き込みでいいんじゃないの
592 ：名無しゲノムのクローンさん：03/12/01 14:17
TGEの文字列照合アルゴリズムのしくみを曝してください
593 ：名無しゲノムのクローンさん：03/12/01 22:31
TGIFならしってるよ。Thanks God It's Friedayダ
594 ：名無しゲノムのクローンさん：03/12/08 06:07
ウィッキーさんage
595 ：名無しゲノムのクローンさん：03/12/17 03:26
分子生物学会にネットワーク解析系のポスターが大挙。
ほとんどのポスターが誰かに「実証はしてるんですか？」と
突っ込まれていて、担当者は苦笑い。まわりは誰も笑って
なかった。
ほとんどのポスターが誰かに「実証はしてるんですか？」と
突っ込まれていて、担当者は苦笑い。まわりは誰も笑って
なかった。
596 ：名無しゲノムのクローンさん：03/12/17 10:27
>595
それは実験？それとも計算機での予想？
実験の方しかフォローしてないが、人だかりが凄かった。
タイトルに「網羅的」「ネットワーク」「ハイスループット」とかつけるだけで人があつまるのかね。
それは実験？それとも計算機での予想？
実験の方しかフォローしてないが、人だかりが凄かった。
タイトルに「網羅的」「ネットワーク」「ハイスループット」とかつけるだけで人があつまるのかね。
597 ：名無しゲノムのクローンさん：03/12/17 14:47
GIWあげ。
正直、GIWと分生の時期をあわせるのは逆効果だと思われ。
正直、GIWと分生の時期をあわせるのは逆効果だと思われ。
598 ：名無しゲノムのクローンさん：03/12/17 19:38
age
599 ：名無しゲノムのクローンさん：03/12/17 23:38
ネットワーク大流行だね
やはりついにシステムスバイオロジーの世界が
やってきたか。ところでシミュレーションのシンポジウム
聴きに行ってた人、レポートしてくれませんか？
やはりついにシステムスバイオロジーの世界が
やってきたか。ところでシミュレーションのシンポジウム
聴きに行ってた人、レポートしてくれませんか？
600 ：名無しゲノムのクローンさん：03/12/17 23:51
600
601 ：名無しゲノムのクローンさん：03/12/18 01:11
>まあ、なんだな。いきなりであれだが、冨田さんってのはビルゲイツに
>似てるなｗ 宣伝がうまい。
どっかのおっさんに将来ノーベル賞だとか言われ、
雑誌の表紙にもなり、また調子乗り度が増すんじゃないの？
>似てるなｗ 宣伝がうまい。
どっかのおっさんに将来ノーベル賞だとか言われ、
雑誌の表紙にもなり、また調子乗り度が増すんじゃないの？
602 ：名無しゲノムのクローンさん：03/12/18 02:44
富田さん自身はどーか知らないけど、学生はそうとうアレだな。
部屋にいるから、ちやほやされてるだけなのに、、、、、
部屋にいるから、ちやほやされてるだけなのに、、、、、
603 ：名無しゲノムのクローンさん：03/12/18 05:33
＞どっかのおっさんに将来ノーベル賞だとか言われ、
おっさんって・・・
シドニーブレナーというのでは・・・
おっさんって・・・
シドニーブレナーというのでは・・・
604 ：名無しゲノムのクローンさん：03/12/18 18:53
(´-`).。ｏＯ(Brenner は joke 好きだからなぁ・・・
605 ：名無しゲノムのクローンさん：03/12/18 21:32
今年のGIWはどうだった？
606 ：名無しゲノムのクローンさん：03/12/19 17:08
シミュレーション情報教えて！！
607 ：名無しゲノムのクローンさん：04/01/24 18:30
シミュ板はいつの間にこんなことになってしまったんだ？
http://science.2ch.net/sim/
http://science.2ch.net/sim/
608 ：名無しゲノムのクローンさん：04/01/26 03:23
いやはや、
http://science2.2ch.net/test/read.cgi/life/1067272374/
で粘着の相手してたんだけど、最後は何を勘違いしたか理研批判。
相手すると酔っ払いみたいに絡まれるから放置することにした。
http://science2.2ch.net/test/read.cgi/life/1067272374/
で粘着の相手してたんだけど、最後は何を勘違いしたか理研批判。
相手すると酔っ払いみたいに絡まれるから放置することにした。
609 ：名無しゲノムのクローンさん：04/01/27 08:00
よっぽど、くやしかったみたいね。BSiという身元がばれてしまったのが、、、
後は、理研内で処理してください。
後は、理研内で処理してください。
610 ：名無しゲノムのクローンさん：04/02/06 21:32
もっと理性的になりたいでツね。
611 ：名無しゲノムのクローンさん：04/02/10 21:48
456 名前：４３３ 投稿日：04/02/10 07:44
報告させていただきます
>>309,>>310のIPそれぞれ管理人様より協力的に提供させて頂きました。
これ以上煽るようならまずはアクセス制限にて対処するので出来るだけ
穏便に事を進めて頂きたい、とのことでしたがサイは投げられましたので
悪しからず。
IPは他の板に晒しageしておきます。ここだと名誉毀損にﾅﾁｬｰｳからねＷ
ヒント：みんな暇ならここ見るんじゃないかなあー（謎
もう私はこのスレにカキコしません。そのかわり、、、、、（￣ー￣）ニヤリッ
報告させていただきます
>>309,>>310のIPそれぞれ管理人様より協力的に提供させて頂きました。
これ以上煽るようならまずはアクセス制限にて対処するので出来るだけ
穏便に事を進めて頂きたい、とのことでしたがサイは投げられましたので
悪しからず。
IPは他の板に晒しageしておきます。ここだと名誉毀損にﾅﾁｬｰｳからねＷ
ヒント：みんな暇ならここ見るんじゃないかなあー（謎
もう私はこのスレにカキコしません。そのかわり、、、、、（￣ー￣）ニヤリッ
612 ：名無しゲノムのクローンさん：04/02/10 21:50
456 名前：４３３ 投稿日：04/02/10 07:44
報告させていただきます
>>309,>>310のIPそれぞれ管理人様より協力的に提供させて頂きました。
これ以上煽るようならまずはアクセス制限にて対処するので出来るだけ
穏便に事を進めて頂きたい、とのことでしたがサイは投げられましたので
悪しからず。
IPは他の板に晒しageしておきます。ここだと名誉毀損にﾅﾁｬｰｳからねＷ
ヒント：みんな暇ならここ見るんじゃないかなあー（謎
もう私はこのスレにカキコしません。そのかわり、、、、、（￣ー￣）ニヤリッ
報告させていただきます
>>309,>>310のIPそれぞれ管理人様より協力的に提供させて頂きました。
これ以上煽るようならまずはアクセス制限にて対処するので出来るだけ
穏便に事を進めて頂きたい、とのことでしたがサイは投げられましたので
悪しからず。
IPは他の板に晒しageしておきます。ここだと名誉毀損にﾅﾁｬｰｳからねＷ
ヒント：みんな暇ならここ見るんじゃないかなあー（謎
もう私はこのスレにカキコしません。そのかわり、、、、、（￣ー￣）ニヤリッ
613 ：名無しゲノムのクローンさん：04/02/10 21:52
http://science2.2ch.net/test/read.cgi/life/1067272374/
458 名前：名無しゲノムのクローンさん 投稿日：04/02/10 08:03
セフレならいますが何か？
459 名前：名無しゲノムのクローンさん ﾒｪﾙ：sage 投稿日：04/02/10 09:25
リモホってのは名前の通り、正しく参照すると個人（が使ってる端末）
に行き着くんだがな・・・
尤も正しく参照するにはプロバの協力や何やら要るわけではあるが、
犯罪行為があると簡単に（ｒｙ
どっちが素人なのやら・・・
やりすぎると痛い目見るよ
458 名前：名無しゲノムのクローンさん 投稿日：04/02/10 08:03
セフレならいますが何か？
459 名前：名無しゲノムのクローンさん ﾒｪﾙ：sage 投稿日：04/02/10 09:25
リモホってのは名前の通り、正しく参照すると個人（が使ってる端末）
に行き着くんだがな・・・
尤も正しく参照するにはプロバの協力や何やら要るわけではあるが、
犯罪行為があると簡単に（ｒｙ
どっちが素人なのやら・・・
やりすぎると痛い目見るよ
614 ：名無しゲノムのクローンさん：04/02/20 01:01
最近ネタないの？
615 ：名無しゲノムのクローンさん ：
>614
なさげだなあ。バイオインフォスレ全部落ちまくってるし。
lsGridの話もサンディエゴの話にもまだ早いだろうし・・・。
なさげだなあ。バイオインフォスレ全部落ちまくってるし。
lsGridの話もサンディエゴの話にもまだ早いだろうし・・・。