くだらない質問この指と〜まれ！Part12

HDを交換しようと思うんですが、
ついでにWIN２０００のOEMを買って
デュアルブートにしたいと思ってます。

C　ME　　D　２０００　　E　アプリなど

にしようと思うんですが・・・
アプリが両OSに対応してるなら、
ME起動時、２０００起動時、
どちらの時でも使えるんでしょうか？

スレ（板）違いなら
何処で聞けばいいか教えて下さい。