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原因が分かりました。
結論から言いますと、MSIMEの言語バーだと思います。

言語バーを縦にし、最小化でツールバーに一体化させると
再起動時、再ログイン時にツールバーの幅が変わってしまう
ようです。

MSにもメールしてみたんですが、msconfigからサービス、
スタートアップをMS以外全部OFFにして確認しろと
言われたので、やってみたら、全然変化なし。
それで色々調整しながらやってみると、IMJPMIGのときに
妙な動きをしました。

それで、もしかして、と思って言語バーの最小化を外してみるとビンゴ!
幅が変わらなくなりました。