cygwin使っている人いますか？

shのexecは、UNIXのexecシステムコールを呼んでいるだけ、
自分でやりたければ、execlv()とか(だっけ？忘れた)をCから呼ぶ。
sh.exeはいらないけど、cygwin1.dllは要る（と思う）。

従って、-mno-cygwinはだめ。

ということでいいかな？

でも、

system("start c:\\cygwin\\sh.exe -c /local/bin/hoge.exe");
exit(0);

とかやれば、ネイティブアプリからcygwinアプリを起動することはできるはず。