一般路線バスで一番長い距離を走るのは？

京都交通:　京都駅前−妙見山
はどうだろう。2時間くらいかかるらしい。
ttp://web.kyoto-inet.or.jp/people/ochimaru/kyoto-kotsu%20omoshiro-rosen.htm

かつては、京都駅前−奈良駅前のバス路線を3社が持っていたが、今はすべて廃止されたな。
「快速バス」も含めていいなら、
京都交通:四条河原町−東舞鶴・天橋立　とか　丹海バス:京都駅前−間人(たいざ)　とかあるね。