テキストエディタをまた〜り語ろう ver.25

改行コードの表示を変更できるエディタがありますが、
コードをカスタマイズすることで、なにか、リスク
というか、混乱が起こることはないでしょうか。
素人考えですが、ある理由があって、以下のように
コードを分けていると思うのですが。それを「カスタマイズ」
されると、検索とか、不具合が起きないでしょうか。
具体的には、CR-LFのファイルに新たにLFのファイルをペースト
し、新規ファイルとして全体を、LFコードで全体を保存したときとか。

私はWinPCなのに、新規ファイルは UNIXの LF に変えて
しまいました。↓マークのほうが、画面がスッキリするという
だけの理由です。
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CR-LF (DOS/Win)
LF (UNIX)
CR (Mac)