コマンドライン引数の取得の仕方がわかったので書いておきます。
GetArgs()
{
args := DllCall("GetCommandLine", str)
StringGetPos, pos, args, %A_ScriptName%
StringLen, length, A_ScriptName
count := pos + length + 1
StringTrimLeft, args, args, count
return args
}
args := GetArgs()
MsgBox, %args%