【遺伝子】世界初！気象データからイネの葉で働くほぼ全ての遺伝子の働きを予測するシステムを開発…生物研
作物の生育状況は気象条件によって左右される。
その時に影響を受ける作物の遺伝子も解明され、データベース化もされつつあるが、
実験レベルでの解明やデータであるために、まだまだ育種や栽培法などの実利用には至っていない。
農業生物資源研究所は、実際に水田で育てられているイネの葉の全遺伝子の発現量データを解析し、
気象データなどと照合することで、イネの葉のほとんどの遺伝子の働き方を予測するシステムを開発した。
これにより、過去の気象データを用いて高温障害などに関連する遺伝子を特定できるほか、
イネや他の作物の生育状況の予測、施肥や農薬散布などの適切な時期の把握などが可能になるという。
発表によると、同研究所植物生産生理機能研究ユニットの井澤毅・上級研究員や
農業生物先端ゲノム研究センターの長村吉晃・ゲノムリソースユニット長らのグループは、
茨城県つくば市内の水田で2008年6-10月に採集したイネ(日本晴、農林8号)の葉461枚における
全遺伝子(27,201個)を解析し、それぞれの発現量(mRNAの発現量)のデータを得た。
さらに、採取時の気象データ(風量、気温、湿度、日照、大気圧、降水量)や採取条件などを基に
大型コンピュータで統計的な解析を行った。
その結果、イネの葉では17,616個の遺伝子が働き、うち17,193個の遺伝子については
主にイネの体内日周リズムや植物齢、外気温や日照などによって発現量が影響されることが分かった。
こうした結果から研究グループは気象データと田植え後の日数、採取時刻を入力するだけで、
任意の遺伝子の発現を予測するシステムを開発した。
実際に2009年に水田のイネの葉108個を採取し、17,193個の遺伝子の発現量を実測したところ、
今回開発のシステムによる推定値と一致し、高精度で多くの遺伝子の働き方を予測することができたという。
イネの田植え直後からコメが実るまでの期間中に働く全遺伝子の解析は世界的にも例がなく、
実際の複雑な気象変動を踏まえた上で遺伝子の働き方を推定するシステムも世界初の成果として注目される。
研究論文は7日、米科学誌「セル(Cell)」に掲載された。
サイエンスポータル
http://scienceportal.jp/news/daily/1212/1212111.html
独立行政法人農業生物資源研究所
世界初！気象データからイネの葉で働くほぼ全ての遺伝子の働きを予測するシステムを開発
−栽培中の作物の遺伝子の働きが予測可能になったことで、生育状況を正確に把握−
http://www.nias.affrc.go.jp/press/20121205/full_text.pdf
Cell
Deciphering and Prediction of Transcriptome Dynamics under Fluctuating Field Conditions
http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0092867412013529
その時に影響を受ける作物の遺伝子も解明され、データベース化もされつつあるが、
実験レベルでの解明やデータであるために、まだまだ育種や栽培法などの実利用には至っていない。
農業生物資源研究所は、実際に水田で育てられているイネの葉の全遺伝子の発現量データを解析し、
気象データなどと照合することで、イネの葉のほとんどの遺伝子の働き方を予測するシステムを開発した。
これにより、過去の気象データを用いて高温障害などに関連する遺伝子を特定できるほか、
イネや他の作物の生育状況の予測、施肥や農薬散布などの適切な時期の把握などが可能になるという。
発表によると、同研究所植物生産生理機能研究ユニットの井澤毅・上級研究員や
農業生物先端ゲノム研究センターの長村吉晃・ゲノムリソースユニット長らのグループは、
茨城県つくば市内の水田で2008年6-10月に採集したイネ(日本晴、農林8号)の葉461枚における
全遺伝子(27,201個)を解析し、それぞれの発現量(mRNAの発現量)のデータを得た。
さらに、採取時の気象データ(風量、気温、湿度、日照、大気圧、降水量)や採取条件などを基に
大型コンピュータで統計的な解析を行った。
その結果、イネの葉では17,616個の遺伝子が働き、うち17,193個の遺伝子については
主にイネの体内日周リズムや植物齢、外気温や日照などによって発現量が影響されることが分かった。
こうした結果から研究グループは気象データと田植え後の日数、採取時刻を入力するだけで、
任意の遺伝子の発現を予測するシステムを開発した。
実際に2009年に水田のイネの葉108個を採取し、17,193個の遺伝子の発現量を実測したところ、
今回開発のシステムによる推定値と一致し、高精度で多くの遺伝子の働き方を予測することができたという。
イネの田植え直後からコメが実るまでの期間中に働く全遺伝子の解析は世界的にも例がなく、
実際の複雑な気象変動を踏まえた上で遺伝子の働き方を推定するシステムも世界初の成果として注目される。
研究論文は7日、米科学誌「セル(Cell)」に掲載された。
サイエンスポータル
http://scienceportal.jp/news/daily/1212/1212111.html
独立行政法人農業生物資源研究所
世界初！気象データからイネの葉で働くほぼ全ての遺伝子の働きを予測するシステムを開発
−栽培中の作物の遺伝子の働きが予測可能になったことで、生育状況を正確に把握−
http://www.nias.affrc.go.jp/press/20121205/full_text.pdf
Cell
Deciphering and Prediction of Transcriptome Dynamics under Fluctuating Field Conditions
http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0092867412013529
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2 ：名無しのひみつ：2012/12/11(火) 14:01:32.90 ID:CbCo51ny
先物屋からトラクターが
3 ：名無しのひみつ：2012/12/11(火) 14:42:16.72 ID:vKLljnxi
とんでもねー仕事だなこりゃ
>>2
ハッカー侵入の報道はまだ〜？
ハッカー侵入の報道はまだ〜？
予測失敗で穀物高騰
何回目よ
何回目よ
7 ：名無しのひみつ：2012/12/11(火) 16:07:45.98 ID:JCIjPAXv
これでコメ工場の実用化が捗る
> 茨城県つくば市内の水田で2008年6-10月に採集したイネ(日本晴、農林8号)の葉461枚における
> 全遺伝子(27,201個)を解析し、それぞれの発現量(mRNAの発現量)のデータを得た。
この地道な作業の勝利、かな。
> 全遺伝子(27,201個)を解析し、それぞれの発現量(mRNAの発現量)のデータを得た。
この地道な作業の勝利、かな。
9 ： 【関電 86.7 %】 忍法帖【Lv=40,xxxPT】(2+0：8) ：2012/12/11(火) 16:47:41.35 ID:r5arAybG
怪しいなぁ
10 ： 【関電 86.7 %】 忍法帖【Lv=40,xxxPT】(3+0：8) ：2012/12/11(火) 16:49:06.90 ID:r5arAybG
まぁ統計解析レベルってことですな
イイネ！
12 ：名無しのひみつ：2012/12/11(火) 19:48:14.48 ID:LE3pemw2
４６１回 マイクロアレイしたということかな？
お金持ちですね。
お金持ちですね。
13 ：名無しのひみつ：2012/12/14(金) 23:31:54.44 ID:yCDCrBgJ
メリステムでこれやってくれや。
俺が使うから。
俺が使うから。
14 ：名無しのひみつ：2012/12/15(土) 04:14:34.22 ID:dVdKc6wG
先代スパコンの時のように、穀物先物取引で日本に情報使うなと半ギレでいちゃもん付けて来そうだな。
15 ：東京sasuga：2012/12/21(金) 19:08:16.85 ID:WwIEXn34
bennzenn セシウム 放射線 ウラン 東北と一緒にがんばれ
衛星LEDで都民監視能力
ためしてますねーーーー他県は・？
衛星LEDで都民監視能力
ためしてますねーーーー他県は・？
16 ：東京sasuga：2012/12/21(金) 19:11:44.45 ID:WwIEXn34
遺伝子実験は
都民を計画的に癌や病気にできる
ステルス波 スカラ波 セシウム 放射線
都内のストロンチウム９０と同等か
衛星から日本人を何でもできるとテレビでやってましたね
都民を計画的に癌や病気にできる
ステルス波 スカラ波 セシウム 放射線
都内のストロンチウム９０と同等か
衛星から日本人を何でもできるとテレビでやってましたね
17 ：名無しのひみつ：2013/01/15(火) 16:23:33.28 ID:4kj1fzyv
小麦でやれよwww
先物生は出来るだろ
先物生は出来るだろ
18 ：名無しのひみつ：2013/01/15(火) 16:23:48.23 ID:4kj1fzyv
先物制覇
19 ：名無しのひみつ：2013/01/15(火) 19:27:19.11 ID:afZ2RML8
凄い時代になったもんだね、、、
前に世界初！ってわざわざつけるのが記事のレベルを下げてる
つけなくてもわかるからやめろ
つけなくてもわかるからやめろ