【医療】新薬開発にスパコン「京」を活用 候補の絞り込みが3年半から半年に短縮/大日本住友製薬

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36名無しのひみつ:2012/09/25(火) 19:58:51.75 ID:ELfae7ew
スペースX社みたいに 政府系の援助の入った民間会社を作ってそこでスパコン開発やったほうがいいんじゃね
37名無しのひみつ:2012/09/25(火) 20:16:08.75 ID:LD9S5Dxp
>>36
理研と富士通の共同開発ってのは、それとどう違うんだ?
38名無しのひみつ:2012/09/25(火) 22:32:20.47 ID:RTik6cJZ
>12
tsubameも富士通?
39名無しのひみつ:2012/09/25(火) 22:37:28.45 ID:H6XnrDlc
>>38
日電他
だからこういうところで推してる怪しいレスが必ず付く。
40名無しのひみつ:2012/09/25(火) 23:35:00.31 ID:dhnCx6kh
富士通の45nmなんて使わずにHD7970を5万個くらい使ったほうがいい気がするんだが
41名無しのひみつ:2012/09/26(水) 00:40:22.83 ID:aKY5Z971
TSUBAMEはCPUGPU混載なのと、GPUの癖が強くて、
プログラミングが面倒で、性能が出ないので有名なマシンだからなあ。
42名無しのひみつ:2012/09/26(水) 03:01:58.36 ID:QGMa8PpD
>>24
創薬にシミュレーションなんてほとんど役に立ってないんだが。あと十年経ったら、少しは使えるかもしれないが、アメリカがその数年先を行ってるだろう。
「京」の応用として創薬が語られるという事は、ほとんど役に立ってないと同義。
43名無しのひみつ:2012/09/26(水) 13:38:47.45 ID:8PLK96W6
グラボ集めてスパコン作るのは、途上国とか地方の大学がやるようなことだしなw
市販品集めて出来るのなら、需要があれば民間企業が作るだろう。
44 【北電 83.3 %】 忍法帖【Lv=38,xxxPT】(1+0:8) :2012/09/26(水) 20:01:06.19 ID:dsLZZEYb BE:1287616853-2BP(710)
TSUBAMEはcudaを使ってたのか
45名無しのひみつ:2012/09/26(水) 20:38:33.68 ID:8YfZfZlt
>>40
OpenCLは大変だよ
46名無しのひみつ:2012/09/26(水) 22:19:08.04 ID:6j2x3N7Q
スパコンはそういう仕事をするのか。
未知の化合物の構造式とかを考えるのか?
物理的に存在しうる物質かどうか計算する、とか
47名無しのひみつ:2012/09/26(水) 22:24:23.69 ID:6cuK6QpU
>>46
そろばん使ってる江戸時代の技術者に インターネットの説明するような話だからなあ
48名無しのひみつ:2012/09/28(金) 10:21:35.24 ID:vjQQP23e
一般公募に選ばれた研究の期間って来年末なんだね
外れた160団体、今後使いたい人も後1年半待たないと京を使えないのか
49名無しのひみつ:2012/09/28(金) 11:01:52.93 ID:qf+kYUoP
スパコンなんて作らずに2000億円を社会保障費に回せとか言ってる奴が
案外少なくてほっとした
50名無しのひみつ:2012/09/28(金) 11:09:19.47 ID:OxmLV7gx
すげーシミュレーションでできちゃうのかよ
51名無しのひみつ:2012/09/28(金) 11:38:27.95 ID:MLFTb8uW
中国にハッキングしされて無断使用されないか心配
52名無しのひみつ:2012/09/28(金) 21:21:59.30 ID:4eznjyAD
>>49
京じゃなくて、もっと安くて汎用型のスパコンを多く供給した方が産業的には効果的だろう。
京は、ただのハコモノ事業で天下りの為の施設で有る事には変わりない。無駄金だと思ってる。
53名無しのひみつ:2012/09/28(金) 21:55:31.24 ID:H/Fefg8c
54名無しのひみつ:2012/09/29(土) 19:27:50.67 ID:qxRNlIPW
国の税金で作ったスパコンを民間企業に安く使わせるのは、おかしいだろ。
そのような企業が利益は上げた場合は、重税を果たすなどの措置をとるべき
55名無しのひみつ:2012/09/29(土) 19:51:00.99 ID:M9GcoMo0
>>54
企業を楽にするために国民の税金で作ったんじゃないんですか?
56名無しのひみつ:2012/09/29(土) 20:27:21.14 ID:utTgi8Po
>>54
国鉄とか国道って知ってるか?
57名無しのひみつ:2012/09/29(土) 20:27:45.41 ID:mhP8Lv5Y
新党「国民のスパコンが世界一位」
58名無しのひみつ:2012/09/29(土) 20:30:39.27 ID:qxRNlIPW
>>55
 特定の企業が楽になったとして、残りの国民が苦しくなっては元も子もない

>>56
 馬鹿ですか?
59名無しのひみつ:2012/09/29(土) 20:31:50.78 ID:utTgi8Po
インフラってものを知ってるか? って話をしてるんだが
難しすぎてわからなkった? じゃあごめん
60名無しのひみつ:2012/09/29(土) 20:34:41.91 ID:qxRNlIPW
>>59
>>じゃあごめん

じゃあ、許してやる w
61名無しのひみつ:2012/09/29(土) 21:38:01.96 ID:gn7Dms5W
a
62名無しのひみつ:2012/09/29(土) 21:40:20.48 ID:gn7Dms5W
弱小バイオベンチャー
まさかの新薬できますた♪
http://stocks.finance.yahoo.co.jp/stocks/detail/?code=4565.T
63名無しのひみつ:2012/09/29(土) 22:14:54.43 ID:D4VE2Qqb
レンホウは尖閣をどうやって中国へ領土として捧げるのか考えるのに
忙しいんじゃないの。
レンホウが京を使えば、売国のシュミレーションをするかも。
64名無しのひみつ:2012/09/29(土) 22:56:21.12 ID:utTgi8Po
レンホーは ちきゅうを中国に売却すれば(毎年の維持管理費が無くなって)いい
とぬかした真性売国奴
65名無しのひみつ:2012/10/01(月) 04:56:23.56 ID:Okfa/ArK
>>8
アマチュア天文家みたいに、
普段、自動車整備工場で働く田中さん、
休日の楽しみは新薬の候補さがし。
「このノートパソコンで数兆パターンから膵臓癌に効く新薬の絞り込みをするんですよ」
みたいな話題のコーナーをテレビで観ながら晩飯食うんか。
66名無しのひみつ:2012/10/01(月) 09:06:06.97 ID:BvLKwAcO
>>65
2ちゃんねらーのみんなで白血病を救えみたいななの無かったっけ
67名無しのひみつ:2012/10/02(火) 16:01:04.15 ID:E3CN/SIs
こんなの80億のIBMの安くてもっと高速なスパコン買ってやればいいだけの話。

わざわざ1000億もかけて京を作る価値はない。所詮、天下り用のハコモノ事業だ。
68名無しのひみつ:2012/10/02(火) 16:37:55.26 ID:JCnftuYC
現実には80億じゃ、しょぼいのしか買えないよ。
あれはかなり政治的な値段。

そもそも、セコイアタイプはまだ売ってないしな。
性能1/10規模をイタリアに導入していたから、交渉次第だろうけど。
69名無しのひみつ:2012/10/02(火) 19:58:26.96 ID:ztvp4QO1
>>66
分散コンピューティングの
boincのことかな。
余ったCPUのパワーをタンパク質やガンの解析に使おうというボランティア。
目的と手段が逆になっているヒトもいるけど。
70名無しのひみつ:2012/10/03(水) 06:01:47.68 ID:ZW7iD8fE
>>67
IBMのじゃノード間通信しょぼくてこんなに実効性能でないでしょ
71QQ:2012/10/16(火) 23:27:51.62 ID:ge4Rqngj
IBMのBlueGene Qと京を同列に扱っているのが多々あるけど
京はよりSingleThread重視で、FlopsあたりのMemoryバンドや
Node間バンドも大きい。電力などで大きく後れをとっているのは
このあたりが影響している。単なるlinpack値での優劣だけで
物事を判断しない方がいいと思う。自分の無知をさらすだけ。
(技術的にはIBMが優れているのは確かだけどそこまで大きな差はない。)
72QQ:2012/10/16(火) 23:32:01.88 ID:ge4Rqngj
そもそもIBMがBlueGene系列とは別に電力やlinpack性能で不利なのを
わかっていながら当初Power7ベースのBlueWatersを開発していたのが
BlueGeneだけで、すべての大規模計算を賄えると思っていなかった証左
ではなかろうか。linpackでみればBlueWatersは京よりも単位消費電力
あたりの演算能力は低い。わかりやすいとはいえ単なる一指標で一喜一憂
するのは自分の知識の無さをさらすものでしかない。
73QQ:2012/10/16(火) 23:37:51.82 ID:ge4Rqngj
あといまだにx86(xeon,opteron)をベースにってのもよくでるけど、京や
BlueGeneがあれほどのスカラーcpuを大量に使用できるのは、そのcpu単体の
信頼性がx86系のものとは比べられないほど優れているから。
数千cpuのころとちがってxeon/opteronを数だけ揃えるやりかたはうまくいかない。
オークリッジのジャガーあたりが限界と思う。
現在のHPCの流れを把握したうえで、批判した方が良い。素人がごちゃごちゃ
いっても何の論理的な説得力もない。
74名無しのひみつ:2012/10/18(木) 15:51:32.76 ID:S4tuYY3M
スパコンスレは外国の工作員すげえなあ・・・、金かけてるなw
75名無しのひみつ:2012/10/18(木) 19:25:33.54 ID:cW85mk3G
工作員の費用はノートPC一台分くらいの負担で済むからね
安いもんだw
76名無しのひみつ:2012/10/18(木) 19:26:18.22 ID:cW85mk3G
あ、もちろん人数もそれなりにいるからそれなりの経費にはなるだろうけど
スパコンやるのと比べればw
77 【北電 81.2 %】 忍法帖【Lv=40,xxxPT】(3+0:8) :2012/10/18(木) 19:51:41.89 ID:zmh7KANW BE:2403551647-2BP(1279)
cuda用の線形代数ライブラリがあるらしい
78名無しのひみつ:2012/10/20(土) 12:33:45.21 ID:nu6uQrL5
【民主党】枝野蓮舫“仕分けコンビ”、復興予算流用問題で開き直り連発 自公に責任転嫁★2
http://uni.2ch.net/test/read.cgi/newsplus/1350694862/l50
79名無しのひみつ:2012/11/13(火) 13:45:29.12 ID:Bh6AaFaq
 【小宮山亮磨】スーパーコンピューターの計算速度を競う世界ランキングの最新版が12日発表され、前回6月に2位だった理化学研究所の「京(けい)」は3位に順位を落とした。首位は、米オークリッジ国立研究所の。(朝日新聞デジタル)
80名無しのひみつ:2012/11/17(土) 09:01:21.18 ID:tlaCH2rm
テレビで本来500億かかるところを、150億?に縮められるって言ってた・・・。本当なら計算機科学ってすげえよなあ。
81名無しのひみつ:2012/11/17(土) 10:55:43.06 ID:dl8EGQPE
こういう事こそ安上がりの並列処理のスパコンでいいと思うんだが
こんな事に京使わなきゃいけないほど使い道ないのか?
82名無しのひみつ:2012/11/17(土) 12:04:28.55 ID:k1vrRobI
>>81
先端科学に伝統という言葉を使うのは奇異な感じに思うだろうが、
国産スパコンの伝統からすれば京こそが並列処理の低バンド幅スパコンなわけで。
83名無しのひみつ:2012/11/17(土) 13:57:27.92 ID:rw1goMM7
レンホーの歯ぎしりが聞こえる
84名無しのひみつ:2012/11/17(土) 16:23:55.58 ID:AgkHEgJU
>>82
日本って昔から 100発1中の大砲100門より 100発100中の大砲1門が大好きな国だよね
メンテナンスや敵の攻撃の被弾とか考えたら 戦いは数だよ兄貴 が正論なんだけどね
ランチェスターの法則とかあるし
85名無しのひみつ
>>84
100門の砲なら相手の弾により砲が損耗していくため100門有ったほうが有利。
しかし演算器が損耗せず、演算器が処理を行う機会が無為に失われていくのは
単なる時間の無駄でしかない。

高バンド幅がもうちょっと安ければ、米国勢も高バンド幅にしているだろう。
まあ逆も言えるので、考え方の違いだが。