【技術】DNA1本で塩基配列を解読可能　解読高速化に成功／大阪大

◇ＤＮＡ１本で解読可能＝高速化、捜査に応用も−大阪大

わずか１本のＤＮＡでも塩基配列を解読できる技術を、大阪大産業科学研究所の
川合知二教授と田中裕行助教が確立した。
試料が少なくても高速の解読が可能になり、犯罪捜査に応用が可能という。
５日付の英科学誌「ネイチャー・ナノテクノロジー」（電子版）に掲載された。
　
ＤＮＡは細胞核に含まれ、アデニン（Ａ）、チミン（Ｔ）、グアニン（Ｇ）、シトシン（Ｃ）の４種類の
塩基（化学物質）が鎖のようにつながっている。
２本１組でらせんを描き、塩基の並び方が遺伝情報を表すため、
「生命の設計図」とも言われる。
　
従来の方法では、塩基配列の解読に大量のＤＮＡが必要だったが、田中助教は斜め４５度に
傾けた銅基板にＤＮＡを含んだ水を噴霧し、１本のＤＮＡをほぼまっすぐに伸ばす方法を開発。
走査トンネル顕微鏡を使い、特殊な針で電流を流しながらＤＮＡをなぞり、グアニンの識別に
成功した。
　
ＤＮＡが１本なので解読が高速になり、必要な部分の「飛ばし読み」も可能。
ほかの塩基を判別する研究も進めている。
　
犯罪捜査などのＤＮＡ鑑定では試料が少ない場合、
ＤＮＡを増幅させる遺伝子検査（ＰＣＲ）が行われてきた。
川合教授は「ＰＣＲは増幅過程で間違いが起きやすい。１本を直接解読できれば増幅の
必要がない」と話している。（2009/07/06-02:06）

▽記事引用元：時事ドットコム（http://www.jiji.com/）
http://www.jiji.com/jc/c?g=soc_30&k=2009070600025
走査トンネル顕微鏡で解析したDNAの塩基配列。光って見える部分がグアニン。（大阪大学提供）
http://www.jiji.com/news/kiji_photos/20090705at14t.jpg

▽関連リンク
・大阪大学産業科学研究所（http://www.sanken.osaka-u.ac.jp/）
　走査トンネル顕微鏡を使ってDNA１本でのグアニン塩基の配列の解読に成功
　http://www.sanken.osaka-u.ac.jp/jp/operation/research_activities.html#200907
・Nature Nanotechnology（http://www.nature.com/nnano/index.html）
　Partial sequencing of a single DNA molecule with a scanning tunnelling microscope
　http://www.nature.com/nnano/journal/vaop/ncurrent/abs/nnano.2009.155.html

また大阪か

>>2
いや良い話題じゃん

ここでこんなことやってたんだ・・・。
奥の方〜って感じで、あまり印象がないｗ
抄いたキャンパス入り口付近の遺伝情報実験センターでの話かと思った。

さすが大阪。さすが大阪大学！

今のDNA鑑定も間違いが起きやすいのか・・・

最近の阪大は異常。

成果上げまくってるな

ＰＣＲでノーベル賞取ったし、これでもありかな？

>川合教授は「ＰＣＲは増幅過程で間違いが起きやすい。１本を直接解読できれば増幅の
>必要がない」と話している。（2009/07/06-02:06）
間違いは起きやすいのに絶対的な証拠とされていた事実。
ＤＮＡだけの証拠で犯罪者になった人がたくさんいる事実。再検査すら拒否

間違いってのは塩基のミスマッチだろ

スゲーな
昔はこれが出来なかったらからPCRが開発されたのに。

>銅基板にＤＮＡを含んだ水を噴霧し

これでＤＮＡ壊れたりしねえのか？

いやいや、high fidelity なPCRではエラーは数万塩基に一つ程度。
一分子解析でこのレベルの正確性はさすがに難しいのでは。
それに、本当に正確な配列を知りたかったら少なくとも数分子は解析する必要があるだろ。

この研究はすごいけど、その意義は正確性とは別のところにあると思うけどな

>>13
DNAコーミングという技術をつかってるとおも

また川合研か！
すでに他でやられていることをあたかも「うちが世界初」のように発表する常習犯。
このDNAをみるという話も2005年に東大で発表された技術のモノマネ。
http://www.u-tokyo.ac.jp/public/public01_171220_02_j.html

川合研は嘘の枢軸
http://www.kkcryst.com/uso/

>>15
これがほんとなら酷い話だな

>>15
よくわからないなりに流し読みしたけど、暗部を覗いた気がした(´･ω･`)

阪大といえば荒田先生

阪大といえば河田先生

米ならともかく日本で枢軸を悪の代名詞のように使わんといてや

slashきもーｗ

たしかにすごいが、その１本を鑑識が見つけるのかｗ

>>15
なるほど。>>1の元記事だとグアニンだけを検出しているが、>>15のソースと同じ方法で
プローブをシトシンでコーティングしてインタラクションを検出しているからかな。
DNA試料は一本鎖だな。


まんまパクリだろうな。

この手の話で技術的未完成は揶揄されるべきじゃないが、新規性もない
パクリ話なら完成度が唯一の存在意義だ。ゼロからスタートしてデータ得られるまでの時間とか、
一塩基あたりの解読速度は既存の方法よりも優位にあるのか？

PCRのエラー強調してるが既存の解析方法はエラー確率を含めて「何十億人にひとりの可能性」
という計算をしているはず。

>>14


PCRのエラーはそういうことではなくてコンタミの話だろ。
増幅過程での間違い以前の話ではあるけどさ。

最近、この手の似非研究者増えてるよな。
人の業績をあたかも自分が発見したように語るやつ。
あとは、トンデモ実験して学会発表しちゃうやつ。
日本のマスコミはアホだから学会発表>>論文だと思ってるやつが多い。

>>14
「１回の増幅サイクルあたり」数万塩基に１つエラーするという意味ね。
２５サイクルも増幅を繰り返すわけだから、最終的な増幅産物はエラーだらけになる。

１００００塩基長（１０ｋｂ）の遺伝子断片を、
１万塩基あたり１つエラーを起こすＰＣＲ（酵素・反応条件などによる）で増幅

　１サイクル目：　元のＤＮＡ＋エラーを含むＤＮＡ
　２サイクル目：　元のＤＮＡ＋３×エラーを含むＤＮＡ
　３サイクル目：　元のＤＮＡ＋７×エラーを含むＤＮＡ
　・・・
　２５サイクル目：元のＤＮＡ＋３３５５４４３１×エラーを含むＤＮＡ

>>15
長い一本鎖のＤＮＡを固定する方法に独創性があるのだよ。

Numerous attempts have been made to use the scanning tunnelling microscope
to sequence single DNA molecules, but difficulties in preparing samples of
long-chain DNA molecules on surfaces, and problems in reproducing results have
limited these experiments. Here, we report single-molecule DNA sequencing with
a scanning tunnelling microscope by using an oblique pulse-injection method
to deposit the molecules onto a copper surface.

>>25
昔っからそう。

最近…と思えるなら、最近あなたのレベルが上がったんでしょ。

>>26
エラーが入る位置がランダムだから、増幅産物のシークエンスは多数決で決定可能なのかな。
ＳＮＰｓ解析とかには使えないね。

>>24
俺もコンタミの話かと思った。
考古学でやるDNA検査にも使えるのかな？

川合教授は「ＰＣＲは増幅過程で間違いが起きやすい。１本を直接解読できれば増幅の
必要がない」と話している。

１本ずつ解読できても、どれが本物でどれがコンタミかわからない。

タンデムリピートの数を数えるだけじゃん？
塩基一個一個までは調べないよ。