【植物：遺伝子】理化学研究所、モデル植物シロイヌナズナの遺伝子発現地図を完成・公開

独立行政法人理化学研究所（野依良治理事長）は、植物で初めて６憶を超える
データポイントからなる大規模な遺伝子発現データを集積し（ＡｔＧｅｎＥｘｐｒｅｓｓプロジェクト）、
シロイヌナズナ遺伝子発現パターンをオンラインで調べることを可能にしました。
また、機能が未知の遺伝子の機能推測を可能にするデータベース「ＣｌｕｓｔｅｒＣｕｔｔｉｎｇ」を
構築・公開しました。

理研植物科学研究センター（篠崎一雄センター長）メタボローム基盤研究グループ
ゲノム機能統合化研究チームの嶋田幸久チームリーダーと同センターの６研究チーム、
理研基幹研究所（玉尾皓平所長）などとの共同研究による成果です。

ゲノム解析の精力的な推進により、ヒトをはじめとする生物の遺伝子のＤＮＡ配列が決まり、
網羅的な遺伝子発現の解析が可能となっています。植物の分野でも２００３年に理研（日）、
マックス・プランク研究所（独）をはじめ英、米などの研究者がＡｔＧｅｎＥｘｐｒｅｓｓ国際コンソー
シアムを結成し、協力、分担してモデル植物シロイヌナズナの６億を超える大規模な遺伝子
発現データを収集しました。

理研は、この収集で植物ホルモンの分野を担当し、コンソーシアム全体の４分の１の
データを作成しました。

ＡｔＧｅｎＥｘｐｒｅｓｓコンソーシアムが集積したデータによって、世界の研究者は、植物の遺伝子の
発現パターンをオンラインで調べたり、遺伝子の機能をコンピュータで大規模に解析したり
することができるようになりました。

理研が担当した植物ホルモンのデータを利用すると、植物ホルモンが関連する薬剤、遺伝子の
機能や作用メカニズムを推測することも可能になります。
また「ＣｌｕｓｔｅｒＣｕｔｔｉｎｇ」は、機能未知遺伝子の発現パターンを既知遺伝子のパターンと比較する
ことで、遺伝子の機能を推測できます。

本データベースは、シロイヌナズナのデータを中心に開発してきたものですが、多くの遺伝子は
植物間で共通に働くため、イネなど産業上重要な植物の遺伝子機能推測にも応用できます。
さらに、植物の成長を制御する新しい手法の開発や、農薬などの開発に貢献することができると期待されます。

本研究成果は、英国の科学雑誌『Ｔｈｅ　Ｐｌａｎｔ　Ｊｏｕｒｎａｌ』オンライン版に近く掲載されます。

（ソース記事が長いため割愛いたしました。続きはソースでご覧下さい）
ソース：http://release.nikkei.co.jp/detail.cfm?relID=188729&lindID=4
日経プレスリリース　2008年5月12日

ご依頼戴きました
http://news24.2ch.net/test/read.cgi/scienceplus/1199896106/525

「そんな研究、何の役に立つ？」と言われやすい昨今、プレスリリースの文章が
よく考えられている。

シロイヌナズナ!!

シロツメクサの異常を誰か論文に汁

長野県伊那市より、植物の奇形発生報告
http://hobby11.2ch.net/test/read.cgi/engei/1209083035/13

シロイヌナズナって食えるんだぜ！！
ホームレスになったらお試しください

姉の家庭教師から、アブラナ科は十字花植物、セリ科はカラカサ花植物、
十字花植物はすべて食べられ、ガダルカナルでも役立ったそうだと聞いた。

色々調べたが、ガ島で食べていたかどうかは戦記物では不明。
ビルマからソロモンまで「ジャングル春菊」というスイゼンジナを
広範に食っていた話しか出てきません。

オミクスオミクス