【ゲノム】遺伝子発現情報(タイリングアレイ)で未知の遺伝子構造を推定＝理研

　独立行政法人理化学研究所は、タイリングアレイ（遺伝子発現情報）とゲノム情報を
組み合わせて統計的に解析することにより、遺伝子の構造を高い精度で推定する
新しい情報処理技術を世界で初めて開発しました。この技術をシロイヌナズナの
データに適用し、これまでに知られている約２万７千の遺伝子領域のほかにも、
約５千２百箇所の領域で発現している新たな遺伝子構造を見出しました。ゲノム
科学総合研究センター（榊佳之センター長）、ゲノム変異機能情報研究チームの
豊田哲郎チームリーダーらによる研究成果です。
　解析したこれらの遺伝子構造は同センターが運営する統合データベースGPS
（Genome-Phenome Superhighway）にて公開し、遺伝子のネットワークや変異体の
有無に関する情報もあわせて提供しました。また、この処理を行うために独自に
開発したプログラムARTADE（アートエード）の全ソースコード（プログラム内容）も
公開しています。
　研究チームはこの技術をもとに、理研植物科学研究センターの篠崎一雄センター長
らと協力してタイリングアレイを使った新規遺伝子の探索と機能解析を推進しており、
乾燥や低温などのストレスに耐性がある作物や有用物質生の産性を高める作物の
創出にもつながるものと期待されます。
　本研究成果は、英国の科学雑誌『The Plant Journal』８月号に掲載されます。

ポイント
・シロイヌナズナで、新たに約5,200箇所で発現する遺伝子構造を発見
・独自に開発したプログラム全情報を発見された遺伝子情報とあわせて公開
・ｃＤＮＡとは別の手法で遺伝子の構造を決定

引用元：理化学研究所プレスリリース
http://www.riken.go.jp/r-world/info/release/press/2005/050630/index.html

Omic Space ARTADE
http://omicspace.riken.jp/ARTADE/

ｼﾛｲｲﾅﾂﾞﾏ？

白犬ナズナ？

そろそろ植物体をコンピュータ上で再現できるようになるのかな

ニュースになるような論文じゃないと思う。
手法自体も動物ではありふれてる。特に面白い遺伝子が見つかったわけでもない。
ただ、こういう研究できる予算や設備があるところは(植物系では)限られてるから、
こういう仕事をやってくれるのはありがたいけど。

タイリングアレイで殴り続けると死ぬ

アルゴリズムの問題だろ
濡れモノの連中は脳みそ筋肉だからな

この記事のどのあたりがおもしろいのか

タイルの配列網アルゴリズム

>>8
タイリングアレイが萌えるところです
ちなみに内容はよくわかりません

>>9‐10
ありがとうございます！
解決しました