>>1 当該URLにあるのは「御社のプログラムファイルを改ざんしたもの」でしょうか。
それとも、「御社のファイルを書き換えることが出来る御社以外の方が提供するプログラム」でしょうか。
前者であるならば任意削除対象(リンクは著作権を侵害しないため、リンク先に侵害ファイルが
あっても著作権による責任は無い)ではありますが削除を検討します。
後者であるならば当該リンク先ファイルは御社の著作物ですらないので著作権を主張するのは不当です。
リンク先プログラム作者が御社と係争中かいなかなどは御社と当該ファイル作者の問題で2chには
関係がありませんので、当然ですがその場合は削除対象にはなりません。
あとは星猫さん、告知をお願いします。
以上の情報を待ってから判断します。