JR中村線 (窪川-中村 43.4km) - 1988年4月1日 土佐くろしお鉄道に転換
JR長井線 (赤湯-荒砥 30.6km) - 1988年10月25日 山形鉄道に転換
JR宮津線 (西舞鶴-豊岡 83.6km) - 1990年4月1日 北近畿タンゴ鉄道に転換
JR鍛冶屋線 (野村-鍛冶屋 13.2km) - 1990年4月1日 バス転換
JR大社線 (出雲市-大社 7.5km) - 1990年4月1日 バス転換
JR糸田線 (金田-田川後藤寺 6.9km) - 1989年10月1日 平成筑豊鉄道に転換
JR田川線 (行橋-田川伊田 26.3km) - 1989年10月1日 平成筑豊鉄道に転換
JR伊田線 (直方-田川伊田 16.2km) - 1989年10月1日 平成筑豊鉄道に転換
JR宮田線 (勝野-筑前宮田 5.3km) - 1989年12月23日 バス転換
JR湯前線 (人吉-湯前 24.9km) - 1989年10月1日 くま川鉄道に転換
■特定地方交通線以外
JR函館本線 (砂川-上砂川 7.3km) - 1994年5月16日廃止
JR深名線 (深川-名寄 121.8km) - 1995年9月4日廃止
JR七尾線(一部) (和倉温泉-輪島 48.4km) - 1991年9月1日 のと鉄道に移管。2000年4月1日 穴水-輪島間(20.4km)廃止
JR美祢線 (南大嶺-大嶺 2.8km) - 1997年4月1日廃止
JR可部線 (可部-三段峡 46.2km) - 2003年12月1日廃止
※廃止日は営業最終日の翌日である
参照
http://ja.wikipedia.org/wiki/%E7%89%B9%E5%AE%9A%E5%9C%B0%E6%96%B9%E4%BA%A4%E9%80%9A%E7%B7%9A