【医療】スパコン「京」で抗がん剤開発、初の商業利用 中外製薬など候補物質を探索

中外製薬、興和、富士フイルムはそれぞれ、富士通や東京大学と組み、9月から世界最速のスーパーコンピューター「京」を使った
抗がん剤の開発に着手する。分子構造などをもとに、計算によって多数の化学物質から有力候補を探し出す。
探索期間を従来の10分の1の半年〜1年に短縮でき、開発コストを減らせる。企業が京を商業利用する初のケースとなる。

スウェーデンのストックホルム大学とも連携して３月にソフトウエアの開発などに着手。9月から京の使用を開始する。
3社は別々に、胃がんや大腸がんを狙い撃ちする新タイプの抗がん剤の候補物質を探索。来年3月までに有力候補を見つけ
製品化を目指す計画だ。

従来、抗がん剤の有力候補を選ぶにはがん細胞などへの作用を試験管内で確かめており、手間と時間がかかっていた。
スパコンを使う方法は、がん細胞だけが出す特殊なたんぱく質と候補物質の結合を計算で模擬実験し、結びつきやすい物質を
探す。原子・分子レベルで物質の構造を設計するのにも役立てる。

計算量が膨大なため従来のスパコンは能力不足だったが、1秒あたり１京（京は1兆の1万倍）回超の計算性能を持つ京なら
実用的という。臨床試験を含めても、新薬の開発期間を5年程度に抑えられる可能性がある。

京は理化学研究所と富士通が開発、9月に本格稼働する予定だ。製薬のほか電子部品の開発や車体の設計など
幅広い産業用途が見込まれている。

画像
計算速度世界一のスーパーコンピューター「京」(2011年11月、神戸市中央区)
http://www.nikkei.com/content/pic/20120216/96958A9C93819696E3E4E2819F8DE3E4E2E0E0E2E3E08698E2E2E2E2-DSXBZO3886571017022012I00001-PB1-4.jpg

日本経済新聞
http://www.nikkei.com/news/headline/article/g=96958A9C93819696E3E4E2819F8DE3E4E2E0E0E2E3E08698E2E2E2E2?n_cid=DSGGL001

京都市民として誇らしい

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↓レンホウが一言

萌え太郎

ren4フォーエバーw

早いお出ましｗ >>3

国民の税金で作ったスパコンだけど製薬会社は利益の還元はしないのだろ

やっぱり二番じゃだめだったんだ
解散しようぜ

結果は出るが

効かないんだなこれが。
プログラマとかセオリ考えるやつが


馬鹿だから。

恥を世界にさらして無駄使いで終わり

これ、どうやってるんだろう。

分子の結びつきって言ってんだから、
量子化学の類のシミュレーションだろ？高分子だから結構大規模な計算になるな。

だが面白そうだね。理解に時間がかかりそうだがｗ

>>8
製薬会社だって税金を払うだろう
新薬で売り上げが大きくなれば、その分払う額も大きくなる

中外製薬ってロシェに買収されたんじゃなかったっけ

で、フェイズいくつなの？

電力どんだけかかるんだろ。

試験管内の実験期間がわずかに短縮される程度だと思う。
vivoでドロップ。

活用したらＲ４に怒られるんじゃないかね？

>>1
あんまり調子に乗ってるとレンホーにいやがらせされるから気をつけろよ

>>12
うん。国内企業だし、医学の発展になるならいいと思う。
変に利益追求で稼働率下げるぐらいなら、タダでも使わせて稼働率あげたほうがマシだと思う。

>>1

不治痛　製　で　希望を抱くなよ(笑)

>>16
最初からふるいにかけた可能性のある物質でしか
実験しなくてすむのなら、大幅な時間短縮になるよ。
探索期間とは、そういう意味だろう。

肝は、どの位のシミュレーションの確度が獲られるかだな。
シミュレーションの選定物質が多すぎたり、漏れが多かったら話にならない。
そこの基礎的検証だけでも時間がかかるのは仕方がないな。

だが、これはマジで建設的な試みだよ。

R4の「二番だと意味がないの？」の質問に
「いやいや、ちゃんとこういう実務的な使い方をしますよ」
と答えればよかったのだが
ぱっと出てこなかったところを見ると
強いニーズがあったわけでもないんだろな

R4「どうして日本がやらないとイケないんですかぁ？」

R4「偉大なるチューゴク様に任せれば良いじゃないですか！」

>>22
は？

三角コーンで仕切るなよｗｗｗ
もうちょっとオシャレにしろよハゲ！

スパコンに日本の政治をお任せしたい
過去１００年の世界のデータを基に、こうしたらこうなるという予測をさせればよい
全国民と一対一の対話も可能になる
少なくとも民主党のゴミ朝鮮人議員よりマシだろう？

>>21
母核が決まっていて、側鎖だけ変えたモノを篩分けしている段階がいくらか短縮する程度じゃないの。
シュミレーションなんていくらやっても、絵に描いた餅と同じで
何の説得にもならないと。

建設的な試みってやつが実際に役に立った試しが現場では見つけられない。
そもそも、逆だろ、シュミレーションから薬品が開発できてから
高速演算が必要になるってことになって、スパコンを利用する。
スパコンを作ってから利用方法を考える時点で利権重視で終わってます。

難しそうだけど面白そう

心神の実機が飛ぶ姿を早く見たい
京で開発が加速しないかな?
しかし、防衛省は機密の写真や起用の機名、データの公表し過ぎ
あちら国々にもスパコンもある事に認識不足な気がする
かなり分析されているよ、未知数は防衛にも繁栄するって先生が言ってた。

いい加減ガンの特効薬作ってくれ　

あれ？UDで何年か前にがんの解析終わってたろ？

>>31
あれは、がん解析が終わったわけじゃ無い
たしか、今後ガンの薬を開発するに十分なネタ(5年分だったかな)
が集まったので、止めただけのはず

ガンで死なない老人がその辺を徘徊するようになるだろうから、
徘徊防止薬剤の開発のほうが良いと思うが。

二番じゃダメなんです！

丸山ワクチンが効くのかどうか、スパコンで調べられないのかなぁ

新薬が開発されてもレンホーの家族には使わせちゃダメだよ。

これでトリップ検索したら凄いの？

10年後とか有名人がガンです、ガンですって状態になるだろうからなぁ
乳がんとかほんとやめてほしいんですけど
とにかく副作用のほとんどない抗がん剤をさっさとつくってほしい

>>8
タダで借りれるわけないじゃん
それなりの使用料は取るよ
電気代もかかるし

>>1

俺のスーパーコピュータが、５秒で結論はじき出したぞｗ

箱根から北の、本州に巣むな！

R4の息子のマジコンがどうしたって？

インチキ薬の開発にスパコン使うのか

>>38
現場を知っているとびっくりするだろうけど、
副作用が強烈なヤツほどよく効くってことで大量に使われる。
穴って言う穴から血が吹き出ないと効いた気がしないって。

えっなんでコンピュータが薬を作るの？

遺伝子解析とか品種改良とか医学・生物関係で威力を発揮しそう
工学・力学系はそこらのPCで間に合うんでしょ

半年〜1年で見つけなきゃいけないんですか？
２年じゃ駄目なんですか？

ここでスパコン馬鹿にしている奴は有用な薬が出来たときに使う権利無しでいいんだな

書家は誰なんだろう

「厚労省の天下りに経産省の友人がいて、利用するよう頼まれました」

京コンピュータが神戸に出来たのは地震の復興事業の意味があるのかな？

だとしたら、今度は、仙台に Linear Accelerator を造るのかな？

>計算量が膨大なため従来のスパコンは能力不足だったが

そんなにすごいもんだったとは

まあ蓮舫に関しては正論だったからな　
蓮舫を批判する奴は分かってないやつばかり

>>51
従来のスパコンでも、その時から始めてれば、終わってたりしてな

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レンフォーじゃダメなんですか？

┃|　 三
┃|　　　 　三
┃|　 三
┃|　　　 三
┃|　 三
┃|
┃|　ピシャッ！
┃|　　∧∧
┃|　 (；　　)　三
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>>52
まーだそんなこといってるのかｗ
仕分けるにはR4だって勉強してなきゃいかんのだよ
知識もないくせにあんな場に出てくるからたたかれるんだ

なんかのドラマで見たが抗癌剤って作っていいんかねぇ...
世界人口増加、医療費拡大...

まぁ自分がなったら早く完成してくれと思うんだろうけど

年金をたんまり貰っているジジババを更に増やそうとしているわけだ。
ジジババ、どうやって死ねるんだ？

>>58
アホかよ
福島原発事故の放射能汚染で若い世代だってがん発生率は上がる
対策は一つでも多いほうがいいだろ

年金受給者が生き延びて、支払うほうがどんどん死んじゃうってイメージ。

そういえば１２年ほど前、白血病ゲノム解析のために
ネットにつながってるパソコンのCPUを使うプロジェクトがあったっけ

>>31-32
>>61
UDは終わり、今はBOINCという分散コンピューティングが始まっている。
詳細はwikiでどうぞ。
http://team2ch.info/?BOINC

数年前に友人の知人が再生不良性貧血で亡くなったので
UDプロジェクトに入った。今はBOINCでやってる。
Team2ｃｈやnews+が増えてくれると嬉しい。

マジコン蓮舫への呪詛返し。

使えるのはいいことだと思うけど
世界で分散処理はどうなってくのかな
ネット規制のあおりくらって減速するのかな

ご冥福を蓮舫

近くの駅が、京コンピューター前に変更されてた

>>27
今の量子化学や分子動力学シミュレーションは多方面への応用が始まっている。
実験屋の出番は少なくなるだろうが、そんな理由でやらないのは遅れの原因になる。
化け学は、実験屋の派閥も強そうだしなあｗ　理論系増やすべきだよ。

>>62
２ちゃんねるって役に立ってんだなｗ　見直しましたｗ　さすが昔とは違うｗ

>>56
それこそまだ言っているかだろう

別に画期的でもなんでもないスパコンに大枚をかける必要があるかという話だ

なんか勘違いしてるがこの京を利用するのに時間頭で金支払うんだよ？
今はまだ検討中で時間頭の単価の発表もないが。
無料で利用できる場合もあるけどその場合は検討して有意義なものであると判断された場合。
それ以外の場合は基本的に利用時間のユニット単位（CPUを何割使うかとか）で金払うんだよ

しかもこれスパコン向けに最適化したプログラムかけるやつなんて
世界中探しても一握りしかいないからなるべく最適化して書いたプログラムを
スパコンでさらに最適化してプログラムを作るっていう・・・

スパコンみたいなめちゃくちゃ熱出すやつは、
神戸ポーアイとか大岡山とかじゃなくて、
名寄とか陸別につくるべきじゃないの？

ロケット打ち上げは、なるべく南の
種子島につくったように。

>>68
技術継承という意味において最新鋭を追うことは正しい。
日本が失った技術として戦闘機とかあるっていうのに・・・
一度途絶えてしまうとまた作ることが難しいんだよ

京の周辺は完成前から医療研究の施設がいっぱい集まってるよ
認めたくない人は土地が売れなくてがらがらってずっと言ってるけど

スパコンを医療研究施設の(地理的に)近くに置く必要があるの？
田舎にまで光ファイバー網を引いた日本で。

>>73
なぁ専用線のコストっていくらかかるか知ってる？
インターネットが発達していてもお互い顔を合わせての会議って重要だって知ってる？
そのために日本MSはオフィスを一カ所に集約したりしたよね。
それまではシャトルバス走らせてたんだけどさ

NECがやってたようなベクトルプロセッサなら
その意見もありなんだが
京はひたすら規模だけ拡大
しただけで新味が乏しすぎる

中外製薬って外資だろ
国内メーカーと組めよ

>>52
民主党員乙
日本のために早くいなくなってくれないか？

>>75
スパコン技術がCPUだけだと思ってるなよ・・・

漢字のロゴってやっぱカッコいいなー

>>68
そんな話じゃねーよｗ
R4が欲しかったのはなんか役人を成敗してる正義の私の絵だけ
スパコンについて勉強する気も理解する気もまったくなくて
とりあえずみんな正論だと思ってくれるような言葉を強く言ってやればR4の目的は達成できるんだよ
そこを揚げ足取られてるだけなのにR4をどう擁護するんだよｗ

>>78
プロセッサ間の通信技術などの周辺技術
なら京の規模と予算は不要でしょ
小形発電所ひとつ要るレベルの消費電力
とかランニングコストも膨らみすぎ
１／５位の規模で改良しながら
短い期間に複数設置していく方が
実用的で技術開発も進むだろ

>>78
この計画が初めての商業利用って
そんだけ扱い難いシロモノって事だわ
大艦巨砲ハコもの行政過ぎたんだよ
少なくともNECが降りた時点で予算は半減すべきだったんじゃね？

柴舟

一応京って現在は、無償で使えるんだよな・・・・・日本企業のみ。
ソフト移植に手間取ったが、最近まともに活用出るようになった。
移植に加えて、今までのような分子レベルでなくて原子レベルでの解析に変更したので、京+新型ソフト使っても時間がかかる。
が、分子レベルでのシミュレートでの新薬開発はもう限界見えてるので、原子レベルまで進まざるを得ない。

もうスパコン＝蓮舫のイメージしかないな

>>82
正論

最近の自然科学分野の研究でスパコン必須なんだけど、スパコンの処理速度の関係で効率が悪い。
京が自由に使えればな・・・・。
FX10導入してほしいな、理論値では2.2倍だそうだし。
米国なんてエクサフロップスに突入するようだし。
世界最速の京ですら、テラフロップス。

火遊びは危険じゃぞ！

スパコンはMD用だったはず。だから中国様から命令をうけたR4がつぶそうとしていたじゃね。

>>22
蓮舫「一位じゃなくても開発できますよね」

>>66
ポートライナーだな

机上の空論

片っ端から合成してマウスに投与しまくったほうが効率的

なにもしらない株主が好きそうな話だね？　　株価操作の一種か？

>>92
分子生物学勉強して来いよ・・・・・。

ある国で採取してきた土壌の微生物をまとめて解析したりできるよね？　　逆にいえば作用点わかってる場合、同じ様なくすり、バイオシミラーも作りやすくなるよ

>>92
動物実験てすげー金かかんの知ってる？

Ｒ４「まったくあなたたちは『スパコン！スパコン！』と・・いやらしいですね///」

てか、円周率の計算をやっているコンピュータにやらせればいいんでないのか。

>>82
ちげぇよばか
まだ「京」の運用ルールは決まってねぇの
これは中外製薬が使うことに名乗りを上げたかなんかの記事で
「まだ」使ったわけじゃねぇよ馬鹿

京の運用ルールは去年決まってなかったか？
日本企業で京の成果を社会に還元(どういった用途で使ったかを公表)した場合は無償、それ以外は有償。って発表してたと思うが。

前臨床に決め打ちで化合物選定したいんだろけど、スパコンで解析するレベルって２０年先のターゲットじゃないと意味ない　　１０年先の有望な化合物はとっくに抑えられている　　具体的な疾病や化合物探索についての情報がないので、まったく記事としては価値がない

>>100
ttp://hpcic.riken.jp/index.html
それは検討会で出た意見であってまだ正式な運用ルールの決定はしていない

＞探索期間を従来の10分の1の半年〜1年に短縮でき、

まだまだ遅いな

↑
↑
↑
↑
一位の結果がこの体たらくです。
↓
↓
↓
↓

科学技術世界最先端神戸

俺と相性バッチリの異性も探索してくれ

>106
ゼロだから無理

国家戦略って難しい。地球シミュレータとか宇宙開発とか産学共同だの結局その過程で潤う奴らは限られるし。

今どき頭のおかしい自治体や政令指定都市が経済効果で駅前にテナントビルを建てましょう、もちろん
社長や顧問は天下り役人や市幹部でとかいう話と変わらん。

今年の豪雪をシュミレートして、雪かきの効率化ができたら認めてやる。

しゅみれーと

>>109
シュミレート？
なにそれ・・・・・。
シミュレートとはどう違うの？

京の建設目的がこういうことならば、R4に馬鹿にされるような仕分けは
なかったでしょうに…。

仕分けの席で、ベンチ世界一が目的な事業でその後の使い方については
ほとんど未検討とか世界一とった後について、民間、研究機関の
利用規定も目的も特に設定していない事業だったら仕分け対象になるわ。

目的なんか設定するとそれ以外の利用が暗黙の了解で制限されるだろ
お役所仕事なんだと思ってんだ

目に見えない分子構造を簡単に描く専門家の記憶も、実際は１／京くらいの量でしかない。
それら無限と思われる分子構造の解明と、新たな分子構造の開発はまさしく無限だろう。
それをまた、機能効能をシミュレーションすることもまた、無限に近い。
このまた何倍速かのコンピュータが必要になるのは間違いない。

>>114
全ての分子を対象に計算していると思っているんだ。
標的酵素の分子構造にどうやって薬剤が結合するのかって計算しているんじゃないの？
基本的な薬剤の母核は出そろっていて、側鎖をどう変化させるかってことぐらいの
事だと思うけど。
トライアンドエラーが幾分減るだけだと思う。

よく切れる刃物を作ったけど、何を切っていいか、さっぱりわからんって事だと思う。

スパコンは雪国に作って熱で雪を融かせば一石二鳥という話があったな

>>74
ウチの会社はウェブカメラで、支店との会議をするんだけど、お前の会社は、
今だに人を呼びつけるのか？

20年くらい前、ネットにつながってるＰＣの空いた時間を使って
分子構造のシミュレーションをさせて抗がん剤を作るっていう試みがあったな
　
今でいうクラウドの走りみたいなものだったと思う

1分　1秒　でも早く開発したいならその時点での最速のスパコンを作る必要があるね。
でも今の政府はどうみても　お金＞＞＞＞人命　だから・・・・ダメダ・・・

UDを思い出したｗ

まぁ基本の計算方法が間違ってると結局意味無いんだけどね。

殺人レンホー

>>121
まあそりゃそうだ。
だがしかし！結果が早く出れば間違いに気づくのもはやくなるんじゃね？

>>119
死刑囚の人命は尊重してるぞ。

あ、そうか。ＵＤっていう名前だったな。
Ｗｉｋｉで確認したら２００１年〜2007年。２０年前じゃないわ、１０年前だ。
　
Ｔｅａｍ２ｃｈ　今となってはなつかしい・・・

>>124
そうだった・・・・　Orz

今の政府は守るものが全部逆なんだよなー・・・・

昔みんなで解析やってたじゃん。
あれボランティアじゃなくて、宝くじっぽくしたらどうかな。

>>112
だから、京の建設目的は元々こういった広域利用を目標にしていて
こういった用途に利用できます。って言うのは言ってたよ？
それを使うかどうかは企業、大学等で決めることなのに
こういうことに使われます。っていうのは言い切れないだろうよ

>>117
そんなセキュリティもくそもない状態でよく会議できるな・・・
おまえの会社はっていうかMSとかも最近まで集まって会議してましたよ。
デジタルが進もうが顔をつきあわせての会議の効果っていうものがあるんですよ

>>129
うわ・・・・　ふるい・・・・・・

ガンの特効薬なんてとっくの昔に完成してる。
莫大なガン患者利権によって表に出ることを許されていないだけで。

って言う人めっきり見かけなくなったけどタブーなのかな。

このテの、莫大な計算が必要な医学分野の問題は、
BOINCみたいな方式が解決したんじゃなかったの？

「スパコンよりも、名もなき世界の有志が結集したほうが強力」だったんじゃないの？

>>129
ありえない。
元I◯M勤務だけど数年前から
Webカメラで会議してたが。

>>133
あり得なくないよ、顔を合わせることは必要だもの。
だから、MSはオフィス統合したし未だに日本MSから
アメリカにいって会議することもあるし逆に来て会議することもあるよ

一体何がありえないのか理解出来ない。Skypeとかで重要な会議でもすんのか？
専用の会議システムが何をやってどうしてそんなにかかるのかぐらいは理解しとけ

>>134
顔つき合わせて言いたいことも言えない会議をするんですね。
移動費だけで時間の無駄です。

抗がん剤とがんワクチン、ケースバイケースなんだろうけど
今後期待できるのはやっぱり後者なんでしょうか

>>89
MDのどこに使うんだ？

今まで置物だったの？

>>8
規定の使用料を納めてるし
そもそも抗がん剤の開発自体が
人類の恒久的利益だろ

苦しい言い訳は、チョンかなｗｗｗｗ
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>>133
Webカメラなんか使って遅延は問題にならないの？

>>135
顔をつきあわせないとだめな会議もあるってことを覚えておいた方がいいよ
人間の脳みそはデジタルだが入力はアナログなんだよ

>>92
>片っ端から合成して

原材料選定と合成手順の数が天文学的数字になるのは想像つかないのかな？バカでしょ、あんた。

>>22
「専門的なことを言わないでください。」
「ハハハ、分かりません。」

>>143
その天文学的数字になることが想像できても合成して選別するの。
当たると儲かるけど、外れると外資に持って行かれるって寸法だ。

一発当たると1千億円の宝くじってやつ。

>>142
感覚細胞でデジタル信号としてるんだから
デジタル入力と言って良いんじゃないの？

高タンパクの分子構造わかっても
どうやって化学合成するの？

>>142
ないよ。カメラの前で、顔が見えてるんだから、目の前にその人がいるのと
同じ事だよ。ウチの会社は、そのお蔭でどれだけ出張費が浮いたことやら。

大体、『顔を合わせないとダメ』って、アナログ思考をしてる事がおかしいんだけどな。
そんな事をしてるから、会議の主旨よりも人が集まる事が大事、みたいな風潮が
無くならないんだよ。

>>147
蛋白を合成するわけじゃなくて、酵素の阻害剤とかを探索して、合成するだけ
MWで大きくても500とかだから、構造決まれば逆合成するだけでしょ

商用生産用の大量合成検討は、今なら原薬受託会社の方でやる

いいなあ　タミフルでボロ儲けした会社は

ほれみたことか蓮舫
やっぱり一番じゃないとだめなんだよ

今年、もう５位くらいになっちゃうらしいね

そういえば昔クラウドでやってた分析プロジェクト
結局なんかの役に立ったのかなあ

>>26
予言機械？　安部公房は、60年代に小説にしてる

>>146
データ切り落としてるがデジタルではないよ

>>148
そう思ってるうちは成長しないよ
アナログとデジタルの違い、システムであっても使うのは人なのに。
アナログ思考っていわれてもMSでもやってるしAppleもやってるよ？>>顔つきあわせての会議

>>155
脳がデジタルなら感覚細胞もデジタルじゃないの？
どっかでA-D変換してるん？

2chでもオフ会やるからね
オンばっかりですべてすむわけでもない

（ﾟ。ﾟ）

よかったなぁ、お前らの税金で末期がん老人がさらに長生きするぞ！ｗ

中外は外資比率75%でほとんど外資だしな
武田とかなかったのかね