ファミリーマート、QUOカード使い組織ぐるみの巨額脱税か　ファミマの闇は深い　©2ch.net

別の商品で例えるとわかりやすいのかも。
別の自転車屋で売ってた自転車を借りてきて自分の店に並べ、仕入れたものとして処理。
その後廃棄したことにして元の店に返せば、自転車の仕入れに必要だった分の費用を誤魔化せる。

QUOカードがどうなってるかは分からんが、
バーコードついてる商品よりもQUOカードの方がやりやすかったんじゃない。