あの映画のココがわからないPart2

ここでやっと「ミッションインポッシブル」の謎がとけた。>>48ｻﾝｸｽ

で、「クリムゾンリバー」なんだが、あれどう言うオチなんだ？
大学の関係者は近親婚で血が濃くなって遺伝性疾患が増えてきた為、
村人の健康な子供と自分達の子供をすり替えて、健康な子供に教育を
施して「健全な肉体、優れた知性」（だっけ？）を獲得しようとしていた。
そして、双子の姉妹の内の一人と学長の息子が交換されていて、残った
双子の片方は事故に見せかけて殺されそうになっていた。ここまではいい？

その先が分からない。なぜ今になって関係者を殺し始めたのか。しかも
交換された子供は沢山いただろうに、関係者はなぜいきなりピンポイント
で双子の死んだはずの片割れを疑うのか。そもそもなぜ交換されなか
った双子の片方は命を狙われたのか。
分かる人、教えて下さい。おながいします。