>>199 ポップアップとかOhter...とかなんのこっちゃとわからんが、ソースに対してどう処理するかは Project の Build Rules でできる
http://www.cocoanetics.com/2012/02/xcode-build-rules/ のように
Custom Script の部分はコマンドでコンパイルするのと同じように1行書けばいいだけ
対象ソースファイルやディレクトリなどの諸々の環境変数があるので、それを拾ってくっつけて
Output Files はコンパイルするときの -o の部分(nvcc ではどうか知らんがたぶん同じだろう)と同じのを書いておけば、勝手にリンクしてくれる