使えるdefaultsを書き込め

Leopard限定。
ことえりでスペースを半角に。
$ defaults write com.apple.inputmethod.Kotoeri zhsy -dict-add " " -bool false
再ログイン。(または killall Kotoeri)
trueで全角に。

ほかにもあるから、見てみれ。
defaults read com.apple.inputmethod.Kotoeri zhsy

わけわかめになったら、まるごと消せば次回に元に戻るみたい。
defaults delete com.apple.inputmethod.Kotoeri zhsy

~/Library/preferences/com.apple.inputmethod.Kotoeri.plist を編集する方が楽かもしれん。