そうです。OSを再インストールしてから、手動で移せるものもあるということです。
アプリケーションによっては再インストールが必要なこともあります。
復元というのは大抵の場合リカバリを指し、その場合には(おそらく
>>915が意図した)
ディスクユーティリティを使って、特定のボリュームのイメージファイルを作成し、その
内容をそっくり、空のディスクに書き戻して元の環境を作る(復旧する)ことです。
>>914のバックアップ方法にもよりますが、手動の場合には、新しいシステムの同じ階層
に必要なファイルを手動で移してやる必要があります。