Mac OS Xでサーバー

よーくみて下さい。
ScriptAlias /cgi-bin/ "/Users/ユーザー名/Sites/"
「http://*/cgi-bin/*」でアクセスしてきたら、「/Users/ユーザー名/Sites/*」で置き換える指示ですよ。

> localhost/cgi-bin/test.cgi で動くのに、
> localhost/~お前様/test.cgi で動かないのはなぜ…。

「localhost/お前様/*」でアクセスしているんだから、動かないのは当然。
思い込みは捨てて、一字一句、しっかり解釈していきましょう。

ここら辺で修行しましょう。
http://localhost/manual/
http://homepage1.nifty.com/glass/tom_neko/web/
http://www.mikeneko.ne.jp/%7Elab/web/htaccess/
http://www.rfs.jp/server/apache/index.html
http://cc.sakura.ad.jp/apache/beginner/httpd-conf.html