GNOME 3歩目

クリックしたウィンドウを出しているアプリケーションを強制終了させる、ということだろ?
それなら「アプリの強制終了」というのをパネルに追加できる。(パネル上で右クリック)
「アプリの強制終了」アイコンをクリックしてからウィンドウをクリックすればいい。