転写活性化について騙ったりして、、

148 ：名無しゲノムのクローンさん：02/10/09 00:56

Chromatin Immunoprecipitation Assay (ChIP)を
はじめたいのですが、初心者でも簡単にいくでしょうか？

149 ：へたれ黒マチン：02/10/14 11:57

頼まれてた総説をやっと書き上げましたので(>131)関連の話をしていきたいと思います。

1.　HATは構造上の類似性からGNAT、MYST、p300/CBP、SRC、TAFII250の5つのファミリーに分類されます。
2.　ヒトで少なくとも13種のHATが存在することが明らかになっています。
3.　ヒストンには少なくとも15箇所のアセチル化されうるLysが存在するらしい。
4.　GCN5欠損株において2倍以上に転写が増減するのは268/4912（約5％）である。(Cell,95,717)
　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　（つづく）

>148 これは俺も教えてほしい。詳しい方いませんか？

150 ：名無しゲノムのクローンさん：02/10/19 12:52

簡単だよ

151 ：名無しゲノムのクローンさん：02/10/19 13:09

免疫沈降がきちんとできる人であれば、きれいにできるんじゃない？
うちのM1は苦労しているが・・・。
もちろん、みたいタンパクとDNAとのインタラクションの強さにも
よるんだろうね。
ストレスとかで一瞬しか結合しないとかだと難しいかも。
一番良いのは、うまくできているところでその人に指導を受けること、
そうすれば、うちのラボの人間でもできてたよ。
何もノウハウの無い状態でやるとそれなりに苦労する。
使っているソニックの機械だってみんなまちまちだしね。

152 ：名無しゲノムのクローンさん：02/12/01 16:20

AGE

153 ：名無しゲノムのクローンさん：02/12/02 00:27

転写やってる研究者ってやたらキット使うのを嫌わない？
手間ひまかけて夜遅くまでかかって実験してるだけで満足してる香具師が多い気がする。
で、結局論文にするほどのネタにはならない。
転写つうのは生命現象の基本で世界中でみんな興味を持ってやってるから競争が大変。
日本で並の研究室では研究費でもマンパワーでもアメリカにはかなわないので世界の競争について行くのは無理なんじゃないかな。
かといって大金を投じても世界の競争には勝てない事は既に示されているし。。。
やっぱ分野変えようかな。

154 ：名無しゲノムのクローンさん：02/12/02 01:02

教科書的にはプロモーターは配列の方向、位置が厳密なもので
エンハンサーは向きを変えようが位置を少々ずらそうが転写活性化能に
さほど変化が無いものと書かれてます。
が、これはSV40の初期遺伝子のことなので、哺乳類を初めとする
動物のこのあたりのことがまとめられたレビューがあったら
教えてください。
なんか厨な教えて君レスですみませんがお願いします。

155 ：＞154：02/12/02 01:07

Latchman, D.S. "Eukaryotic Transcription Factors" 2nd edition Academic Press

156 ：名無しゲノムのクローンさん：03/01/04 02:24

アセチル化、脱メチル化、リン酸化、ユビキチン化、などなどあってとても大変。

157 ：名無しゲノムのクローンさん：03/01/04 02:30

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158 ：山崎渉：03/01/11 13:32

（＾＾）

159 ：山崎渉：03/01/18 13:11

（＾＾）

160 ：名無しゲノムのクローンさん：03/01/22 19:38

age

161 ：名無しゲノムのクローンさん：03/01/22 23:31

誰も転写しないのか？

162 ：名無しゲノムのクローンさん：03/01/22 23:31

　　　______________
　／:＼.＿＿＿_＼
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163 ：名無しゲノムのクローンさん：03/02/21 03:16

活性化してみる

164 ：名無しゲノムのクローンさん：03/02/21 12:43

>154
実際にはプロモーターは転写開始点を厳密には決定しないよ。
もちろんTATAなんかだとかなり厳密なんだけど、
CpG islandがプロモーターとして機能する遺伝子では
その領域内に複数の転写開始点があるしね。
そういう遺伝子がどのくらいあるかははっきりとはわからんけど、
網羅的に予測プロモーター調べたデータでは
全体の半分くらいだったような。

165 ：山崎渉：03/03/13 14:03

（＾＾）

166 ：山崎渉：03/03/13 14:11

（＾＾）

167 ：名無しゲノムのクローンさん：03/04/17 00:48

あげる

168 ：山崎渉：03/04/17 08:44

（＾＾）

169 ：名無しゲノムのクローンさん：03/04/18 18:35

AGE

170 ：山崎渉：03/04/20 03:58

　　 ∧＿∧
　　（　　＾＾）＜ぬるぽ（＾＾）

171 ：山崎渉：03/05/21 23:54

━―━―━―━―━―━―━―━―━[JR山崎駅（＾＾）]━―━―━―━―━―━―━―━―━―

172 ：山崎渉：03/05/28 14:39

　　　　∧＿∧
ﾋﾟｭ.ｰ　(　　＾＾）＜これからも僕を応援して下さいね（＾＾）。
　　＝〔~∪￣￣〕
　　＝ ◎――◎ 　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　山崎渉

173 ：山崎渉：03/07/15 13:14

　__∧＿∧_
　|（　　＾＾）|　＜寝るぽ（＾＾）
　|＼⌒⌒⌒＼
　＼ |⌒⌒⌒~|　　　　　　　　　山崎渉
　　 ~￣￣￣￣

174 ：なまえをいれてください：03/07/24 16:43

ハッキリ言ってアメリカなどの多民族国家では黒人の方がアジア人よりもずっと立場は上だよ。
貧弱で弱弱しく、アグレッシブさに欠け、醜いアジア人は黒人のストレス解消のいい的。
黒人は有名スポーツ選手、ミュージシャンを多数輩出してるし、アジア人はかなり彼らに見下されている。
(黒人は白人には頭があがらないため日系料理天などの日本人店員相手に威張り散らしてストレス解消する。
また、日本女はすぐヤラせてくれる肉便器としてとおっている。
「○ドルでどうだ？(俺を買え）」と逆売春を持ちかける黒人男性も多い。）
彼らの見ていないところでこそこそ陰口しか叩けない日本人は滑稽。

175 ：名無しゲノムのクローンさん：03/07/29 22:05

上げ

176 ：名無しゲノムのクローンさん：03/07/29 22:10

アンチ山崎渉板
http://jbbs.shitaraba.com/computer/6686/nurupo.html

177 ：名無しゲノムのクローンさん：03/07/29 22:25

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178 ：名無しゲノムのクローンさん：03/07/29 22:26

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179 ：直リン：03/07/29 22:28

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180 ：名無しゲノムのクローンさん：03/07/30 11:29

同じ遺伝子でも転写開始点がばらついてるのはわかったけど、
全然違うときって何がどうなってるのだろう？？？
転写開始点が、数キロ以上はなれてる時あるよね？
それって、プロモーターの場所も全然違う事にならない？
それでもタンパクの配列が変わらないときは、
二種類のプロモーターによる二種類の転写産物ができるわけで。。。
それって生物学的な意味があるのかなあ？

181 ：名無しゲノムのクローンさん：03/07/30 17:44

こんなに見えちゃってヤバクない？？？
抜いても抜いてもまた勃起しまくり・・・
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182 ：名無しゲノムのクローンさん：03/07/30 19:52

>180
ってことは、一つのタンパクが異なる二つのプロモーターで制御されてるってこと？？？

183 ：_：03/07/30 19:54

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184 ：名無しゲノムのクローンさん：03/07/31 02:11

>>180 >>182
環境応答性なら意味があるといえるんじゃない？
通常はちょっととしかいらないからP1プロモーターで
制御されているけど環境が変わっていっぱい欲しくなったら
環境応答性の転写因子に制御されるP2プロモーターが
アクティブになるとかさ。

185 ：ぼるじょあ ◆yBEncckFOU ：03/08/02 02:58

　　　　∧＿∧　 ∧＿∧
ﾋﾟｭ.ｰ　（　・３・） (　　＾＾）＜これからも僕たちを応援して下さいね（＾＾）。
　　＝〔~∪￣￣￣∪￣￣〕
　　＝ ◎――――――◎ 　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　山崎渉&ぼるじょあ

186 ：180：03/08/02 13:38

>184
それならわかりやすいんですけどね。

でも、ESTクローンのdensityとかからするに、
そういう感じではなさそうなんだよね。。。

187 ：山崎渉：03/08/15 18:32

　　　 (⌒V⌒)
　　　│ ＾＾ │＜これからも僕を応援して下さいね（＾＾）。
　　⊂|　　　　|つ
　　　（＿）（＿）　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　山崎パン