バイオインフォマティクスを教えて下さい 10

そうですね

KEGG/PATHWAYを使えば、代謝ネットワークがスケールフリーである図を作ることができるんでしょうか？
あのデータベースをみても代謝のマップの絵はだせても、どうしても、
ネットワークのcytoscapeでネットワーク図を書けるようなテキストデータを落とすことができません。。そういうもんなんでしょうか？
分野が結構はなれているものでよくわからなくて。申し訳ないです。

ネットワークのcytoscape→ネットワーク可視化ソフトのcytoscape

>>218
KEGG APIを使ってPerlなんかでデータを取ってくるのです。

KEGG API日本語マニュアル
ttp://www.genome.jp/kegg/soap/doc/keggapi_manual_ja.html

なるほど

　「合格通知が来たけど．．．えっ？不合格？．．．これはまた、ずい
ぶんとレベルの高い試験だったのね。試験問題は、国語と数学に
関してはむしろ、期待していたよりはずっと簡単だと思ったけど．．．」

　執事は薄笑いを浮かべながら答える。
「お嬢様もほんとうに騙されましたな。実はあの講座は、ＭＨＫの俳優
としてこの国に滞在している在日外国人たちの資金稼ぎの場として
利用されておりまして、お嬢様のように俳優をやっていない人は、まず
受け容れてもらえないとあらかじめ相場が決まっていたのですよ。」

　「まあ、そうなの？だけど、この国の税金を投入して行っている
講座なのに、真面目にＳＥやプログラマーになる気もないくせに
「名前だけ」受講するというわけなの？それってほとんど詐欺だわね。
信じられないわ。」

　「まあ、テレビ業界で俳優をやっている連中が、全国的に支援金
詐欺をはたらいている、ということですよ。

　実は、お嬢様とご一緒に受験なさったおかたがたは、共通一次
世代の人々の脳のコピーを移植されてそれなりに神妙に振舞って
はいたものの、実は全員、日本語の読み書きすら満足に出来ない、
戸籍も持たないしがない外国人サイボーグ俳優か、もしくは日本語
の読み書きは出来るものの数学の基礎知識すらない古代日本人
サイボーグで、戸籍を持つ日本人になりすまして、俳優業のための
資金稼ぎをしている、というわけです。

223

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225

オープンソースで学ぶバイオインフォマティクスのサポートサイト
http://itoshi.tv/d/images/20080325_1.png
campus gif
http://www19.atpages.jp/imagelinkget/get.php?t=v&u=www.kanazawa-u.ac.jp/j/info/access/100YenBus/campus.gif
040117semi jpg
http://hitech-d.iwate-med.ac.jp/hi-tech/log/040117semi.jpg
1080003 jpg
http://www.my-pharm.ac.jp/~satoj/1080003.jpg
bioinfo cover jpg
http://www.yodosha.co.jp/bioventure/bioinfo/bioinfo_cover.jpg

書き込めるのだろうか

>>226
なんで角間キャンパス……つか、これは現在の地図か。

229

230

231

　こうなったら、名前だけの資格が求められる世界より、純粋に出来
るか出来ないかが問題とされる世界に行ったほうがいいわね。プロ
グラミングも、きちんとＯＳ上で問題なく動作するプログラムが作れるか
否かが問題なわけだし、むしろ数学の問題を解くように、理路整然と
した、正しいか間違っているかの二つの選択肢しか存在しない二元論
的な世界だから好きなのよ。

博士必須

そうだね

235

キーワード【 東急不動産 バイオインフォ 生物 言語 修士 放任 ゲノム 】

キーワード【 裁判 東急 閉館 東急不動産 リバブル 欠陥 計画 】

　「そ！つまるところこれがあたしたちの父親のポリシーなの。まあ
そうね、本松イズムとでも呼んで頂戴！

　だからこそあたしたちにとっては、エリザベスみたいな、この考え方を
真っ向から否定する合理主義者たちが邪魔なのよね。だから、あの手
この手で陥れては潰そう潰そうとしてるってわけ！！」


　その様子を見ていた執事は呆れたようにつぶやく。
「やれやれ、あの本松の娘たちですが．．．相変わらず物凄い考え方
ですな．．．理由はどうあれ、社会にとってはいい迷惑以外の何物でも
ありませんが。

　まあしかし、そんな馬鹿馬鹿しい理由で、エリザベスお嬢様をろくに
勉強もしていない怠惰な女どもと取り替えよう、なんて本気で言い出す
人もいるくらいですから、同じ論理をあてはめるならば、こんな恐ろしい
世の中になる日もそう遠くはないかもしれませんな。」

239

言語を学ぶならJavaとperlでおｋ？

　特に高校時代は辛かったわ。一学年２３０人中女子は３０人しか
いないという特殊な環境で、まるで男みたいに勉強していたの。毎日の
ように先生方が、君たちは市内でも選りすぐりの精鋭たちで、有名大学
に進学して国家のために頑張ってくれるものと皆期待している、是非
精進してくれたまえ、みたいな態度をとるの。少しでも気を抜けば成績が
がた落ちするわ。高校なんて、青春を楽しむべき場所だと思っている人
は少なくないようだけど、私にとっては、「楽しむ」どころじゃなかったわね。

　それと引き換え、大学はちょっと変だったけど．．．思えば不可思議な
出来事ばかり起きたし、どう考えても、実験動物にでもされていたと
しか思えないようなところもあったわ。

242

243

まあ分かってると思うが放任はでたらめ。
普通はテーマはもらえる。
そうじゃないとラボの業績が上がらないからな。

>>240
RubyとPHPとSQLもやっておけ。
データベース作る時に役立つ。
作れるような業績が出せればだが。

そうですね

247

http://www.jsbi.org/index.php?cID=352

>>248の採用だと
PerlとPHPとPostgreSQLの経験が必要みたいですね。

そうですね

251

みんなruby使ってる？

使っています

age

この分野の方達は情報処理関係の資格とか持ってますか？
今の分野に未来がないので転向したいんだけど・・
ちなみに僕は基本情報処理とSJC-Pを持ってます。

今の分野ってどこよ？
この分野で資格持ってるなんて聞いたことない。
派遣でサーバーの保守に来るSEくらいだろう。
しかも社内での資格。

そうですね

>>256
構造解析です

なるほど

>>248
PostgreSQLオンリーってのが意味分からん
SQLなら何でもいいと思うし、
わざわざセキュリティ気にするなら普通オラクルじゃないの？
というかPHPの段階でセキュリティも何も無いけど・・

オープンソースでメジャーだからという理由だけだと思うよ
MySQLはオラクルに買収されたから
他に選択肢がないのでは？
firebird使っている人いるの？

近頃NOSQLという単語をよく目にするのだけど、
バイオインフォにも使えそうですか？

どうでしょう

>>248
噂ではツワモノが揃ってるらしい
興味アリ、情報求む

264

| 262「どうでしょう」
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　　　!/　ノハλ）　′ν/ハ)ヽ｜;;ii|＜ 264「しらねーよカス」
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