SNP解析の将来は?

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私は現在、SNP(一塩基多型)の解析研究にいそしんでいます。
SNPもそろそろネタがつきてきたように思っているのですが、SNP
解析をさらに発展させるような新しい研究手法がありましたら、
ご教示願いたい。
2名無しゲノムのクローンさん:2006/05/01(月) 22:28:52
>1
現在、どの様な手法を使われていますか?
3名無しゲノムのクローンさん:2006/05/01(月) 22:41:42
葉を見て森を見ず状態になってきているのは急ぎすぎたからか
4228:2006/05/01(月) 22:51:57
疾患原因候補遺伝子のSNPをタイピングして、ハプロタイプ解析して、
臨床データとの相関を見ようとしています。ただ、糖尿病などの多因子性
疾患の場合は、あて実験になるような感じがします。
Affymetrixの500K tipなどを使えば、whole genome SNPs解析ができるんですが、
結果の解釈が難航しそうなので、手をつけていません。
5228:2006/05/01(月) 23:06:57
疾患や薬物動態は遺伝因子だけではなく、環境要因も複雑に関わって
くるはずです。ただ、環境要因は不確定要素が多すぎ、アナログ的です。
SNPはデジタルだから解析しやすいが、それだけでは説明できないという
限界に近づいている今日この頃です。
6名無しゲノムのクローンさん:2006/05/01(月) 23:17:14
そりゃそうだ
統計学的な解釈がまだ発展の余地があるらしいけど
7228:2006/05/01(月) 23:31:55
Microsatelliteやcopy number variantsによる羅患率の変化の解析
なんかはポストSNPの候補になりそうですが?
8228:2006/05/02(火) 00:10:37
ちなみにユースケのところの人間ではありません。
9名無しゲノムのクローンさん:2006/05/02(火) 00:14:28
オ○コセラピー?
10名無しゲノムのクローンさん:2006/05/05(金) 18:16:39
>>228
じゃあ、止めた方がよくない?
力仕事だし、ゆーちゃんの1人がちじゃん。
11228:2006/05/07(日) 06:18:13
>>10
そうなんだけど、ユースケもワンパターンでそろそろ打ち止め(年齢的にも)
のような気がするんだよ。だから、このスレでSNP解析の将来性や可能性に
ついて語っていこうではないかと、、、
12名無しゲノムのクローンさん:2006/05/07(日) 10:46:12
うーすけの弟子ってだれがいるの?
13名無しのゲノムのクローンさん:2006/05/30(火) 23:01:53
ユースケのところも終わりだろ
期待してた助教授も出ていっちゃったし、恩顧も株価下がってるし
14名無しゲノムのクローンさん:2006/05/30(火) 23:49:39
怒るとサメみたいな眼になりますよね、あの人。
15名無しゲノムのクローンさん:2006/05/31(水) 00:17:23
ユースケラボは北朝鮮みたいらしい
16名無しゲノムのクローンさん:2006/05/31(水) 00:20:32
喜び組?
17名無しゲノムのクローンさん:2006/05/31(水) 00:55:49
>>13
期待してた助教授って誰?
18名無しのゲノムのクローンさん:2006/05/31(水) 01:04:40
ところで、当代の研究所助教授のパワハラって誰のこと?
19名無しゲノムのクローンさん:2006/05/31(水) 01:32:31
パワハラで東大助教授停職 助手から現金127万円
 東大の研究所に所属する40代の男性助教授が「試薬の購入代金が高すぎる」と部下の助手を責め、助手から現金約127万円を受け取るなど悪質なパワーハラスメントを続けていたとして、東大は30日、助教授を停職2カ月の懲戒処分にした。
 助教授は助手に対し、研究所への出入りを約4カ月間禁じ、給与相当分などとして約380万円の支払いを請求したが、助手は応じなかった。
 東大によると、助教授は2003年、試薬の購入価格が相場より高いとして、購入担当だった助手の職務怠慢を指摘。自分が適正と考える金額との差額を助手に示した。受け取った金は研究室で管理し、私的な流用は確認できなかった。
(共同通信) - 5月30日16時59分更新
20名無しのゲノムのクローンさん:2006/06/01(木) 00:41:02
具体的には?
やっぱりH腰?
21名無しゲノムのクローンさん:2006/06/01(木) 00:54:09
イルミナどうよ?
22名無しゲノムのクローンさん:2006/06/03(土) 00:09:39
>>13>>17もしかしてイッツロー先生のこと?
23名無しゲノムのクローンさん:2006/06/03(土) 00:10:36
ちなみにサンタマはまだ若いぞ?
50台ぎりぎりじゃなかったか?
あと15年は君臨
24名無しゲノムのクローンさん:2006/06/06(火) 22:54:01
ガイアの夜明けにサンタマリア先生が出てた!
25名無しゲノムのクローンさん:2006/06/08(木) 00:54:36
サンタマちょっとつむじの辺りがはげてた
26名無しゲノムのクローンさん:2006/07/02(日) 00:02:57
灯台先端研のLSBMがやっている業績などどうよ?
27名無しゲノムのクローンさん:2006/07/02(日) 00:41:26
>>23
もう半ば近い。

>>25
それくらい許してやれ。

>>26
先端券に居るということがどういう意味か考えてから質問しろ。
28名無しゲノムのクローンさん:2006/07/03(月) 21:35:22
>>26
先端研ならヤッツケ仕事みたいな論文業績でしょ?
少し時間が経てばボロがでるか、新しい方法論に
よって存在が薄れるかのどちらかじゃないの?

長期的にみれば、腰をすえてやっている所の方が
いろんな面で良かったり
2928:2006/07/03(月) 21:41:52
ところで、先端研ってSNP解析なんてやってましたか?w
まあいろんなものに手を出してるんでしょうけど・・・

もしかしてLSBMの所のこと?
30名無しゲノムのクローンさん:2006/11/28(火) 01:05:13
>>29

http://www.lsbm.org/news/2006/1123.html

日本の報道と海外の報道の差を比較すると面白い。
31名無しゲノムのクローンさん:2006/11/28(火) 20:03:14
なんでこんなに差があるの?

これは一種のプロジェクトでしょ・・
結局、この成果を導くために主導的な役割を果たしたところはどこなの?
32名無しゲノムのクローンさん:2006/11/28(火) 20:43:03
こんな優秀な結果を出したのであれば、未来創薬研究所も有名になるじゃん。
33名無しゲノムのクローンさん:2006/11/29(水) 20:50:31
Nature誌に載ったといっている割にいまいち盛り上がらないのはなぜ?
34名無しゲノムのクローンさん:2006/11/30(木) 09:41:51
SNPに明日はない。タコ研のYNこのプロジェクトやめちゃってるジャン
35名無しゲノムのクローンさん:2006/11/30(木) 19:57:28
>>タコ研のYNこのプロジェクトやめちゃってるジャン

なんでやめたの?
面白くないことでもあったのか?
36名無しゲノムのクローンさん:2006/12/01(金) 20:59:07
>>30
これって凄いことなの?
37名無しゲノムのクローンさん:2006/12/02(土) 10:11:04
>>36
やったってだけ。そのうち海外にすてられるんじゃん?
38名無しゲノムのクローンさん:2006/12/02(土) 19:46:18
なんだか哀しいなあ
39名無しゲノムのクローンさん:2006/12/03(日) 16:04:17
YNさんSNPをやっていたこともあったなあ・・
もう止めちゃったの?
本来シークエンスでしょ・・
40名無しゲノムのクローンさん:2006/12/05(火) 22:07:31
>>30

こんなことくらいで喜んでいていいのか?
41名無しゲノムのクローンさん:2006/12/06(水) 07:17:08
>>40

海外のプラットフォームがメインで、日本のチームは便乗しただけ。
42名無しゲノムのクローンさん:2006/12/06(水) 20:29:39
なんであんなに日本のメディアは騒いでいたのかなあ?
ネタがなかったからか、それとも情報を売り込んだのか?
43名無しゲノムのクローンさん:2008/01/06(日) 15:32:34
たしかに微妙な…
44名無しゲノムのクローンさん:2008/01/06(日) 15:34:37
SNPから薬物代謝活性へと移行できりゃ悪くないのに
45名無しゲノムのクローンさん:2008/09/23(火) 20:44:23
クラブハリエの流れをブタ切りでスミマセン。
自分でも>>345でクラブハリエをお勧めしておきながら、他のお店のオフ募集です。

【場所】
キャナリィ・ロウ 四日市店(三重県です)
近鉄湯ノ山線[桜]駅
http://www.canneryrow.co.jp/
http://st.sanshi.co.jp/tokutoku/eetokonet/gourmet8.html#cake
【日時】
10月26日 15:00〜17:00
【料金】
1000円+交通費
幹事は大阪から車で行きます。同乗される方は、交通費として往復で1000円をご負担下さい。
人数が増えれば1000円以下になるかもしれません。

このお店は行った事が無いので、味の保証はできませんが
中部・東海地区のケーキバイキングを食べまくっている方のHPで
凄く評価の高かったお店です。
イタリアンのお店ですので、ケーキではなくドルチェバイキングかな?

予約が出来ませんので、14:00に到着して順番を待つ予定です。

46名無しゲノムのクローンさん
ポジティブな結果もネガティブな結果も色々ありましたが、
メタ解析したら結局ネガティブですた。ファクターが多すぎてよくわかりません。