1 :
名無しゲノムのクローンさん:
イネゲノムに関するあらゆる情報を提供して下さい。
イネゲノムはこれから熱いんじゃないかと思いますが。
皆さん如何でしょう?
2 :
名無しゲノムのクローンさん:02/03/16 18:36
ところでもち米ゲノムってあるんですか?
3 :
名無しゲノムのクローンさん:02/03/16 18:39
>>2 あるよ。
もち米ゲノムなんて名前じゃないけどね(藁。
モチイネゲノム?
5 :
名無しゲノムのクローンさん:02/03/16 21:00
ううん。なんかある種のイネで、その中で2つ種があるんだけど、ねちねちしたのがあるらしい。
名前忘れて調べてないけど、後で調べておきます。
農学板向け?
イネに興味ある人なんているの?
>>1 ほんとに熱いの?
8 :
名無しゲノムのクローンさん:02/03/17 00:24
イネゲノムは何が目的??
9 :
名無しゲノムのクローンさん:02/03/17 09:19
やっぱ日本人は米を喰え!
って事でしょ?
10 :
名無しゲノムのクローンさん:02/03/17 09:21
日本のゲノム関連政策の典型的な失敗例>イネゲノム
11 :
名無しゲノムのクローンさん:02/03/17 10:00
ところでそのデータはどこで手に入るの?
ってか、もう揃ってるの?
12 :
名無しゲノムのクローンさん:02/03/17 10:00
かずさDNA研究所わっしょい
13 :
名無しゲノムのクローンさん:02/03/17 10:08
>>12 かずさにイネゲノムもあるの?
かずさって何か別の事やってんじゃない?
14 :
名無しゲノムのクローンさん:02/03/18 21:45
イネageノム
15 :
名無しゲノムのクローンさん:02/03/18 22:03
>13
イネゲノムもあるのってゆうか、あそこは植物しか誇れるモノがない。
学部2年のときに逝ったが、施設の良さはハンパじゃないぞ〜
田舎の度合いもハンパじゃないぞ〜
木更津わっしょい
16 :
名無しゲノムのクローンさん:02/03/23 22:39
イネaゲノム
17 :
名無しゲノムのクローンさん:02/03/24 01:57
なんなんだ。このくそスレ。
もち米だけマジレスしてやると、
もち米かどうかは、waxy遺伝子座できまる。
waxy遺伝子はアミロース合成酵素。
waxy遺伝子が壊れるとアミロペクチンしかつくれず、もち米になる。
以上。
18 :
名無しゲノムのクローンさん:02/03/24 12:06
19 :
名無しゲノムのクローンさん:02/03/24 13:17
遺伝子組換えであれだけ騒いでるのに
イネゲノム全部分かってどないすんねん。
>>1はネタなのか?
とりあえず TIGR
http://www.tigr.org/tdb/e2k1/osa1/ 日本はどんなプロジェクトでもスタートダッシュがものすごく遅いので、
メジャーなのは狙わない方がいい。
これから熱いのは、クジラゲノム計画。サンプルのクジラ食べ邦題。
しかし、これをやると、グリーンピースからマークされるという、諸刃の剣。
素人はイネゲノムでもやってなさいってこった。
21 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/03 04:25
nannka na-i-?
22 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/03 23:59
今週の金曜日に発行されるScienceに、スイスSyngenta社と中国Beijing
Genomic Insituteが、それぞれジャポニカ型イネとインディカ型イネのゲノ
ム解析論文を発表します。中国の研究者のゲノム情報はホームページで既に
公開されています。Syngenta社のデータは、昨年2月に論文をScienceに発表
した米国Celera Genomics社のヒト・ゲノム・データの公開条件よりもやや
厳しい条件で、研究者には公開されます。商業化を狙う場合は、Syngenta社
と別と契約を結ぶ必要があります。
今週は、わが国のイネ・ゲノム計画が少なくとも、ゲノムの配列情報の競
争では完敗することになります。今年、1月に中国のチームがインディカ型
イネのゲノムのドラフト配列を公開した時に、もう勝負は着いていたという
べきかも知れません。少なくとも現在、調べた限りでは、遺伝子が乗ってい
る部分のゲノム配列情報は、99%以上同じでした。ヒトとチンバンジーより
も、インディカとジャポニカは近いかも知れない。現在のところ61%しか
終わっていないジャポニカを意地になって解読するよりも、投入する予算と
労力を機能解析や有用遺伝子の特許化などに振り向ける戦略的な転換が必要
だと、判断します。
学問ではなく、日本の米を守るための応用研究として、わが国の農水省が
イネ・ゲノム計画を始めたのなら、なおさらです。まず、学問としてジャポ
ニカ型イネ・ゲノムを解読するのなら、文部科学省の予算を振り当てます。
農水省は、全鎖長cDNAを全力で解析、これとDNAの連鎖マーカー、さらに同
省が抱えて離さないイネの多様な育種素材を組み合せて、遺伝子の機能解析
と実際に国民が喜ぶイネの実用品種の開発に乗り出すべきです。
現在のイネ・ゲノム計画には、DNAチップによるトランスクリプトーム、
プロテオーム、そしてシステム生物学など総てのバイオの先端研究の芽が存
在しますが、いずれも国際競争をやるには、盆栽のように規模が小さく、競
争のためのクリティカルマスに到達していません。このままでは、オモチャ
の軍隊で欧米の正規軍で戦おうとする、第二次世界大戦末期の竹槍戦術に酷
似してまいりました。
まず、負けを認め、責任を認め、そして戦略転換を大胆に行う必要があり
ます。だが本当にできるのだろうか?官僚制度は個々の官僚に責任が被らな
い巧妙なシステムです。しかも大臣までが率先して過去のことだからと自分
の責任を棚上げしている農水省という官庁が、そんなことできるのだろうか?
もし、これが不可能だったら、官僚が責任者になって科学研究プログラム
を組むという、従来の国家研究のあり方を根底から変える必要があると、阪
神の快進撃を見るにつけ、ますます確信を深めています。
Biotechnology Japan Webmaster 宮田 満
23 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/04 00:09
関連予算含めて50億近く要求してこれですか…
イネゲノムシミュレータの方はどうなってんの?
なぜゲノム解析で日本が立ち後れるのか、考えてみました。
結論から言えば、予算が効率的に使われていないからです。
ゲノム解析と呼ばれているものは、今のところ、DNA配列の解読です。
DNA配列の解析は、シークエンサーという機械で行ないます。
意外なことですが、シークエンサーが使われずに余っている研究室は、結構あります。
なぜ使われずに余っているのかというと、人手が足りないからです。
ここで、日本のゲノムプロジェクトの問題点が浮き彫りになります。
・なぜ、シークエンサーを買うお金があるのに、人手を集められないのか?
・逆に言えば、人手が足りない研究室に、なぜ、シークエンサーを買う予算が下りるのか?
25 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/04 02:04
日本でイネゲノム解析やってるラボと、そこのPIって誰だ?まじで打ち首ものだろ。
26 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/04 02:11
>>22 ところで日経バイオテク・オンラインって、お金はらってみんな登録してるの?
いや、誰か個人の責任じゃないんだよ。
日本の制度の問題。
たとえば、自分がPIになったとして、新しいプロジェクトを立ち上げることを考えてみろよ。
予算も必要だし、人手も必要だし、得意分野の異なるラボ同士の協力も必要。
今持っている予算をどれ位新プロジェクトに投入できるか?
人手を集めるのにどうしたらいいか?
得意分野の異なるラボで協力してくれるところをどうやってみつけるか?
予算については俺はわからないので語らないが、
人手としてポスドクを集めることも、日本では不自由。
得意分野の異なるラボって言ったって、日本は縦割りだから、交流がない。
28 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/04 04:11
>実際に国民が喜ぶイネの実用品種の開発に乗り出すべき
>>22 遺伝子組み替えが逆風となれば従来型の交配育種で行くしかない。DNAマーカーあたりと組み合わせた交配育種
の大幅効率化が稲ゲノムのアウトプットになるだろうが、この分野はえらく人が少ないと聞く。その基盤整備まで考え
に入っているのか。あるいは、複雑な遺伝学・育種学をゲノムと組み合わせる頭をもったボス爺がいるのか?
てか、コシヒカリも日本晴も充分うまいよ。これが稲研究の最大のネックだ(笑
wa-i nanka atta-!
バカか?おまえら。本物のヴァカか??
制度どうこうの問題じゃねーよ。
予算もらった奴らが単に能無し(インポ)だっただけ。以上。
だから〜
そういう無能な奴(お前みたいな)をどうやって排除するか
ってのも制度の問題だろうが。バカ
32 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/04 12:56
>>26 無料です。
====================================================================
BTJ /HEADLINE/NEWS 2002/04/03 259号
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http://bizmail.nikkeibp.co.jp/btjh.html ●メール送信先の変更や中止は巻末をご覧ください
(中略)
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BTJ/HEADLINE/NEWSの変更、中止の方法
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登録内容の変更や配信停止は
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なお、変更等の際には、登録時にご指定いただいたユーザーIDと
パスワードが必要です。ユーザーIDとパスワードが分からない場合は、
http://bizmail.nikkeibp.co.jp/search_pass/index.htmlでお調べ下さい。
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BTJのホームページ
http://biotech.nikkeibp.co.jp/ でまたお会いしましょう。
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次号のBTJ/HEADLINE/NEWSは2002年04月08日号です
33 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/04 21:04
50億?????
ゲノムプロジェクトって50億もかかるのか?
俺にもちょとでいーからオクれ!
農水はヴァカばっかり。
狂牛病検査のために70億かけて新しい建物を立てるらしいぜ。
いまさら何やってんだよ。
建物よりも偽造ラベル防止を何とかしろってんだよ。
だいたい農学系はセンスない奴が多いからな。
こんな所にも無駄な公的資金が流れてたって訳だ。
35 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/05 00:42
農水でも文科でも経産でもいいけどさ、
〜系とかいって縄張り囲ってヴァカだアフォだと罵り合ってるから
重複投資に無駄金出したり足引っ張り合って
失敗するんじゃないのか?
36 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/05 00:52
金だよ、カネ。世の中、カネが全てだよ。
金じゃねえよ。
個人の才能でもない。
日本の組織がDQNなんだよ。
アメリカに来てみろ。
個人の能力では日本人の方が上だが、組織力で負けてる。
38 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/05 07:38
あれ、今日?
誰かもうScience読んだ?
39 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/05 17:32
http://www.asahi.com/national/update/0405/002.html イネゲノムをほぼ解読 米国と中国の2グループ
米国と中国の2グループが短粒種ジャポニカ米と長粒種
インディカ米のゲノム(遺伝情報の全体)をほぼ解読し
た。近くその情報が公開される。イネゲノムについては日
本を中心とする国際チームも解読を進めてきたが、後から
参加したこの2グループに先を越された。
短粒種では、農業化学会社シンジェンタ(本社・スイ
ス)の米国にある研究所などのグループがゲノムのDNA
塩基配列の93%を解読。長粒種では、中国の北京ゲノム
研究所などのグループが92%を解読した。米科学誌サイ
エンス5日号に論文が掲載される。
両グループとも、ジャポニカ米「日本晴」でゲノムを解
読中の日本などの国際チームが順次公開してきたデータを
利用した。
イネゲノムの解読データをもとに品種改良や遺伝子組み
換えをすれば、味、収穫量、害虫耐性の向上が期待でき、
大きなビジネスチャンスにつながる。小麦やトウモロコシ
などのゲノム解読にも手がかりを与える。
日本は91年から解読を始め、ここ数年は毎年約20億
円の予算を投入してきたが、ヒトゲノム解読と同様、最新
の解読機器と手法を集中投入したグループに追い越され
た。
国際チームのリーダー、独立行政法人・農業生物資源研
究所の佐々木卓治ゲノム研究グループ長は「両グループの
解読データは精度が不十分。品種改良に役立つような遺伝
子の機能解明にはつながらない。われわれは年内に完全な
情報を公開したい」と話している。(06:26)
よ!農水省は農天気省に名称変更した方がいいね
誰も責任をとらずに、
農業生物資源研
究所の佐々木卓治ゲノム研究グループ長は「両グループの
解読データは精度が不十分。品種改良に役立つような遺伝
子の機能解明にはつながらない。われわれは年内に完全な
情報を公開したい」
なんていってるところがすごいね。完璧
42 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/05 21:12
とりあえず、ササタクさんは切腹してね。
43 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/05 21:14
>>41 中国はインディカだし、シンジェンタが公表した解析精度も高くはない。
44 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/05 21:36
その低精度っつーのは本当に「品種改良に役立つような遺伝子の機能解明にはつながらない」ほどのもんなんか?
45 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/05 22:00
恥知らずだな。親の顔が見たいな。
46 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/05 22:02
生物研の図書館はキレイです。かなりカネかけてます。
・・・業績あげろよ。できなきゃ辞めろよ。
47 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/06 00:46
48 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/06 00:48
49 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/06 00:54
中国とアメリカのBio-tech co.に負けてやんの
>>48 最新のScienceを見な。
50 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/06 04:48
fidelityの高さでお茶をにごそうとしてるけど,
いくらfidelityが高くても,ゲノムの半分くらいしか読めてないんじゃ意味ないし.
アフォすぎだね
51 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/06 04:52
大体お役所仕事なんだから期待するのが無駄
学会やらシンポジウムとかでも,他のグループに先を越されてしまったことについては
一切無視.
whole genome shotgun sequencing が速いって分かっても,
ちんたらちんたらコンティグ作って馬鹿丁寧に従来の方法を踏襲.
もっと有効な金の使い方を考えた方がいい.
52 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/06 04:53
53 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/06 07:48
ご丁寧に配列を読んでいたのも負けた原因でしょ。
ヒトゲノム計画のセレラのやり方を見習わなかったのがおバカ
54 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/06 12:32
>>50に同意だな。
精度が高いデータはいいんだが遅すぎ。アピール下手。
世間的にはNが多かろうがミスアセンブルだろうがGapだらけだろうが
一通りそれっぽいデータ出して解読しましたって大声で言った方が勝ち。
ベンターおやじのような嫌らしさが足りなかったな。
55 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/06 20:35
いーや、ジャンクなデータを積み重ねても役にはたたん。特許競争に引きずられてデータを劣化させたなんざ
100年後には物笑いの種だ。
しかし、数年前テレビで「イネゲノム計画は日本が世界のトップを
走っている」っと農水省の研究所の室長か部長が自慢していたど〜
丁寧にシークエンスして、しかも、知的所有権の問題を何も考えて
いなかったものだから、公開した情報が端からアメリカなどの種子会社
によってパテントを取られていた。
全く狂牛病じゅあないが、脳衰症の連中のおつむが狂牛病になっているなあ。
57 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/06 20:52
農水はいまだにcDNAの配列やTOS17タグラインの配列を内部の人間や関係者のみに公開
するという姿勢を崩していない。国内の他の研究者に公開しないから中国に負けるんだ!
58 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/06 20:58
こういうでかいプロジェクトには縁がないんで教えて欲しい。
この負けは金の問題なのか?
中国や企業が金にあかして追い抜いたのか?
補足。
それとも
>>57の言うようにプロジェクトのスタンスの問題なのかと聞きたい。
それとも他の何が原因なのだろう?
60 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/06 21:16
金じゃないよ.
スタンスの問題.
61 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/06 21:19
56は情報を無制限に公開したから負けたと言い、57は情報を公開しなかったから負けたという。いったいどうゆうことなんでしょうか?
62 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/06 21:24
>>57は憶測に過ぎないさ。当初はどうかわからんが、今やtos17は完全公開されてるしESTも普通にGenbank
に登録されている。
63 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/06 21:24
欧米の種子会社によってパテントが取られたのがトラウマになっているのかな。
だとしたら日本企業を抱き込んでそこにパテント取らせておくってのは無しなのか?
監督権限を握った日本企業相手なら適当な制約を付けておく事もできるだろ?
64 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/06 21:27
特許は絡めずに完全公開でいくべきだよ。ヒト・ゲノムでもクリントンとブレアが「特許化は許さん。」と共同声
明をだしてたしな。
65 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/06 21:32
66 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/06 21:36
役に立ちまくりです
67 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/06 21:44
>>66 そなの?
なんかこのスレ、矛盾し合うレスが入り乱れてて混乱する。
結局のところ今回の論文が出た事で日本のプロジェクトの価値は無くなったのか?
減ったのか?
もしそうなら、そうならないようにできなかったのは何故だ?
その責任は誰にあってどう責任を取ってもらえるんだ?
今後ここから出てくる精度の高いデータの持つ価値は今回のデータの価値に比べて
待たせるほどの価値があるものなのか?
68 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/06 21:46
>>62 61です。どうもありがとうございます。公開されているのですね。
ただ、農水のゲノムプロジェクトは情報を身内にとどめて公開しないのはけしからんという批判は他で聞いたことがあります。
情報公開によって後塵を拝してしまったことを考えると。解読終了まで情報は非公開にするべきだったのかもしれませんね。
>>68 ジレンマでしょうねえ。同じ構図はヒトゲノムの場合でもあったわけで。
結局なぜ解読した端から公開していくかというと、わかった分だけでも使いたいという使う側の要望が
あるからでしょう。実際、早く公開した方がそこから成果も出るでしょう。一応その哲学で公開していった
ら、そのデータを利用した企業が全ゲノムを出してきた。大きく構えて、それもプロジェクトから派生した
成果だ、とはやや言いづらいですかね(笑
ミュータントパネル(タグライン)の配布と近傍シーケンスの検索ページ。トップからたどりづらいのは
確かに難点。
http://pc7080.abr.affrc.go.jp/~miyao/pub/tos17/
70 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/06 23:33
もっとこういう問題は,マスコミがきちんと責任追及した方がいい.
研究者が追求しようとしても無理.
たとえば,イネゲノムに文句言おうとしたら,
データを使わせないとかって圧力かけられる.
これは,実際にあった話だが,シンジェンタのデータを使うと,
農水のデータは使わせないと圧力をかけられる.
まさに最悪な集団です
71 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/07 00:22
補足。
モンサント社は順次公開された農水のイネゲノムシークエンスを特許化したわけでは
ありません。「情報交換」をもちかけてゲノムシーケンスを自主的に提供させたのです。
その後、有益そうな遺伝子を片っ端からとってきて特許にしました。
これについても農水の担当者はすでに変わっていて責任はとらないそうです。
72 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/07 00:34
>>よ!農水省は農天気省に名称変更した方がいいね
warata
baka shu-dan
73 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/07 00:40
>>69 61です。なるほど情報の扱いは難しいですね。これから日本がこうしたジレンマに陥る場面というのはかなりあるかもしれませんね。
有益なURLありがとうございます。知りませんでした。
74 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/07 00:44
>>71
「情報交換」によって(直接ゲノムプロジェクトではないにせよ)日本側の研究が進んだのなら、それはそれでいいのでは。
75 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/07 01:13
>イネゲノムに文句言おうとしたら、データを使わせないとかって圧力かけられる. これは,実際にあった話
>だが,シンジェンタのデータを使うと,農水のデータは使わせないと圧力をかけられる(
>>70)
どのみちDDBJにアップされるんだから、だまって使えば良かったでしょうよ。
ちょっと思い出したけど、確かにイネゲノムでは逐次公開はしないという方針もあったような。その
あたりの話?それからモンサントは自前でショットガンをやってそれを無償公開していたのでは?
76 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/07 02:24
77 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/07 14:16
"低精度"って、実は結構問題なんではないか。
俺は素人だがインフォマティクスとSNPに影響大ではないのか。エクソン・イントロン予測とかORF解析しようって時に、
一塩基のエラーで結果はすぐに変わるだろ。精度99.99%のゲノムデータからエラー込みで派生する配列は一万bpあた
り4通り(元を入れて)、これが精度99.9%だと、4の10乗、1048576通りになるのではないか?
あとSNPの解析だが大量解析をどうやっているか知らんが、俺が唯一知っているoligo probeのハイブリさせる方法でも
要は一塩基の違いを見ているわけで、ほかにもミスマッチが生じているとデータに壊滅的な影響があるのではなかろう
か。もちろん事前にチェックもするだろうが、ゲノムデータからの予測だけで事を運ぶとこのような自体を生じかねない。
要は、今のままで行くとえらく予測に使いづらいゲノムデータができてしまうと思われ。全長クローニングとかには使える
だろうけど。それでも設計したprimerが外れて泣きをみる確率は高くなるわけで
78 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/07 23:01
79 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/07 23:03
SNPやろうっていうやつが,公開データ信用してそのまま実験やるとでも思ってるのか?
アホだな.
primerくらい作り直せ.
っていうか,カンコック人がシーケンスした,nだらけのデータでもprimerが
機能しなかったことはない.
80 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/08 13:31
>>79 SNPってヒューマンゲノムじゃ千〜万単位でやってる訳だろ。ゲノムデータを信じずに連中はどうやってやっているんだ?
81 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/08 22:30
ちなみに、よそのデータを使うと、農水から出てる研究費を
あげないようにするなんていういやがらせもある。
82 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/08 22:40
>>80,79
ヒトゲノムの場合
そのつどPCRで増やして確認してからつかってますが、
少なくともドラフトが間違っていてもPCRはかかるもん。
そもそもNCBI等のSNPsデータベースをそのまま信じて
実験している人はいるのですか?
83 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/08 23:16
わからん。つい最近まで、国際プロジェクト以外でイネのゲノムデータと言えばモンサントだけで、そのモンサ
ントは国際プロジェクトと協力体制をとっていたはずなのだが・・・経験談?
>>81
84 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/08 23:19
モンサントじゃなくて、シンジェンタ
85 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/09 00:00
シンジェンタのデータ自体は,一年以上前にでてたんじゃなかった?
で,申請すれば使えます.っていう話がきたんだが,
私の場合,
ボスが,そんなことしたら,農水省の研究費がこなくなるから止めろ.
っていいました.
86 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/09 00:47
>>84 いや、モンサントが60%coverageくらいのワンパスシーケンスを
提供してたはずです。間違っていたら訂正きぼんぬ。
>>85 シンジェンタは当初共同研究ならデータを見せるという方針だったので
申請してしまったら本当に干されてたかもしれませんね。
87 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/09 01:16
シンジェンタってホントにデータ公開してたの?方針発表だけだと思ってた
>>86 ゴメソ
言い方が悪かった.
君が言ってるのはそのとおりなんだが,
シンジェンタが全部よんだってのは,一年以上前から知ってたのね.
で,そのシンジェンタのデータを使うとほされてたかも.っていう意味.
ちなみに,モンサントのデータは,いくらつかっても干渉なし.
>>87 シンジェンタのデータ使ってたひといますよ.
アメリカの大学だけど.
データ持ってかえれっていったんだけど,無理でした
89 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/09 09:13
>>78のリンク読んだ。、大ボス連中もシンジェンタのデータを見たようだね。だが「そういった非常に不正確なデータがたくさんそこには入っ
ているだろうと思われます。 」とかじゃなくて、反論するならもう少し根拠のあることをいうべきだ。
というか自信があるならNatureあたりに堂々と反論を掲載してほしい。
90 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/09 17:59
反論のNatureを現在投稿中です
91 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/09 20:26
92 :
も う だ め ぽ:02/04/09 22:37
>>90 たぶん、その反論をモタモタ書いている間に
SNPとか全部やられちゃうんだよ。
そんで、またその反論(いちゃもん)を書いている間に
今度は別の作物のゲノムをやられちゃうんだよ。
93 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/09 22:54
そうだそうだ、大事なこと忘れてた。
今でこそ、ゲノムチーム=完全公開
企業=条件付き公開
ってかんじになってるけど、
数年前までは、
ゲノムチーム=超厳しく情報規制
だったよね。
それが、企業にやられそうになると、情報公開せよ!
なんて手のひらがえし。
ま、これはヒトゲノムでも似たようなことがおこったけどね。
94 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/09 23:00
えーっと、僕シンジェンタのデータ、全部持ってるんですけど、
勝手に公開しちゃうことにしました。
2chの別サーバーにおいています。
データを入手する方法は、
名前らんに、
fusianasanといれて、
本文に、guest guest RGPと入れて下さい。
これで入ったサーバーに、ricegenome.zip1〜13
っていうデータをおいていますので、
勝手にダウンロードして下さい。
なお、学校や研究所のLAN回線じゃないと、容量上の問題から、
非常につながりにくくなってます。
ダイアルアップじゃ無理なので、学校や研究所からアクセスして下さい。
guest guest RPG
96 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/09 23:04
今更引っかかるやつがいるのか?
99 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/09 23:06
ん?俺今ダウソ中。染色体一本あたり、あっしゅっくしてても10Mbもあるのか。
100 :
ふしあなちゃん:02/04/09 23:06
げすと げすと RGP
101 :
fushitarazu:02/04/09 23:08
guest guest RPG
102 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/09 23:10
>>94 神!
っていうか、君、特許侵害とかで訴えられるよ。
こういうのって祭りが終わった一ヶ月後に引っかかるやつがいたりするんだよな。
104 :
35ppp.ricegenome.affre.go.jp:02/04/09 23:30
quest quest RGP
あれ?
105 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/09 23:33
106 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/09 23:38
>>104 さっさと仕事しろ!(w
(俺もそれやろうとおもった)
おめーら、厨房臭いからやめれ
108 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/10 00:19
110 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/10 01:11
よし!シンジェンタに就職するニダ
>>79で登場した、nだらけのシーケンスしたのって、貴方ですか?
113 :
マリーンズ:02/04/13 16:21
この話題ってもう終わり?
114 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/13 16:27
反論がPlant Cellにのってたな(w
農水はバカの集団。
116 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/14 14:19
117 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/16 20:05
今日の朝刊でも馬鹿にされてたね。
反対派の言い分を記者が鵜呑みにしているだけさ
119 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/16 21:51
戦犯だな。裁け!
120 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/17 00:27
ま、だーれも責任も何にもとらずにポストゲノムプロジェクトに
進んでまた外国企業に大きく水をあけられるのは目に見えてるけどね。
Tosのヒロチカさんのプロジェクトは、オープンで、
規模もスピードもでかいし、
ヒロチカさんがボスになればいいのにね
>>117 読売新聞の記事? 日本はイネゲノムで120億円使ったって出ていましたね。
122 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/17 01:57
123 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/20 01:53
晒しあげ
124 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/20 09:07
120億も何に使ったんだ?
若い女の子をテクニシャンとして雇ってセクハラ。
手はよく動かしてたらしいぜ。
126 :
名無しゲノムのクローンさん:02/04/20 09:53
ああ、俺も手足として働きたい。
できれば手として。
age
age
シンジェンタって自社の農薬をかけないと発芽しない種子をつくったりと、結構あこぎな商売しているんだよね。
131 :
名無しゲノムのクローンさん:02/05/02 02:00
まあでもそれはしょうがないんじゃない?
age
133 :
名無しゲノムのクローンさん:02/05/12 05:06
みなさん、近々、農水協力者による、
恥の上塗り back up 記事か会見が開かれる模様です。
134 :
名無しゲノムのクローンさん:02/05/15 20:54
それでなんだたの?
135 :
名無しゲノムのクローンさん:02/05/15 21:17
まだです。多分。
農水から予算をもらってるひとが、
農水は外国に負けてないって事を記事か会見でしゃべってバックアップするみたい
ですよ。
ま、のれんに腕押しでしょうが
136 :
名無しゲノムのクローンさん:02/05/15 21:24
自分で、新ジェン他や中国のデータ見た?
>>136 もはや、CAPSなどに利用しまくってます
138 :
名無しゲノムのクローンさん:02/05/15 22:08
くおりてぃはどうよ?んー?
139 :
名無しゲノムのクローンさん:02/05/15 22:16
>>138 困ることは、無い!
しかし、中国のいんでぃかが、日本でよくつかわれる
かさらす
ではないので、CAPSなどに使おうとしてもPCRで増えなかったり
多型がでないことはよくある。
っていうか、かさらすがいんでぃかのなかでも特殊なのだが。
はっきりいって、中国のいんでぃかゲノム。
これは、よそうもしてなかったオプションであり、
農水のデータなんかの何十倍の価値がある
140 :
名無しゲノムのクローンさん:02/05/15 22:47
じゃあ脳垂、意味ないじゃん。じゃん。
141 :
名無しゲノムのクローンさん:02/05/15 22:56
142 :
名無しゲノムのクローンさん:02/05/18 02:10
>>139 >CAPSなどに使おうとしてもPCRで増えなかったり
>多型がでないことはよくある。
そういうときってどう対応するの?
143 :
名無しゲノムのクローンさん:02/05/18 05:09
いねゲノムってクローンの登録番号と本当のクローンと結構ちがってるそうですね。
(完全長の)むらかみ研の人が言ってましたが。
いいんですかね?
>>142 はあ?たくさんやって使えるのを探すしかないだろうが。
まあ少なくとも3つに一つは使えてるよ。
今の所。
145 :
名無しゲノムのクローンさん:02/05/18 05:41
いねゲノムって、シークエンスのキット、希釈なしで使ってるってホントですか!?
贅沢っていうか、税金の無駄。
俺に金かえしてくれ!!
146 :
名無しゲノムのクローンさん:02/05/18 08:56
農学系ってバカばっかなんでしょ?
147 :
名無しゲノムのクローンさん:02/05/18 16:20
>>144 使えてない方が多いじゃん。ポストゲノムなアプローチもそんな程度か。
148 :
名無しゲノムのクローンさん:02/05/18 19:08
これってどこのラボでやってるの?
>>147 バカかお前は?
使えないのは精度が悪いんじゃ無くてかさらすが悪いんだよ。
こんごのf2解析にその中国の品種使えばいいだけだろうが。
150 :
名無しゲノムのクローンさん:02/05/18 22:07
>>149 マーカーが出ないのは、カサラスと中国の品種の塩基配列の違いによる、という証拠はあるの?
151 :
名無しゲノムのクローンさん:02/05/19 01:02
>>150 ばかか?
コントロールで中国の品種のDNAでもPCRしてるにきまってるだろうが
152 :
名無しゲノムのクローンさん:02/05/20 20:01
なるほどな。93-11のゲノムデータからカサラスのCAPSマーカー探索を試みたが
思ったより当たりが少ないと。正直目論見が外れて焦ってるだろ。
てかScience読んだか?カバー率8割で、読めた領域の一割に1%台のシーケンス
ミスがあって、contigの両端は比較に使えない。author自身がassembleのミスを
認めていて、エラー率が高いから多型解析の際に注意しろと警告までしている。俺
は誤差の正確な評価にむしろ好感をおぼえたがね。
そもそも”カサラスが悪い”なんぞ信じがたい非科学的な言い方だ。気持ちはわか
らんでもないが、それじゃ他人は納得させられんだろ、普通。”かさらすたんは悪
くないよ”と俺が弁護してやりたいくらいだ。
でもって93-11に乗り換える宣言はいいが、”確定できた”マーカーはちゃんと
crossして座位を確かめるんだろうな?それともstage2の完成まで待つ気か?
かさらすの系統がどういうのかもシラン癖に。
院でぃかのなかでも特殊だと言ってるだろうが。
crossして座位を確かめる?
f2は持ってるから連鎖解析にもう使ってるって言ってるじゃん。
154 :
名無しゲノムのクローンさん:02/05/21 09:50
ほお、事前に93-11でF2作ってたのか。このスレじゃ初耳だがな。で、中国のゲノム
計画に使われている品種を事前に知っていたと。F2まで持ってるなら、少なくとも一
年まえには品種を知っていたことになるな。俺が聞いたのは去年の末だがね。で、F2
まで作ってゲノムの公開を待ってたわけだ。
で、ここは謙虚に聞くが、本当にあのステージ1のミスアッセンブルだらけのデー
タを元にして大丈夫なのか?そのマーカーは中国インディカゲノムのデータに全面
依存して設定されてるわけだろ。連鎖解析に使うもなにもマーカーのlocusが違っ
てたらアウトじゃないかと”バカ”な俺は考えるが?
155 :
名無しゲノムのクローンさん:02/05/21 21:35
あのな。
f2はカサラスとのf2だ。
カサラスとのf2解析で、大体マーカーのlocusがあってるかどうかわかるだろ?
ある目的のlocusについて分離解析してるんだから、
当然近くにマーカー設計するだろ?
だから、組み換えもほとんど起こらないはずでしょ?
だからちゃんとしたマーカーかどうかは分かるの。
156 :
名無しゲノムのクローンさん:02/06/16 15:47
a ge nome
このすれまだあったのか?
158 :
名無しゲノムのクローンさん:02/06/16 21:58
勝負に負けたのにまだカネが投下され続けるのでしょうか?
159 :
名無しゲノムのクローンさん:02/06/17 00:57
どこにいけばこのデータをもらえるんですか?
脳垂は無料後悔ですよね?
160 :
名無しゲノムのクローンさん:02/06/17 08:41
奈良の嶋本せんせなどはたくさんの研究費を獲られてますが、
良い結果はでているのでは?
ほんとにどこでデータ貰えるんですか?
162 :
名無しゲノムのクローンさん:02/06/23 00:41
さて、本年度、イネ遺伝学、分子生物学ワークショップが
きたる7月8、9日に名古屋大学で行われます。
今年もシンジェンタ完全無視の茶番劇が見られることでしょう。
163 :
名無しゲノムのクローンさん:02/06/25 02:32
茶番あげ
はい、明日ですよ。workshop.
佐々木さんの名前がプログラムに無かったが、首になったのか?
165 :
名無しゲノムのクローンさん:02/07/07 17:02
イネゲノム解析
農水省は海外企業に負けた。税金をどぶに捨てたようなもんだな・・・
166 :
名無しゲノムのクローンさん:02/07/12 08:04
結局論文も出ないの?
ゲノム解析って機械でやるだけじゃないんですか?
脳味噌必要なんですか?
それすらできない脳衰は本当に脳みそないんですか?
167 :
名無しゲノムのクローンさん:02/07/12 10:40
日本の予算が非常に使いにくいことを象徴してるんじゃないのかな。
国内でウマクやってるところは、国の直接の機関ではないから
予算の融通が利きやすいんだよ。
168 :
名無しゲノムのクローンさん:02/07/14 13:37
ワークショップはどうだったー?
行ったヤシ、語れ。
169 :
名無しゲノムのクローンさん:02/07/14 16:16
>168
マイクロアレイ共同利用システムがいまいちだとさ。
>>169 ものすごい勢いで突っ込んでたおっさんいたらしいな
171 :
名無しゲノムのクローンさん:02/07/14 22:44
>>171 えーっと、解説してもイイのかしら?
microarray共同利用システムって、ほんとDQNで、
一年以上またされる(wらしいのね。
で、ずっとみんなで文句言ってたらしいんだが、
あるお方が、workshopの前から、公共の場で
気合い入れて批判するって決めてたらしくて、
で、ものすごい勢いで質議したらしいよ。
173 :
名無しゲノムのクローンさん:02/07/15 00:15
勇気あるなあ。
174 :
名無しゲノムのクローンさん:02/07/15 07:06
イネのマイクロアレイってどこがやってるの?
>172
さらに補足。
運用システムがDQNなのはわかってたこと。
おぢさんが激怒したのは、待たされるんやったらアレイを配布しろと。
誠意をみせろと。アレイあったらよそでやるからと。
能吸としてはよそでやられたらたまらんしねえ。
なるほど。
ガクガクプルプル。
>>175 きみ、誰?
恐いよー
関西弁だし、ナラセンあたりのかたでしょうか?
それはそうとして、
もっと各論を増やすべきだね。
RGP関連公園とか、いいかげんイイよ。
毎年毎年同じことばっかし。
gametophyticなmutantと遺伝子単り、かなりイイ仕事なのに盛り上がらなかったね。
in situがいまいちだったからかな?
それにしてもイネのひとはなんでin situ,
あんなにシグナル青くするの?
わかりずらいじゃん。
178 :
名無しゲノムのクローンさん:02/07/16 12:15
そうか、イネは陰湿なのか・・・
179 :
コギャル&中高生:02/07/16 12:21
180 :
名無しゲノムのクローンさん:02/07/20 17:48
あのおぢさんが、やたらとテンション高かったのは、
今度ねえちゃんにのるかららしい。
181 :
名無しゲノムのクローンさん:02/07/20 17:52
>180
詳細キボンヌ。
>>181 たぶんそのうち詳細は耳に入るであろうよ。
うれしくって言いまくるだろうから
183 :
名無しゲノムのクローンさん:02/07/20 22:51
>>182 >
>>181 > たぶんそのうち詳細は耳に入るであろうよ。
> うれしくって言いまくるだろうから
もしかして小さい人?
RGPのPredicted geneって嘘ばっかり?
真贋の見分け方もへったくれもないような。
186 :
名無しゲノムのクローンさん:02/07/23 23:22
そおなの?
187 :
名無しゲノムのクローンさん:02/07/24 01:41
188 :
名無しゲノムのクローンさん:02/07/24 01:44
189 :
名無しゲノムのクローンさん:02/07/25 22:22
>>185 Predicted は predicted.
それもレベルの低い predicted.
190 :
名無しゲノムのクローンさん:02/07/25 22:28
>>187 の左下に島田シンスケがいるっていうのは有名だよね。
191 :
名無しゲノムのクローンさん:02/07/25 22:30
イネ、盛り上がらんかい!
natureにのったくらいで騒いでるようじゃまだまだだめ。
舞い上がってる奴なんて論外。
193 :
名無しゲノムのクローンさん:02/08/08 22:49
194 :
名無しゲノムのクローンさん:02/08/09 03:06
イネ、日本じゃ大事よね。
美味しいお米が食べたいわ〜
植物研究者は頑張って!
私はハエやってます。。鬱
195 :
名無しゲノムのクローンさん:02/08/09 03:53
>>194 食え。
で育種して美味しいハエを作ったらお前は神認定。
196 :
名無しゲノムのクローンさん:02/08/19 09:42
完全長もマイクロアレイもシンジェンタに先越されたってきいたんだけど、ホント?
電車で夢精してるヤシをみました。
夏なので彼はショートパンツでした。
居眠りをしていたら勃起しだし、まわりの乗客からくすくす笑われていました。
そのまま乗客に生暖かい目で見守られていると、
不意にびくっとちんこが動きショートパンツの間から白い液がドゥルっと・・・。
さぁ〜っと乗客は避け、変な空間が出来上がりました。
その後、私は降りてしまったのですが
駅員に誰か通報したのかな・・・。
しばらくは電車に乗りたくないだろうな、彼は。
198 :
名無しゲノムのクローンさん:02/08/19 12:05
199 :
名無しゲノムのクローンさん:02/08/23 12:01
nature にのったって何?
完全長?
200 :
名無しゲノムのクローンさん:02/08/23 12:37
201 :
名無しゲノムのクローンさん:02/09/02 00:23
帯広の育種学会他は誰か行った?
行った人も、もうそろそろ北海道の旅から戻ってきた頃ではないかと。
おもしろいことあった?
202 :
名無しゲノムのクローンさん:02/09/11 11:41
イネゲノムって年内公開されるの?
203 :
名無しゲノムのクローンさん:02/09/12 09:56
204 :
名無しゲノムのクローンさん:02/09/12 15:08
203
のやつって半年位前に聞いたな。
もう論文になったのか?
205 :
名無しゲノムのクローンさん:02/09/12 21:02
イネゲノムに関しては日本は完敗です。
駄目な奴は何をやっても駄目。
206 :
名無しゲノムのクローンさん:02/09/14 19:27
完全長やマイクロアレイのプロジェクトもあったと思うが、
どうなのよ。
外国企業の発表を真に受けたらあきませんよ。話し3割ぐらいで聞いとかなきゃ。グローバル化てのは、金のためなら何でもする仁義なきだましあい。特に死ン治炎太はえげつないよ。生物学も、今やサイエンスでなく、ビジネスですよ。
208 :
名無しゲノムのクローンさん:02/10/18 01:58
で、どうなのさ?
209 :
名無しゲノムのクローンさん:02/11/22 15:12
Nature 2002年11月21日号
========================
------------------------
イネゲノム - Webフォーカス
------------------------
イネは私たちの主食料であるコメを実らせる植物です。この植物の遺伝情報をす
べて理解し、さらに良質なコメを生産するためには完全なイネゲノム全塩基配列
が必要です。そのため、日本を中心とした国際コンソーシアムが1997年に組織さ
れ、その完全解読に取り組んでいます。今回日本が担当する第1番染色体と中国
が担当する第4染色体の完全解読情報がネイチャー誌11月21日号に掲載されまし
た。ネイチャー・ジャパンでは、日本チームが担当した第1番染色体の論文を
ウェッブ上で無料公開いたします。また、関連ニュースを日本語で公開中です。
▽▽▽PDFを公開中!▽▽▽
The genome sequence and structure of rice chromosome 1
<
http://www.naturejpn.com/redirect/toc.php?id=78>
210 :
名無しゲノムのクローンさん:02/11/22 15:31
http://www.natureasia.com/campaign/rice/ 精度の高まったイネゲノム
Fresh analyses put rice genomics on the map
イネ染色体2本の精度の高い配列が今週発表されたことで、「完成」ゲノム配列
の有用性の評価を試みる研究者たちに、腰を据えて考える新たな証拠がも たらされた。
Nature 11月21日号に掲載された2つの論文では、イネの第1染色体と第4 染色体
の完全な配列について詳しく述べられている。これでイネDNAの各位置 に存在する
正確な塩基配列が手に入ったことになる。配列にはギャップもほとんどない。論文の
著者らは、完成ゲノム配列が学術分野の研究者にいかに重要であるかということが
わかったと述べている。
日本のイネゲノム解読プログラムの佐々木卓治が率いる研究チームは、第1 染色体の
配列を決定して解析を行い、この染色体に非常に多くの遺伝子が含 まれていることを
明らかにした。同研究チームの試算によれば、第1染色体に は6756個の推定遺伝子が
含まれる。ちなみに今年の初めに報告されたイネゲノムの同じ部分の概要版では、それ
よりずっと少ない4467個の遺伝子が第1染 色体上に含まれると推定されていた。中国科学
院上海生理研究所のBin Hanたちのグループは、第4染色体の全塩基配列を決定し、遺伝子
の52%が概要配列から予想されるものではなかったと報告している。
しかし最も重要な点は、研究者たちによれば、イネ染色体上にある大きさや稔性などの
形質を示す物理地図と今回明らかにされた完全配列を結びつけられることであるという。
この点は、遺伝情報を元に農業上の利益を求めてイネを始めとする穀物類を改変すること
を考えている研究者にとって朗報である。「地図に基づく配列が農業分野で手に入った
ことは本当に極めて重要だ」と、公的資金で運営されている国際イネゲノム解読プロジェ
クト(IRGRP)のアドバイザーを務めるブルックヘブン国立研究所(ニューヨーク州)の
Ben Burrは語っている。
211 :
名無しゲノムのクローンさん:02/11/22 15:31
佐々木らの研究グループは、イネの全ゲノム配列決定の第2期を1か月以内 に終えること
を計画している。その後、イネゲノムの個々のピースは平均10 回の配列決定が行われ、
物理的位置が割り当てられることになる。
イネゲノムプロジェクトにおいても、ヒトゲノムプロジェクトのときと同 じように、
公的データの公開をめぐるあつれきが随所にみられている。2つの 私企業モンサント社と
シンジェンタ社は、既にジャポニカ種のイネの概要配列を明らかにしている。シンジェンタ
社は同社の配列データの全てを公開しているわけではないが、データを公的プロジェクトと
共有しているという。
シンジェンタ社のトーリーメサ研究所(米)のゲノム技術グループを率いるStephan Goff
は、同社の概要配列は自分たちの研究を進める上では問題がないと語っている。「我々の関心
は新しい遺伝子を発見することにあり、他のゲノム技術に適用できる範囲が手に入ればよいので、
当社の概要配列はこの目的に照らして十分であり、完成配列を明らかにする必要性は当初から
感じていませんでした。」
しかしそのために、行うべき作業が学術分野の多くの研究者たちに多く残されることになる、
と公的プロジェクトの研究者たちは考えている。「多くの研究者が配列を仕上げる作業に取り
組まなければならない。このような仕事は処理装置を大規模に備えた企業では容易かもしれない
が、大学の研究者たちには難しいだろう」と、ゲノム研究所(TIGR)(米)のRobin Buellは
語っている。
この事実は、コムギ、トウモロコシ、オオムギなどゲノムサイズの大きな 他の穀物類を対象
とした研究を円滑に進めるための基準として使用を考えている研究者が多くいるイネでは重要な
点である。ただしこのことは、配列決定が試みられるすべてのゲノムについてあてはまるわけ
ではないと研究者たちは考えている。
「概要配列から十分な解答を引き出すことができる疑問もあればそうでない疑問もある。現時点
では、そのようなトレードオフ関係の内容ははっきりしていない」と、米国立ヒトゲノム研究所の
科学部門の責任者Eric Greenは 語っている。「まさにそういうことを今後知る必要があるのだ」。
212 :
名無しゲノムのクローンさん:02/11/27 23:06
イネでRNAiしてまつ
213 :
名無しゲノムのクローンさん:02/11/27 23:12
でも所詮knock outには勝てないだろ。
anti senseと大差ないじゃん
214 :
名無しゲノムのクローンさん:02/12/15 03:05
215 :
名無しゲノムのクローンさん:02/12/16 16:35
http://www.s.affrc.go.jp/docs/press/2002/1210.htm イネゲノム塩基配列解読記念式典を開催−日本から世界に向けて解読を宣言−
・(参考) 〔イネゲノム解読の経過〕
(参考) 〔イネゲノム解読の経過〕
・日本、米国、中国、台湾、フランス、インド、韓国、ブラジル、タイ、イギリスにより
結成された国際コンソーシアム(国際イネゲノム塩基配列解析プロジェクト、IRGSP)で
解読を進めてきました。
・IRGSPでは、解読対象をイネ品種「日本晴」に統一し、遺伝地図に基づいた階層式ショ
ットガン方式により99.99%の高精度の解析を目指して、解読作業を進め、その成果は迅
速に公開してきました。
・この間、民間2社からIRGSPに対して、クローンおよび概略配列情報が提供されました。
・我が国では、農業生物資源研究所と農林水産先端技術研究所が共同で国際コンソーシア
ムの活動に参画し、全体の60%近くを解読することにより、世界の基礎科学研究へ大きく
貢献しました。
〔成果の意義〕
・イネゲノム全塩基配列解読は、主要穀物における最初の全遺伝情報解読例であり、この
情報を利用して今後予想される人口増加や栽培環境悪化に対応した食料の安定供給に貢献
することが期待されます。
・イネは、植物科学の研究対象として日本をはじめとしたアジア地域で多くの研究者が取
り組んでおり、今後ゲノム全塩基配列解読情報を利用してイネを中心とした植物生命科学
の急速な進展が期待できます。
・イネは、コムギやトウモロコシと祖先が同じであり、イネゲノム塩基配列解読の成果は
穀類全体の研究に利用されることが期待され、地球上すべての人々にとって共有できる科学上の財産となります。
http://www.s.affrc.go.jp/docs/press/2002/1210/sankou.htm ・イネゲノム研究について [PDF]
http://www.s.affrc.go.jp/docs/press/2002/1210/1.pdf
他スレから来ました
断ってきたのでマルポではないです
----------------
植物育種分野のQTL (量的形質連鎖解析?) の意味について教えてください
以下の解釈であってるでしょうか?
ある量的形質を持っている個体や系統のDNAマーカーを調べまくる
そしてそのF1、F2、F3やBC1,BC2等でもそのマーカーの分離比を調べる
次にそれらのマーカーと座上染色体が分かっているDNAマーカーとの組換え比を調べる
→
この量的形質に関与している遺伝子のDNAマーカーは第2染色体のこの位置,
第3染色体のココとそこ、というふうに調べていく
これで○でしょうか?
217 :
名無しゲノムのクローンさん:02/12/16 23:35
ずばり△です
218 :
名無しゲノムのクローンさん:02/12/16 23:38
っつうかほとんど×です
すいません
答えを教えてください
220 :
名無しゲノムのクローンさん:02/12/16 23:52
まず、分離世代を解析に用います。
したがってF1とかじゃ無意味です。
一番重要なのは、表現型の評価も必要と言う点です。
あなたの解釈にはこれが抜け落ちてます。
そしてDNAマーカーの意味もあまりしっかり理解できてません。
たとえば、あるジャポニカとインディカを交配して、分離世代で知りたいQTL(たとえば味のうまさ)に関する
表現型を評価します。
で、全染色体上のDNAマーカーを用いてgenotypingします。
で、ある染色体上のある部分が日本型なら味がうまい。
とか、まずいとかを統計的に解析して、
味のうまさに関して重要な染色体領域を解析するのがQTLです。
ポイントとしては、由来や世代の異なる分離集団をかいせきにもちいることでしょうか
それから、戻し交配は、精密に遺伝子座をmappingするときにつかいます。
あ、由来や世代の異なる分離集団ってのは必ずしも必要じゃないです。
精度あげたり拾い落しを防ぐためのオプションです。
ありがとうございます
223 :
名無しゲノムのクローンさん:02/12/28 22:12
予算大幅カットって話を聞いたんだがどうなの?
もめてるってうわさだけどさ。
224 :
名無しゲノムのクローンさん:02/12/29 03:23
ゲノム読みおわったしいいんじゃないかしら?
225 :
名無しゲノムのクローンさん:02/12/29 03:34
結局、YACライブラリーの整列化なんかしないでショットガンでガンガン読めばよかったのではなかろうか?
そのとうりですけどね。
あ、それと、なんか最近tosやらmicroarrayなんやらの予算削られ捲りみたいな事を良く聞くけど、イネ関連もう見捨てられてきたか?
227 :
名無しゲノムのクローンさん:02/12/29 20:49
なんでマイクロアレイまで。。。。。。
まさにポストゲノム研究でしょ。
228 :
名無しゲノムのクローンさん:02/12/31 02:50
米を見捨てたのか?>日本
229 :
名無しゲノムのクローンさん:02/12/31 05:04
ゲノムチームの失態ぶりにようやく気が付いたんだろ
230 :
名無しゲノムのクローンさん:02/12/31 05:19
231 :
名無しゲノムのクローンさん:02/12/31 23:47
232 :
名無しゲノムのクローンさん:03/01/01 03:52
研究費で別荘を買った
233 :
名無しゲノムのクローンさん:03/01/02 00:08
研究費で女を買った
234 :
名無しゲノムのクローンさん:03/01/02 11:28
研究費でゲームボーイアドバンスを買った
235 :
名無しゲノムのクローンさん:03/01/03 14:49
研究費でぷっちんぷりんを買った
236 :
名無しゲノムのクローンさん:03/01/04 02:07
研究費で親戚にお年玉を配った
237 :
名無しゲノムのクローンさん:03/01/04 08:33
もうちょっと内部情報を教えて。
この3月で首切りが始まるんじゃないですか?
皆さん大丈夫なんでしょうか?
まあプロテオームだってまだ先行きの見える仕事じゃないし、
このさいちゃんとバイオロジーやったほうがいいよ。
人減らしても。
Y野さんとこくらいじゃん。
ちゃんとやってんの。
バイオロジーのできる人間たくさん雇いましょう。
ポストも増えるし。
239 :
名無しゲノムのクローンさん:03/01/04 13:41
研究費でこしひかりを買った
240 :
名無しゲノムのクローンさん:03/01/05 02:46
研究費でささにしきは買えなかった
241 :
名無しゲノムのクローンさん:03/01/06 00:11
研究費でMEGUMIの写真集を買った
(^^)
(^^)
245 :
名無しゲノムのクローンさん:03/03/07 05:37
お百姓さんのかけた八十八の手間はイネゲノムに反映されますか?
246 :
名無しゲノムのクローンさん:03/03/07 05:40
(^^)
248 :
名無しゲノムのクローンさん:03/04/01 22:53
明日育種学会が開かれますが、
育種学会賞を受賞するある先生は、
あからさまな研究妨害や嫌がらせをしています。
いまでさえだれも文句言えないわがままな人なのに、
この先どこまで唯我独尊になるのか心配です。
249 :
名無しゲノムのクローンさん :03/04/02 19:37
『蛋白質 核酸 酵素』に佐々木さんと肥後さんの書いた記事が載っているよ。
250 :
名無しゲノムのクローンさん:03/04/06 16:45
(^^)
━―━―━―━―━―━―━―━―━[JR山崎駅(^^)]━―━―━―━―━―━―━―━―━―
∧_∧
ピュ.ー ( ^^ ) <これからも僕を応援して下さいね(^^)。
=〔~∪ ̄ ̄〕
= ◎――◎ 山崎渉
254 :
名無しゲノムのクローンさん:03/07/12 07:53
保全
__∧_∧_
|( ^^ )| <寝るぽ(^^)
|\⌒⌒⌒\
\ |⌒⌒⌒~| 山崎渉
~ ̄ ̄ ̄ ̄
__∧_∧_
|( ^^ )| <寝るぽ(^^)
|\⌒⌒⌒\
\ |⌒⌒⌒~| 山崎渉
~ ̄ ̄ ̄ ̄
ハッキリ言ってアメリカなどの多民族国家では黒人の方がアジア人よりもずっと立場は上だよ。
貧弱で弱弱しく、アグレッシブさに欠け、醜いアジア人は黒人のストレス解消のいい的。
黒人は有名スポーツ選手、ミュージシャンを多数輩出してるし、アジア人はかなり彼らに見下されている。
(黒人は白人には頭があがらないため日系料理天などの日本人店員相手に威張り散らしてストレス解消する。
また、日本女はすぐヤラせてくれる肉便器としてとおっている。
「○ドルでどうだ?(俺を買え)」と逆売春を持ちかける黒人男性も多い。)
彼らの見ていないところでこそこそ陰口しか叩けない日本人は滑稽。
(⌒V⌒)
│ ^ ^ │<これからも僕を応援して下さいね(^^)。
⊂| |つ
(_)(_) 山崎パン
259 :
名無しゲノムのクローンさん:03/12/01 16:19
あぼーん
261 :
名無しゲノムのクローンさん:04/04/19 00:40
植物細胞の4月号にゲノムチームの論文が出ているが、
これと二ヶ月前の天然遺伝に出ていた米国発の論文は
内容がかなり似ていないか。
262 :
名無しゲノムのクローンさん:04/04/19 00:47
植物細胞4月のゲノムチームの論文は2カ月前の
天然遺伝のアメリカグループの論文と被っていないか。
263 :
名無しゲノムのクローンさん:04/08/29 23:51
age
264 :
名無しゲノムのクローンさん:04/09/01 00:13
俺もage
265 :
名無しゲノムのクローンさん:04/09/02 00:28
じゃぁ俺も
266 :
名無しゲノムのクローンさん:04/09/02 04:55
二番煎じ。くそ研究。
267 :
名無しゲノムのクローンさん:04/11/06 22:19:37
皇太子さまイネ研究会議に 東京シンポであいさつ
皇太子さまは4日、東京都千代田区のホテルで開かれた「世界イネ研究会議」の東京シンポジウムに出席、
「多様な視点からの活発な議論を通じて、世界の食料問題の解決と地球環境の保全に大きく貢献することを期待して、
私のあいさつといたします」と話された。
今年は国連が定めた「国際コメ年2004」で、発展途上国における飢餓や貧困の解消にはコメの生産が
重要という認識を深めるため、各国が連携して活動。日本では7日までイネゲノム(全遺伝情報)の研究や
食文化などについて、講演や討論会が行われる。
http://headlines.yahoo.co.jp/hl?a=20041104-00000097-kyodo-soci
268 :
名無しゲノムのクローンさん:04/11/15 08:06:30
24 名前:名無しさん@お腹いっぱい。 投稿日:03/11/03 15:44
>>23 > その他に、研究者として田部井豊氏(独立行政法人農業生物資源研究所)、
この人、研究者じゃないよ。
25 名前:名無しさん@お腹いっぱい。 投稿日:03/11/03 19:29
遺伝子組み替え大豆はアメリカでは家畜用に生産している。
アメリカ人の食卓には乗らない。
26 名前:名無しさん@お腹いっぱい。 投稿日:03/11/12 01:04
>>24 T氏のおことば
「非組み替え作物と同じというデータが取れるまで何度でも繰り返せ!
1回同じというデータが出たら、それを正式書類に使え。
なに?科学的じゃないって?
生意気なことを言うな!! それが仕事だろう。
だから院卒は使えないんだ。」
269 :
名無しゲノムのクローンさん:04/11/19 01:03:57
270 :
名無しゲノムのクローンさん:05/02/03 00:57:51
国家予算を無駄に使っている研究者が集まっているのはここですか?
>>270 >集まっているのはここですか
2chじゃなく
つくば市おおわし( <=うまく変換できない )に・・・
272 :
くじー:05/03/05 19:14:25
イネゲノムは全部機能解析がもうなされていて
全部アメリカとヨーロッパに特許とられてるよ
日本はタンパク質の特許くらいだよ
さみしいねえ
273 :
名無しゲノムのクローンさん:05/03/05 20:23:37
ひたすらコンティングを繋げて整列化ライブラリーの作成するのに
9割がたの労力と金を浪費したんですか?
274 :
270:皇紀2665/04/02(土) 00:02:55
>>273 まあそういうな。
あのプロジェクトのおかげで
イネ研究者の雇用が維持されたのだから。
2005年度で資金の切れ目なんじゃない。
カッカッカ
ゲノムプロジェクトのトップがもっと賢い香具師だったら、
初期からショットガソやってただろうに。
まー、もっとも、そんなことやっていたら、
ものすごい雇用は生まれなかったんで、
良かったといえば良かったといえる。
イネの時代は終了。
イネに固執する研究者はそろそろ消えろ!!
275 :
名無しゲノムのクローンさん:2005/04/22(金) 23:23:32
>なぜイネを牛のエサにするのか
> 日本では平成12年に口蹄疫が、13年には日本初のBSE(牛海綿状脳症)が発生して、
>社会的に大きな問題になりました。
>これらは、海外から輸入した飼料に原因があると言われていて、
>多くの飼料を海外に頼っている日本の畜産を大きく揺るがしました。
>そのため、日本の飼料の増産や拡大、飼料自給率の向上が重要な課題になっています。
> 一方で、日本のお米の消費量は年々減少し、お米は生産過剰傾向にあります。
>そのため水田では転作が求められています。
>その中で飼料イネは転作作物として最も導入が簡単な作物として注目されています。。
>
>■飼料イネの利点
>栽培技術の基礎があり、普及が簡単
>トウモロコシのように毎年種子を海外から輸入する必要がない
>トウモロコシのような干ばつや湿害がない
>利用されていない転換した湿田の利用で、輸入粗飼料の代替が可能。など
とうちゃんがあいつらほじょきんめあてでつくってんだっていってたよ
キタナイネ、のうみんって
276 :
名無しゲノムのクローンさん:2005/05/16(月) 22:34:06
イネ研究者を糾弾するスレはココデスか?
277 :
名無しゲノムのクローンさん: