月姫その８

ちょっとあまりに長くなったので聞きますが(外出だったらゴメン)
月姫最後のシナリオで、あの髪が赤い、青い名前の人が「協会側の人間だから教会とは仲が悪い」
と言ってましたがどういう事なんでしょう?
誰か教えてください