オンキヨー　ONKYO WAVIO Part2

SE-200PCI LTDを使ってるんですが
マルチ入出力ケーブルの緑のフロントアウトから赤白のアナログラインインに繋いで
windowsvista上から録音ソフトでデスクトップに流れる音をステレオ録音
してるんですが時々モノラルで録音されてたりするのは
何が原因なんでしょうか？音編集ソフトで左側からしか音が出ません
PCを再起動すると直ったりします