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Wikipediaから

外資系企業（がいしけいきぎょう）とは、外国法人又は外国人が一定程度以上の出資をする日本の企業（通常は株式会社）をいう。
口頭表現等では「外資系」と略称することも多い。外資系でない日本の企業は、日系、国内系、民族系、
などと言われる。日本以外の国に関しても同様の意義で用いられることがある。

上述の定義から、外国会社の日本支店は外資系企業ではない（単に外国企業である。）。

経済産業省（旧通商産業省）は、1967年以降毎年、外資系企業について調査を行っており、その調査結果を、翌年以降毎年『外資系企業の動向』として公刊している。ここでは、近年は、概ね、

外国投資家が株式又は持分の3分の1超を所有している企業と
外国投資家が株式又は持分の3分の1超を所有している持株会社が出資する企業であって、
外国投資家の直接出資比率及び間接出資比率の合計が3分の1超となる企業
がその調査対象とされている。