★国語学　vs. 日本語学★

＞国語学の分野から系統論に踏み込むと方々から叩かれるという大野晋氏の例もあるから
＞やりにくいという面はあるかも。

日本語の系統論がやりにくいのは宿命のようなもの。
いかに眉唾が多いか、まともな研究者なら充分ご存知のはず。
でもまじめなものもあることをお忘れなく。
それが言語学に分類されようとかまわないが、国語学ではないという決まりもありません。