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PS2メモカ⇔PCSX2メモカの方法については自己解決しました。
ps3mca-toolだと「フォルダ作成・削除」と
「ファイル書き込み・読み出し・削除」ができるので、
@一旦素の形式(フォルダ内のicon.sysなどのファイル群)で
メモリーカードから読みだして保存する
AそれをPS2 SaveBuilderで.max形式に固め、
Bそれをmymcで*.ps2(PCSX2のメモカ形式)に書き込む
ことで、PS2メモカ→PCSX2メモカへのコピーができました。
また逆方向には、
@mymcで*.ps2から*.psu形式でセーブデータを抽出
AそれをPS2 SaveBuilderで「Extract」して素の形式で保存
Bそれをps3mca-toolで書き込む(フォルダ作成→ファイル書き込みの順)
ことで、PCSX2メモカ→PS2メモカへのコピーができました。
結局丸ごとイメージから変換する方法は見つかっていないわけですがorz
「--mc-imageでファイルパスを空ファイル指定→新規イメージ作成、
--mc-imageでファイルパスを既存ファイル指定→そのファイルでメモカ上書き」なんですかね?