●ミサイルタンク(全50個) その1
チョウゾルーインズ: ハイブトーテム(ハイブトーテムを倒す)
チョウゾルーインズ: ルーインズスクエア(ミサイルで壁を壊す)
チョウゾルーインズ: ウォータリーホール通路(ミサイルで壁を壊す)
チョウゾルーインズ: セキュリティドーム(ボムで壁を壊す)
チョウゾルーインズ: ルーインズパビリオン(ボムでロックを解除する)
ターロンオーバーワールド: ターロンケイブ通路B(橋の下)
ターロンオーバーワールド: ランディングサイト(スターシップ後ろのトンネル)
ラヴァケイブス: マグマガーデン(ボムジャンプで進んだ先)
アイスバレイ: エーテルラボ(中二階の細い通路をモーフで進む)
アイスバレイ: ハイドララボ(2階のカプセルをスーパーミサイルで壊す)
チョウゾルーインズ: メインプラザ(ハーフパイプの上)
チョウゾルーインズ: メインプラザ(大木の弱い所をスーパーミサイルで壊す)
チョウゾルーインズ: 噴水の泉(ボールトラックで進んだ先)
チョウゾルーインズ: セントラルゲート(最上部のドアの上の壁をボムで壊す)
チョウゾルーインズ: 大アトリウム(スイッチを作動させてボールトラックで進んだ先)
ターロンオーバーワールド: 墜落エリア通路B(部屋の真ん中にある)
ターロンオーバーワールド: オルフェオン墜落エリア(水の中にある)
ターロンオーバーワールド: 研究データ保管エリア (水の中のドアを破壊する)
フェイゾンマインズ: フェイゾン採掘ステーション(クレーンを動かす)
フェイゾンマインズ: パイレーツ研究エリア1(パルスビームで壁を破壊する)
フェイゾンマインズ: 研究エリア連絡通路(火薬コンテナを破壊する)
ターロンオーバーワールド: バースロード(ハーフパイプの上に乗って床を壊す)
ターロンオーバーワールド: ツリートップ(見えない床を使って部屋に入る)
チョウゾルーインズ: 溶鉱炉(床をパワーボムで壊してボールトラックで進む)
チョウゾルーインズ: ジェネレーター(ミサイルで壁を壊す)
●ミサイルタンク(全50個) その2
チョウゾルーインズ: ジェネレーター(ボールトラックで登った先)
チョウゾルーインズ: ウォータリーホール(水の中を進んだ先)
チョウゾルーインズ: ツインホール通路(木の陰にあるトンネルの先)
チョウゾルーインズ: メインプラザ(グラップリングビームを使って取る)
チョウゾルーインズ: 祭壇跡地(ボムで壁を壊す)
チョウゾルーインズ: 祭壇跡地(ハーフパイプを登る)
チョウゾルーインズ: ルーインズヤード(ボムジャンプで壁の通路を進む)
チョウゾルーインズ: ルーインズスクエア(ボムジャンプでトンネルに入る))
ラヴァケイブス: 地熱集積エリア(見えない床を渡った先にある柱をミサイルで壊す)
ラヴァケイブス: ラヴァ保管庫(地熱集積エリアの最下層からモーフで進む)
アイスバレイ: フロストケイブ(グラップリングビームで対岸に渡り鍾乳石を落とす)
アイスバレイ: フェンドラナ地底湖(プラズマビームで氷を溶かす)
アイスバレイ: アイスドーム管理室(部屋の真ん中にある)
アイスバレイ: アイスヤード(ボールトラックで進んだ先)
アイスバレイ: アイスヤード(プラズマビームで氷を溶かす)
アイスバレイ: アイスプラザ(セーブステーション近くの柱の氷を溶かす)
アイスバレイ: アイスプラザ(ボールトラックで進んだ先)
ターロンオーバーワールド: ターロンケイブ(見えない床の先のツタがある壁の中)
ターロンオーバーワールド: ウッディチェンバー(部屋の真ん中にある)
フェイゾンマインズ: セキュリティゾーンA(金網をパワーボムで破壊する)
フェイゾンマインズ: メトロイド隔離エリア(ボールトラック根元の壁を壊して進む)
フェイゾンマインズ: メトロイドファーム2(小さいキノコに囲まれた床を壊す)
フェイゾンマインズ: メトロイドファーム管理室(カプセルをスーパーミサイルで壊す)
フェイゾンマインズ: ファームエントランス(一番下のキノコの下)
フェイゾンマインズ: フェイゾン集積センター(壁をパワーボムで壊す)