Mission UD:白血病等のがん患者を救え!207Ligands
投稿日:2005年10月3日(月)午後7時53分(標準時)
件名:前のロゼッタのジョブが終わった − 10月2日以前のどこかで
Sekerobさん、いい質問です。「みんなは何で、ジョブが終わる時を予測して、
ジョブを切り換えて、次のジョブを続けるわけにはいかないの?」
わたしたちは、あるジョブが終わったらすぐに、それをまったく使用できない
ようにできたし、実際にそれがわたしたちが初めに従った手順です。そうする
ことの問題は、あるジョブが使用できなくなったらすぐに、宿題を採点して
もらえなくなってしまうことです。わたしたちはみなさんの意見を取り入れて、
すべての宿題に対する最低限必要なリザルトを得た後でも、1週間はジョブ
(それは公式の用語です)を使用可能にし続けておくことを決めました。
これは、すでに提出された宿題を解くために「CPUを無駄にする」ように
思わせるかもしれませんが、実際には、宿題あたりに返されるリザルトが
多いほど、リザルトが本当に正しいことを信用できます。
私は、ジョブをロードしつつ使用不能にする現在の手順が、誰にとっても
正当な妥協案だと思います。
--
Robby Brewer
投稿日:2005年10月3日(月)午後7時53分(標準時)
件名:前のロゼッタのジョブが終わった − 10月2日以前のどこかで
未回答の多少の質問にできる限り答えさせてください。
「最後の方でHPFの宿題を提出する人たちに、その最後のジョブを
オフラインにすることについて、誰か何か言ったか?」
− 必要なディスク容量のせいで、現在使用可能なジョブをあまりたくさん
持てません。がんのジョブが実行されていて、そして普通は大きいので
3つの別々のジョブに分けられているロゼッタのジョブがあります。
いったんそのジョブが終わると、他のロゼッタのジョブをアップロード
するために、そのすべてのリザルトをどけます。終わったジョブに対して
ポツポツと集まる、多少の未提出の宿題はそんなに容量を食いませんが、
2つ(実際には6つ)の現在使用可能なロゼッタのジョブ用の、十分な
容量はありません。新しいシステムではたくさんの容量があり、将来的には
これは問題にならないはずです。
「wcgたんぱく質の宿題の重複提出数は3個だと以前述べられているが、
udは5個にしている。私にはwcgたんぱく質は、間違っているか、もしくは
udは冗長性を持たせ過ぎのように思える。」
− わたしたちは現在同じように、実際に3個のリザルトで実行しています。
「新しいがんのデータが無いから、udはhpfのプロジェクトを引き伸ばそうと
しているのでないかと、私にはちょっと思える。」
− 違います。ロゼッタのジョブはとても速く回されていて、毎週のように
新しいものをアップロードしています。
「ジョブが完了したとき、解答中のまま残されている宿題をみんな中止し、
計算時間を採点する選択肢があるべきだ。」
− それは良いことだと同意します。しかし今のシステムはそのようには
動きません。後のリリースへの改善要求として、これを検討中にしておきます。
「もしUDが、自分で好みを選択できるように、プロフィールを変更したと
したら? こうして自分の好むプロジェクトを設定できて、そのプロジェクトで
使用可能な宿題が無ければ、次のプロジェクトを選ぶ。」
− それも良い考えです。でも現在のシステムはそのようには動きません。
これも改善要求に加えておきましょう。
「ここUDの不思議なことには、UDの姉妹であるWCGプロジェクトと同じものを
処理できる、最低でもどうしても必要とされるシステムでは、HPF(ロゼッタ)
を処理できない。」
− 256MBを要求するのは、フォーラムのメンバによってマシン上で遭遇した
問題が、メモリが少ないという痕跡を残すせいで、ベータテスト中に決められた
ものです。
--
Robby Brewer
>>647 投稿日:2005年10月4日(月)午後7時10分(標準時)