直った。結果から言うと
>>554が神でした。
mds関連を調べて対処した所、OSがイタヅラしてた影響みたい。
User/Library/Preferences/com.apple.japaneseAnalysys/AppleContextualKKC.index
にあるAdaptiveMapとInputHistory.plistを削除して再起動、
$ sudo mdutil -E /
をしたら戻りました。
>>550さんもやってみるといいかもね。
>>564さんはIntelみたいだから関係ないかも。