労働基準法違反 Part 2

質問なんですが
ある日、８時間勤務＋残業３時間の給与算定時間＝11.75
ある日、３時間早上がりの５時間勤務の給与算定時間＝5
合計16.75時間なんですが
うちの会社は、残業の時の２５％増しを無視して16.00時間で計算しています。
前日残業した後に残業分の時間早上がりしたら残業は無かったことになるのでしょうか？