ATOK16についてカタリーナ・ビット

Mac OSX 10.3.9で、ATOK16はver1.0です。
立ち上げたり、再起動すると、環境設定が元に戻って、
登録しておいた環境(「ユーザ設定」など)に変更しても反映されず、
また、登録辞書も使用可能な状態なはず（使っている辞書セットの中に含まれ、
チェックボックスに印がある）なのに候補に出てきません。
しばらくいじっていると、突然全ての設定が変更後になり、辞書も反映されます。

何が原因で、設定を保ち続けるにはどう対処したらよいでしょうか？