I・O GV-BCTV5/PCI Part3なの

＞SP2までならシャットダウンできるけど SP3だと、どうしてもできない

Windowsアップデートで　Q329170 入れたんじゃない？
Q329170　をアンインストールすれば ”設定を保存しています”でモタることはなくなるよ。