在日は憲法上の日本国民なのだが

【韓国政府（しかも当時独裁）にも責任があったとしても、日本の責任がなくなるわけじゃない。
　そもそも、国民指定という内政上の基本を他国の言いなりでやったなどという言い訳はアホ杉　な件】

アホ杉なヤツのために、単純明快な例で説明しよう。

・安倍が金正日と会談して「韓国系の在日は全て抹殺すべし」という約束をした。
・これは金正日の要望であったわけだが、実行したのは日本政府。

ウヨ１：「抹殺は金正日の要望。恨むんなら金正日を恨め（日本政府には責任がない）」
ウヨ２：「金正日は朝鮮人の代表。つまり、在日自身が自分たちの抹殺を望んだ」

↑これら、どちらかでも正しいと思うか？
件の要求（正式な要求かどうさえ不明だが）もこれと同じ。
そもそも、国民が政府と違う意思を持ってることなど当たり前でしかないわけだが、
それ以前に、かの政権は半島の韓国人にとっても悪名高い独裁政権。
国民の意思が反映されてるなら独裁政権にならない。

結局、http://tmp6.2ch.net/test/read.cgi/asia/1166541049/846
で言ってるようなウヨ的な差別思想に毒されてるだけだろ？

いずれにせよ、憲法上の問題をどうこうできる話ではないがな。
＃主権者は固有の権利（憲法１５条など）であり、また、当人の意思で左右されない（人権宣言Ｂ規約）。
＃それゆえ、たとえ、当人が望んだとしても、主権剥奪（国籍剥奪および、その前の参政権剥奪）は不当。